RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428541.1

AC079305.1-201, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AC079305.1, Length 499 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC079305.1-201ENST00000428541 JCADQ9P266 1359 aa40.3■■■■■ 4.04
AC079305.1-201ENST00000428541 DLC1Q96QB1 1528 aa40.27■■■■■ 4.04
AC079305.1-201ENST00000428541 SIN3AQ96ST3 1273 aa40.26■■■■■ 4.04
AC079305.1-201ENST00000428541 NHSL1Q5SYE7 1610 aa40.26■■■■■ 4.04
AC079305.1-201ENST00000428541 PRAM1Q96QH2 718 aa40.25■■■■■ 4.03
AC079305.1-201ENST00000428541 ORAI2Q96SN7 254 aa40.25■■■■■ 4.03
AC079305.1-201ENST00000428541 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP40.22■■■■■ 4.03
AC079305.1-201ENST00000428541 TRAK1Q9UPV9 953 aa40.22■■■■■ 4.03
AC079305.1-201ENST00000428541 ILDR2Q71H61 639 aa40.21■■■■■ 4.03
AC079305.1-201ENST00000428541 POGKQ9P215 609 aa40.21■■■■■ 4.03
AC079305.1-201ENST00000428541 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP40.2■■■■■ 4.03
AC079305.1-201ENST00000428541 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP40.19■■■■■ 4.02
AC079305.1-201ENST00000428541 NEUROD1Q13562 356 aa40.18■■■■■ 4.02
AC079305.1-201ENST00000428541 L3MBTL2Q969R5 705 aa40.17■■■■■ 4.02
AC079305.1-201ENST00000428541 NUTM2FA1L443 756 aa40.15■■■■■ 4.02
AC079305.1-201ENST00000428541 ESCO1Q5FWF5 840 aa40.15■■■■■ 4.02
AC079305.1-201ENST00000428541 FMN2Q9NZ56 1722 aa40.14■■■■■ 4.02
AC079305.1-201ENST00000428541 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa40.14■■■■■ 4.02
AC079305.1-201ENST00000428541 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP40.14■■■■■ 4.02
AC079305.1-201ENST00000428541 SHPRHQ149N8 1683 aa40.13■■■■■ 4.01
AC079305.1-201ENST00000428541 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa40.13■■■■■ 4.01
AC079305.1-201ENST00000428541 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP40.08■■■■■ 4.01
AC079305.1-201ENST00000428541 NBPF1Q3BBV0 1214 aa40.05■■■■■ 4
AC079305.1-201ENST00000428541 ADGRB2O60241 1585 aa40.04■■■■■ 4
AC079305.1-201ENST00000428541 NPHP3Q7Z494 1330 aa40.03■■■■■ 4
AC079305.1-201ENST00000428541 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP40.02■■■■■ 4
AC079305.1-201ENST00000428541 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP40.02■■■■■ 4
AC079305.1-201ENST00000428541 FOXO3O43524 673 aa40.01■■■■■ 4
AC079305.1-201ENST00000428541 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP40.01■■■■■ 4
AC079305.1-201ENST00000428541 LRP6O75581 1613 aa40.01■■■■■ 4
AC079305.1-201ENST00000428541 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP40■■■■□ 3.99
AC079305.1-201ENST00000428541 PNPLA6Q8IY17 1366 aa39.99■■■■□ 3.99
AC079305.1-201ENST00000428541 KIF1AQ12756 1690 aa39.96■■■■□ 3.99
AC079305.1-201ENST00000428541 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP39.95■■■■□ 3.99
AC079305.1-201ENST00000428541 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP39.95■■■■□ 3.99
AC079305.1-201ENST00000428541 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP39.95■■■■□ 3.99
AC079305.1-201ENST00000428541 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP39.95■■■■□ 3.99
AC079305.1-201ENST00000428541 PXDNQ92626 1479 aa39.94■■■■□ 3.98
AC079305.1-201ENST00000428541 ANKARQ7Z5J8 1434 aa39.94■■■■□ 3.98
AC079305.1-201ENST00000428541 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP39.93■■■■□ 3.98
AC079305.1-201ENST00000428541 WASLO00401 505 aaPredicted RBP39.92■■■■□ 3.98
AC079305.1-201ENST00000428541 PHF8Q9UPP1 1060 aa39.92■■■■□ 3.98
AC079305.1-201ENST00000428541 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP39.91■■■■□ 3.98
AC079305.1-201ENST00000428541 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP39.91■■■■□ 3.98
AC079305.1-201ENST00000428541 USP32Q8NFA0 1604 aa39.9■■■■□ 3.98
AC079305.1-201ENST00000428541 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa39.87■■■■□ 3.97
AC079305.1-201ENST00000428541 TULP4Q9NRJ4 1543 aa39.86■■■■□ 3.97
AC079305.1-201ENST00000428541 TONSLQ96HA7 1378 aa39.85■■■■□ 3.97
AC079305.1-201ENST00000428541 KRT28Q7Z3Y7 464 aa39.83■■■■□ 3.97
