RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466037.6

HOXB-AS3-204, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 522 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa28.55■■■□□ 2.16
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PRAM1Q96QH2 718 aa28.54■■■□□ 2.16
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TRAK1Q9UPV9 953 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXB-AS3-204ENST00000466037 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXB-AS3-204ENST00000466037 JCADQ9P266 1359 aa28.52■■■□□ 2.16
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.52■■■□□ 2.16
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
HOXB-AS3-204ENST00000466037 L3MBTL2Q969R5 705 aa28.48■■■□□ 2.15
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ESCO1Q5FWF5 840 aa28.47■■■□□ 2.15
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ORAI2Q96SN7 254 aa28.47■■■□□ 2.15
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NUTM2FA1L443 756 aa28.46■■■□□ 2.15
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NHSL1Q5SYE7 1610 aa28.41■■■□□ 2.14
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa28.41■■■□□ 2.14
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FMN2Q9NZ56 1722 aa28.36■■■□□ 2.13
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NBPF1Q3BBV0 1214 aa28.36■■■□□ 2.13
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TONSLQ96HA7 1378 aa28.36■■■□□ 2.13
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 PHF8Q9UPP1 1060 aa28.29■■■□□ 2.12
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ANKARQ7Z5J8 1434 aa28.28■■■□□ 2.12
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 ADAMTS2O95450 1211 aa28.14■■■□□ 2.1
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 CARD11Q9BXL7 1154 aa28.13■■■□□ 2.09
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 CLSPNQ9HAW4 1339 aa28.11■■■□□ 2.09
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 TNS3Q68CZ2 1445 aa28.09■■■□□ 2.09
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CCDC61Q9Y6R9 512 aa28.09■■■□□ 2.09
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 ITSN1Q15811 1721 aa28.07■■■□□ 2.08
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PLEKHG5O94827 1062 aa28.03■■■□□ 2.08
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa28.01■■■□□ 2.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ACEP12821 1306 aa27.99■■■□□ 2.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PLEKHG3A1L390 1219 aa27.99■■■□□ 2.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa27.99■■■□□ 2.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RXRBP28702 533 aa27.96■■■□□ 2.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CABLES1Q8TDN4 633 aa27.96■■■□□ 2.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 USP21Q9UK80 565 aa27.96■■■□□ 2.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa27.96■■■□□ 2.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa27.93■■■□□ 2.06
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