RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 C1orf167Q5SNV9 1468 aa30.24■■■□□ 2.43
ACTB-211ENST00000480301 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa30.2■■■□□ 2.43
ACTB-211ENST00000480301 NBPF1Q3BBV0 1214 aa30.2■■■□□ 2.43
ACTB-211ENST00000480301 POGKQ9P215 609 aa30.2■■■□□ 2.43
ACTB-211ENST00000480301 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP30.19■■■□□ 2.42
ACTB-211ENST00000480301 ORAI2Q96SN7 254 aa30.18■■■□□ 2.42
ACTB-211ENST00000480301 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa30.18■■■□□ 2.42
ACTB-211ENST00000480301 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
ACTB-211ENST00000480301 PHLPP1O60346 1717 aa30.16■■■□□ 2.42
ACTB-211ENST00000480301 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.41
ACTB-211ENST00000480301 NUTM2FA1L443 756 aa30.12■■■□□ 2.41
ACTB-211ENST00000480301 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
ACTB-211ENST00000480301 DISP3Q9P2K9 1392 aa30.11■■■□□ 2.41
ACTB-211ENST00000480301 ESCO1Q5FWF5 840 aa30.09■■■□□ 2.41
ACTB-211ENST00000480301 TONSLQ96HA7 1378 aa30.09■■■□□ 2.41
ACTB-211ENST00000480301 JCADQ9P266 1359 aa30.09■■■□□ 2.41
ACTB-211ENST00000480301 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
ACTB-211ENST00000480301 NBPF8Q3BBV2 869 aa30.08■■■□□ 2.41
ACTB-211ENST00000480301 NHSL1Q5SYE7 1610 aa30.07■■■□□ 2.4
ACTB-211ENST00000480301 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
ACTB-211ENST00000480301 FMN2Q9NZ56 1722 aa30.07■■■□□ 2.4
ACTB-211ENST00000480301 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
ACTB-211ENST00000480301 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
ACTB-211ENST00000480301 ADGRB2O60241 1585 aa30.04■■■□□ 2.4
ACTB-211ENST00000480301 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa30.02■■■□□ 2.4
ACTB-211ENST00000480301 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.4
ACTB-211ENST00000480301 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
ACTB-211ENST00000480301 WASLO00401 505 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
ACTB-211ENST00000480301 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
ACTB-211ENST00000480301 FOXO3O43524 673 aa29.98■■■□□ 2.39
ACTB-211ENST00000480301 NPHP3Q7Z494 1330 aa29.96■■■□□ 2.39
ACTB-211ENST00000480301 CLSPNQ9HAW4 1339 aa29.96■■■□□ 2.39
ACTB-211ENST00000480301 ANKARQ7Z5J8 1434 aa29.96■■■□□ 2.39
ACTB-211ENST00000480301 GPRASP1Q5JY77 1395 aa29.95■■■□□ 2.39
ACTB-211ENST00000480301 PHF8Q9UPP1 1060 aa29.95■■■□□ 2.39
ACTB-211ENST00000480301 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa29.95■■■□□ 2.38
ACTB-211ENST00000480301 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.38
ACTB-211ENST00000480301 PRR36Q9H6K5 1346 aa29.94■■■□□ 2.38
ACTB-211ENST00000480301 SHPRHQ149N8 1683 aa29.93■■■□□ 2.38
ACTB-211ENST00000480301 USP32Q8NFA0 1604 aa29.93■■■□□ 2.38
ACTB-211ENST00000480301 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
ACTB-211ENST00000480301 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
ACTB-211ENST00000480301 PNPLA6Q8IY17 1366 aa29.91■■■□□ 2.38
ACTB-211ENST00000480301 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
ACTB-211ENST00000480301 CDK19Q9BWU1 502 aa29.91■■■□□ 2.38
ACTB-211ENST00000480301 PXDNQ92626 1479 aa29.91■■■□□ 2.38
ACTB-211ENST00000480301 TULP4Q9NRJ4 1543 aa29.91■■■□□ 2.38
ACTB-211ENST00000480301 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
ACTB-211ENST00000480301 KIF1AQ12756 1690 aa29.88■■■□□ 2.37
ACTB-211ENST00000480301 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa29.88■■■□□ 2.37