AC079305.1-201ENST00000428541 PRR36Q9H6K5 1346 aa39.83■■■■□ 3.97
AC079305.1-201ENST00000428541 NBPF8Q3BBV2 869 aa39.81■■■■□ 3.96
AC079305.1-201ENST00000428541 SOCS7O14512 581 aa39.8■■■■□ 3.96
AC079305.1-201ENST00000428541 POTEAQ6S8J7 498 aa39.8■■■■□ 3.96
AC079305.1-201ENST00000428541 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa39.8■■■■□ 3.96
AC079305.1-201ENST00000428541 PCGF6Q9BYE7 350 aa39.8■■■■□ 3.96
AC079305.1-201ENST00000428541 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP39.8■■■■□ 3.96
AC079305.1-201ENST00000428541 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP39.8■■■■□ 3.96
AC079305.1-201ENST00000428541 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP39.79■■■■□ 3.96
AC079305.1-201ENST00000428541 PSME1Q06323 249 aa39.77■■■■□ 3.96
AC079305.1-201ENST00000428541 CDK19Q9BWU1 502 aa39.77■■■■□ 3.96
AC079305.1-201ENST00000428541 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa39.76■■■■□ 3.96
AC079305.1-201ENST00000428541 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP39.73■■■■□ 3.95
AC079305.1-201ENST00000428541 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP39.73■■■■□ 3.95
AC079305.1-201ENST00000428541 ATP7BP35670 1465 aa39.71■■■■□ 3.95
AC079305.1-201ENST00000428541 ADAMTS2O95450 1211 aa39.71■■■■□ 3.95
AC079305.1-201ENST00000428541 C8orf37Q96NL8 207 aa39.7■■■■□ 3.95
AC079305.1-201ENST00000428541 SBNO1A3KN83 1393 aa39.7■■■■□ 3.95
AC079305.1-201ENST00000428541 QRICH2Q9H0J4 1663 aa39.68■■■■□ 3.94
AC079305.1-201ENST00000428541 GPRASP1Q5JY77 1395 aa39.68■■■■□ 3.94
AC079305.1-201ENST00000428541 AFF2P51816 1311 aa39.67■■■■□ 3.94
AC079305.1-201ENST00000428541 TNS3Q68CZ2 1445 aa39.67■■■■□ 3.94
AC079305.1-201ENST00000428541 ITSN1Q15811 1721 aa39.67■■■■□ 3.94
AC079305.1-201ENST00000428541 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP39.65■■■■□ 3.94
AC079305.1-201ENST00000428541 NGLY1Q96IV0 654 aa39.63■■■■□ 3.93
AC079305.1-201ENST00000428541 CCDC61Q9Y6R9 512 aa39.63■■■■□ 3.93
AC079305.1-201ENST00000428541 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP39.61■■■■□ 3.93
AC079305.1-201ENST00000428541 RALGAPBQ86X10 1494 aa39.61■■■■□ 3.93
AC079305.1-201ENST00000428541 ARHGEF10O15013 1369 aa39.59■■■■□ 3.93
AC079305.1-201ENST00000428541 LMOD2Q6P5Q4 547 aa39.59■■■■□ 3.93
AC079305.1-201ENST00000428541 CARD11Q9BXL7 1154 aa39.59■■■■□ 3.93
AC079305.1-201ENST00000428541 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa39.58■■■■□ 3.93
AC079305.1-201ENST00000428541 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP39.57■■■■□ 3.93
AC079305.1-201ENST00000428541 CABP2Q9NPB3 220 aa39.56■■■■□ 3.92
AC079305.1-201ENST00000428541 CLSPNQ9HAW4 1339 aa39.55■■■■□ 3.92
AC079305.1-201ENST00000428541 PLEKHG3A1L390 1219 aa39.54■■■■□ 3.92
AC079305.1-201ENST00000428541 EVC2Q86UK5 1308 aa39.53■■■■□ 3.92
AC079305.1-201ENST00000428541 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP39.52■■■■□ 3.92
AC079305.1-201ENST00000428541 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP39.51■■■■□ 3.92
AC079305.1-201ENST00000428541 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP39.51■■■■□ 3.92
AC079305.1-201ENST00000428541 ACEP12821 1306 aa39.5■■■■□ 3.91
AC079305.1-201ENST00000428541 CABLES1Q8TDN4 633 aa39.5■■■■□ 3.91
AC079305.1-201ENST00000428541 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP39.49■■■■□ 3.91
AC079305.1-201ENST00000428541 ALS2Q96Q42 1657 aa39.48■■■■□ 3.91
AC079305.1-201ENST00000428541 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP39.48■■■■□ 3.91
AC079305.1-201ENST00000428541 PLEKHG5O94827 1062 aa39.48■■■■□ 3.91
AC079305.1-201ENST00000428541 RXRBP28702 533 aa39.48■■■■□ 3.91
AC079305.1-201ENST00000428541 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP39.48■■■■□ 3.91
AC079305.1-201ENST00000428541 USP21Q9UK80 565 aa39.48■■■■□ 3.91
AC079305.1-201ENST00000428541 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa39.48■■■■□ 3.91
AC079305.1-201ENST00000428541 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa39.43■■■■□ 3.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms