RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa34.77■■■■□ 3.16
SMKR1-201ENST00000462322 ILDR2Q71H61 639 aa34.76■■■■□ 3.16
SMKR1-201ENST00000462322 ADGRB1O14514 1584 aa34.75■■■■□ 3.15
SMKR1-201ENST00000462322 PRAM1Q96QH2 718 aa34.73■■■■□ 3.15
SMKR1-201ENST00000462322 ORAI2Q96SN7 254 aa34.73■■■■□ 3.15
SMKR1-201ENST00000462322 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP34.71■■■■□ 3.15
SMKR1-201ENST00000462322 SIN3AQ96ST3 1273 aa34.71■■■■□ 3.15
SMKR1-201ENST00000462322 POGKQ9P215 609 aa34.71■■■■□ 3.15
SMKR1-201ENST00000462322 NHSL1Q5SYE7 1610 aa34.7■■■■□ 3.15
SMKR1-201ENST00000462322 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP34.7■■■■□ 3.15
SMKR1-201ENST00000462322 TRAK1Q9UPV9 953 aa34.7■■■■□ 3.15
SMKR1-201ENST00000462322 DLC1Q96QB1 1528 aa34.7■■■■□ 3.14
SMKR1-201ENST00000462322 NUTM2FA1L443 756 aa34.67■■■■□ 3.14
SMKR1-201ENST00000462322 NEUROD1Q13562 356 aa34.66■■■■□ 3.14
SMKR1-201ENST00000462322 ESCO1Q5FWF5 840 aa34.66■■■■□ 3.14
SMKR1-201ENST00000462322 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP34.64■■■■□ 3.14
SMKR1-201ENST00000462322 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa34.63■■■■□ 3.13
SMKR1-201ENST00000462322 L3MBTL2Q969R5 705 aa34.62■■■■□ 3.13
SMKR1-201ENST00000462322 SHPRHQ149N8 1683 aa34.6■■■■□ 3.13
SMKR1-201ENST00000462322 FMN2Q9NZ56 1722 aa34.59■■■■□ 3.13
SMKR1-201ENST00000462322 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa34.56■■■■□ 3.12
SMKR1-201ENST00000462322 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP34.55■■■■□ 3.12
SMKR1-201ENST00000462322 NPHP3Q7Z494 1330 aa34.55■■■■□ 3.12
SMKR1-201ENST00000462322 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP34.54■■■■□ 3.12
SMKR1-201ENST00000462322 FOXO3O43524 673 aa34.53■■■■□ 3.12
SMKR1-201ENST00000462322 NBPF1Q3BBV0 1214 aa34.53■■■■□ 3.12
SMKR1-201ENST00000462322 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP34.53■■■■□ 3.12
SMKR1-201ENST00000462322 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP34.53■■■■□ 3.12
SMKR1-201ENST00000462322 LRP6O75581 1613 aa34.52■■■■□ 3.12
SMKR1-201ENST00000462322 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP34.52■■■■□ 3.12
SMKR1-201ENST00000462322 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP34.52■■■■□ 3.12
SMKR1-201ENST00000462322 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP34.52■■■■□ 3.12
SMKR1-201ENST00000462322 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP34.52■■■■□ 3.12
SMKR1-201ENST00000462322 PNPLA6Q8IY17 1366 aa34.5■■■■□ 3.11
SMKR1-201ENST00000462322 ADGRB2O60241 1585 aa34.49■■■■□ 3.11
SMKR1-201ENST00000462322 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP34.49■■■■□ 3.11
SMKR1-201ENST00000462322 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP34.47■■■■□ 3.11
SMKR1-201ENST00000462322 PHF8Q9UPP1 1060 aa34.45■■■■□ 3.11
SMKR1-201ENST00000462322 KIF1AQ12756 1690 aa34.44■■■■□ 3.1
SMKR1-201ENST00000462322 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP34.44■■■■□ 3.1
SMKR1-201ENST00000462322 PXDNQ92626 1479 aa34.44■■■■□ 3.1
SMKR1-201ENST00000462322 WASLO00401 505 aaPredicted RBP34.43■■■■□ 3.1
SMKR1-201ENST00000462322 ANKARQ7Z5J8 1434 aa34.43■■■■□ 3.1
SMKR1-201ENST00000462322 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP34.41■■■■□ 3.1
SMKR1-201ENST00000462322 SOCS7O14512 581 aa34.41■■■■□ 3.1
SMKR1-201ENST00000462322 POTEAQ6S8J7 498 aa34.38■■■■□ 3.09
SMKR1-201ENST00000462322 USP32Q8NFA0 1604 aa34.37■■■■□ 3.09
SMKR1-201ENST00000462322 KRT28Q7Z3Y7 464 aa34.37■■■■□ 3.09
SMKR1-201ENST00000462322 TONSLQ96HA7 1378 aa34.36■■■■□ 3.09
SMKR1-201ENST00000462322 TULP4Q9NRJ4 1543 aa34.35■■■■□ 3.09
