RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 HRCP23327 699 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-211ENST00000489450 RFC5P40937 340 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-211ENST00000489450 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-211ENST00000489450 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-211ENST00000489450 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa6.78□□□□□ -1.32
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RABGGTB-211ENST00000489450 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-211ENST00000489450 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-211ENST00000489450 PPP2R2DQ66LE6 453 aa6.77□□□□□ -1.33
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RABGGTB-211ENST00000489450 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
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RABGGTB-211ENST00000489450 MTMR2Q13614 643 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-211ENST00000489450 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
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RABGGTB-211ENST00000489450 C14orf37Q86TY3 774 aa6.75□□□□□ -1.33
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RABGGTB-211ENST00000489450 CFAP99D6REC4 459 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-211ENST00000489450 NR1I2O75469 434 aa6.73□□□□□ -1.33
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RABGGTB-211ENST00000489450 FLIIQ13045 1269 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-211ENST00000489450 MCM6Q14566 821 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-211ENST00000489450 Q3C1V9 767 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-211ENST00000489450 TSC1Q92574 1164 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-211ENST00000489450 THAP11Q96EK4 314 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-211ENST00000489450 MTRQ99707 1265 aa6.72□□□□□ -1.33
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RABGGTB-211ENST00000489450 TLL1O43897 1013 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-211ENST00000489450 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM259Q4ZIN3 620 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-211ENST00000489450 BRICD5Q6PL45 260 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-211ENST00000489450 RETREG3Q86VR2 466 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-211ENST00000489450 PRR7Q8TB68 274 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-211ENST00000489450 SNRKQ9NRH2 765 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-211ENST00000489450 BANK1Q8NDB2 785 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-211ENST00000489450 USP17L8P0C7I0 530 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-211ENST00000489450 CTDSPL2Q05D32 466 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-211ENST00000489450 TJAP1Q5JTD0 557 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-211ENST00000489450 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF516Q92618 1163 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-211ENST00000489450 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-211ENST00000489450 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-211ENST00000489450 ZPR1O75312 459 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-211ENST00000489450 Q6ZNB5 142 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-211ENST00000489450 MTMR14Q8NCE2 650 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-211ENST00000489450 SPSB2Q99619 263 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-211ENST00000489450 IL21Q9HBE4 155 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-211ENST00000489450 ERICH6Q7L0X2 663 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-211ENST00000489450 LRRN4Q8WUT4 740 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-211ENST00000489450 PRDM9Q9NQV7 894 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-211ENST00000489450 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RABGGTB-211ENST00000489450 ADH1BP00325 375 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGGTB-211ENST00000489450 UBTFP17480 764 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
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RABGGTB-211ENST00000489450 MSS51Q4VC12 460 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-211ENST00000489450 NKX2-3Q8TAU0 364 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-211ENST00000489450 CLUAP1Q96AJ1 413 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-211ENST00000489450 POM121Q96HA1 1249 aa6.65□□□□□ -1.34
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RABGGTB-211ENST00000489450 DESI1Q6ICB0 168 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-211ENST00000489450 ZMYND15Q9H091 742 aa6.64□□□□□ -1.35
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RABGGTB-211ENST00000489450 LYPD8Q6UX82 237 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-211ENST00000489450 EPS8L1Q8TE68 723 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-211ENST00000489450 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-211ENST00000489450 COG6Q9Y2V7 657 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-211ENST00000489450 DXOO77932 396 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
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RABGGTB-211ENST00000489450 TRIM34Q9BYJ4 488 aa6.62□□□□□ -1.35
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RABGGTB-211ENST00000489450 SOCS7O14512 581 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-211ENST00000489450 GFRA3O60609 400 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-211ENST00000489450 S1PR4O95977 384 aa6.61□□□□□ -1.35
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RABGGTB-211ENST00000489450 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-211ENST00000489450 RAD21O60216 631 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-211ENST00000489450 NUDT12Q9BQG2 462 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-211ENST00000489450 MAP10Q9P2G4 905 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-211ENST00000489450 A6NJR5 290 aa6.59□□□□□ -1.35
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RABGGTB-211ENST00000489450 F12P00748 615 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-211ENST00000489450 CCNYL3P0C7X3 344 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-211ENST00000489450 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-211ENST00000489450 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-211ENST00000489450 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-211ENST00000489450 GPR37L1O60883 481 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-211ENST00000489450 CTHP32929 405 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-211ENST00000489450 ABL2P42684 1182 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-211ENST00000489450 TRAF7Q6Q0C0 670 aa6.58□□□□□ -1.36
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