ACTB-211ENST00000480301 LRP6O75581 1613 aa29.88■■■□□ 2.37
ACTB-211ENST00000480301 RALGAPBQ86X10 1494 aa29.87■■■□□ 2.37
ACTB-211ENST00000480301 KRT28Q7Z3Y7 464 aa29.86■■■□□ 2.37
ACTB-211ENST00000480301 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
ACTB-211ENST00000480301 CARD11Q9BXL7 1154 aa29.86■■■□□ 2.37
ACTB-211ENST00000480301 ILDR2Q71H61 639 aa29.85■■■□□ 2.37
ACTB-211ENST00000480301 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
ACTB-211ENST00000480301 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
ACTB-211ENST00000480301 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
ACTB-211ENST00000480301 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
ACTB-211ENST00000480301 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
ACTB-211ENST00000480301 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa29.84■■■□□ 2.37
ACTB-211ENST00000480301 ATP7BP35670 1465 aa29.83■■■□□ 2.37
ACTB-211ENST00000480301 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa29.8■■■□□ 2.36
ACTB-211ENST00000480301 QRICH2Q9H0J4 1663 aa29.8■■■□□ 2.36
ACTB-211ENST00000480301 PSME1Q06323 249 aa29.8■■■□□ 2.36
ACTB-211ENST00000480301 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
ACTB-211ENST00000480301 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
ACTB-211ENST00000480301 CABP2Q9NPB3 220 aa29.77■■■□□ 2.36
ACTB-211ENST00000480301 CCDC61Q9Y6R9 512 aa29.77■■■□□ 2.36
ACTB-211ENST00000480301 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
ACTB-211ENST00000480301 SBNO1A3KN83 1393 aa29.75■■■□□ 2.35
ACTB-211ENST00000480301 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
ACTB-211ENST00000480301 PLEKHG3A1L390 1219 aa29.73■■■□□ 2.35
ACTB-211ENST00000480301 EVC2Q86UK5 1308 aa29.72■■■□□ 2.35
ACTB-211ENST00000480301 TNS3Q68CZ2 1445 aa29.71■■■□□ 2.35
ACTB-211ENST00000480301 ITSN1Q15811 1721 aa29.7■■■□□ 2.34
ACTB-211ENST00000480301 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa29.69■■■□□ 2.34
ACTB-211ENST00000480301 POTEAQ6S8J7 498 aa29.69■■■□□ 2.34
ACTB-211ENST00000480301 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
ACTB-211ENST00000480301 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa29.68■■■□□ 2.34
ACTB-211ENST00000480301 ADAMTS2O95450 1211 aa29.68■■■□□ 2.34
ACTB-211ENST00000480301 ACEP12821 1306 aa29.68■■■□□ 2.34
ACTB-211ENST00000480301 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa29.66■■■□□ 2.34
ACTB-211ENST00000480301 LMOD2Q6P5Q4 547 aa29.65■■■□□ 2.34
ACTB-211ENST00000480301 C8orf37Q96NL8 207 aa29.65■■■□□ 2.34
ACTB-211ENST00000480301 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
ACTB-211ENST00000480301 ARHGEF10O15013 1369 aa29.64■■■□□ 2.34
ACTB-211ENST00000480301 CABP1Q9NZU7 370 aa29.64■■■□□ 2.34
ACTB-211ENST00000480301 AFF2P51816 1311 aa29.63■■■□□ 2.33
ACTB-211ENST00000480301 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa29.62■■■□□ 2.33
ACTB-211ENST00000480301 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
ACTB-211ENST00000480301 CABLES1Q8TDN4 633 aa29.61■■■□□ 2.33
ACTB-211ENST00000480301 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
ACTB-211ENST00000480301 NGLY1Q96IV0 654 aa29.6■■■□□ 2.33
ACTB-211ENST00000480301 TESK2Q96S53 571 aa29.6■■■□□ 2.33
ACTB-211ENST00000480301 ALS2Q96Q42 1657 aa29.57■■■□□ 2.32
ACTB-211ENST00000480301 USP47Q96K76 1375 aa29.56■■■□□ 2.32
ACTB-211ENST00000480301 PLEKHG5O94827 1062 aa29.56■■■□□ 2.32
ACTB-211ENST00000480301 ATAD2Q6PL18 1390 aa29.55■■■□□ 2.32
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