SMKR1-201ENST00000462322 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa34.35■■■■□ 3.09
SMKR1-201ENST00000462322 PRR36Q9H6K5 1346 aa34.34■■■■□ 3.09
SMKR1-201ENST00000462322 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa34.33■■■■□ 3.09
SMKR1-201ENST00000462322 PSME1Q06323 249 aa34.32■■■■□ 3.08
SMKR1-201ENST00000462322 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP34.31■■■■□ 3.08
SMKR1-201ENST00000462322 ADAMTS2O95450 1211 aa34.31■■■■□ 3.08
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP34.31■■■■□ 3.08
SMKR1-201ENST00000462322 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP34.31■■■■□ 3.08
SMKR1-201ENST00000462322 NBPF8Q3BBV2 869 aa34.3■■■■□ 3.08
SMKR1-201ENST00000462322 CDK19Q9BWU1 502 aa34.3■■■■□ 3.08
SMKR1-201ENST00000462322 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP34.3■■■■□ 3.08
SMKR1-201ENST00000462322 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa34.3■■■■□ 3.08
SMKR1-201ENST00000462322 C8orf37Q96NL8 207 aa34.29■■■■□ 3.08
SMKR1-201ENST00000462322 PCGF6Q9BYE7 350 aa34.29■■■■□ 3.08
SMKR1-201ENST00000462322 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
SMKR1-201ENST00000462322 AFF2P51816 1311 aa34.27■■■■□ 3.08
SMKR1-201ENST00000462322 ATP7BP35670 1465 aa34.23■■■■□ 3.07
SMKR1-201ENST00000462322 NGLY1Q96IV0 654 aa34.23■■■■□ 3.07
SMKR1-201ENST00000462322 SBNO1A3KN83 1393 aa34.23■■■■□ 3.07
SMKR1-201ENST00000462322 TNS3Q68CZ2 1445 aa34.22■■■■□ 3.07
SMKR1-201ENST00000462322 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP34.22■■■■□ 3.07
SMKR1-201ENST00000462322 GPRASP1Q5JY77 1395 aa34.22■■■■□ 3.07
SMKR1-201ENST00000462322 LMOD2Q6P5Q4 547 aa34.21■■■■□ 3.07
SMKR1-201ENST00000462322 QRICH2Q9H0J4 1663 aa34.19■■■■□ 3.06
SMKR1-201ENST00000462322 ITSN1Q15811 1721 aa34.18■■■■□ 3.06
SMKR1-201ENST00000462322 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
SMKR1-201ENST00000462322 CCDC61Q9Y6R9 512 aa34.17■■■■□ 3.06
SMKR1-201ENST00000462322 ARHGEF10O15013 1369 aa34.15■■■■□ 3.06
SMKR1-201ENST00000462322 CARD11Q9BXL7 1154 aa34.14■■■■□ 3.06
SMKR1-201ENST00000462322 PLEKHG5O94827 1062 aa34.13■■■■□ 3.05
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SMKR1-201ENST00000462322 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP34.12■■■■□ 3.05
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SMKR1-201ENST00000462322 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP34.1■■■■□ 3.05
SMKR1-201ENST00000462322 RXRBP28702 533 aa34.1■■■■□ 3.05
SMKR1-201ENST00000462322 CABLES1Q8TDN4 633 aa34.1■■■■□ 3.05
SMKR1-201ENST00000462322 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa34.09■■■■□ 3.05
SMKR1-201ENST00000462322 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP34.09■■■■□ 3.05
SMKR1-201ENST00000462322 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP34.09■■■■□ 3.05
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SMKR1-201ENST00000462322 EVC2Q86UK5 1308 aa34.08■■■■□ 3.05
SMKR1-201ENST00000462322 PLEKHG3A1L390 1219 aa34.08■■■■□ 3.05
SMKR1-201ENST00000462322 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP34.08■■■■□ 3.05
SMKR1-201ENST00000462322 ACEP12821 1306 aa34.07■■■■□ 3.05
SMKR1-201ENST00000462322 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP34.07■■■■□ 3.04
SMKR1-201ENST00000462322 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP34.05■■■■□ 3.04
SMKR1-201ENST00000462322 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa34.04■■■■□ 3.04
SMKR1-201ENST00000462322 CLSPNQ9HAW4 1339 aa34.03■■■■□ 3.04
SMKR1-201ENST00000462322 ALS2Q96Q42 1657 aa34.03■■■■□ 3.04
SMKR1-201ENST00000462322 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP34■■■■□ 3.03
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