RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426965.1

HOXD-AS2-201, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 927 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRAK1Q9UPV9 953 aa36.11■■■■□ 3.37
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa36.1■■■■□ 3.37
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PHLPP1O60346 1717 aa36.07■■■■□ 3.36
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP36.06■■■■□ 3.36
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP36.06■■■■□ 3.36
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NBPF1Q3BBV0 1214 aa36.06■■■■□ 3.36
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ORAI2Q96SN7 254 aa36.04■■■■□ 3.36
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa36.04■■■■□ 3.36
HOXD-AS2-201ENST00000426965 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP36.04■■■■□ 3.36
HOXD-AS2-201ENST00000426965 POGKQ9P215 609 aa36.03■■■■□ 3.36
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP36■■■■□ 3.35
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DISP3Q9P2K9 1392 aa35.99■■■■□ 3.35
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NUTM2FA1L443 756 aa35.97■■■■□ 3.35
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP35.97■■■■□ 3.35
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NHSL1Q5SYE7 1610 aa35.96■■■■□ 3.35
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FMN2Q9NZ56 1722 aa35.94■■■■□ 3.34
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ESCO1Q5FWF5 840 aa35.93■■■■□ 3.34
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP35.93■■■■□ 3.34
HOXD-AS2-201ENST00000426965 JCADQ9P266 1359 aa35.92■■■■□ 3.34
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NBPF8Q3BBV2 869 aa35.91■■■■□ 3.34
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP35.91■■■■□ 3.34
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP35.9■■■■□ 3.34
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TONSLQ96HA7 1378 aa35.89■■■■□ 3.34
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ADGRB2O60241 1585 aa35.89■■■■□ 3.34
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa35.87■■■■□ 3.33
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP35.83■■■■□ 3.33
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP35.81■■■■□ 3.32
HOXD-AS2-201ENST00000426965 WASLO00401 505 aaPredicted RBP35.8■■■■□ 3.32
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FOXO3O43524 673 aa35.8■■■■□ 3.32
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP35.79■■■■□ 3.32
HOXD-AS2-201ENST00000426965 USP32Q8NFA0 1604 aa35.79■■■■□ 3.32
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SHPRHQ149N8 1683 aa35.78■■■■□ 3.32
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NPHP3Q7Z494 1330 aa35.78■■■■□ 3.32
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ANKARQ7Z5J8 1434 aa35.77■■■■□ 3.32
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRR36Q9H6K5 1346 aa35.77■■■■□ 3.32
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PXDNQ92626 1479 aa35.76■■■■□ 3.32
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa35.76■■■■□ 3.31
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP35.76■■■■□ 3.31
HOXD-AS2-201ENST00000426965 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP35.74■■■■□ 3.31
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PHF8Q9UPP1 1060 aa35.74■■■■□ 3.31
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GPRASP1Q5JY77 1395 aa35.74■■■■□ 3.31
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PNPLA6Q8IY17 1366 aa35.74■■■■□ 3.31
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LRP6O75581 1613 aa35.73■■■■□ 3.31
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TULP4Q9NRJ4 1543 aa35.73■■■■□ 3.31
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CLSPNQ9HAW4 1339 aa35.72■■■■□ 3.31
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KIF1AQ12756 1690 aa35.71■■■■□ 3.31
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.31
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ILDR2Q71H61 639 aa35.7■■■■□ 3.31
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP35.69■■■■□ 3.3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CDK19Q9BWU1 502 aa35.69■■■■□ 3.3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RALGAPBQ86X10 1494 aa35.68■■■■□ 3.3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP35.68■■■■□ 3.3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa35.67■■■■□ 3.3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ATP7BP35670 1465 aa35.65■■■■□ 3.3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRT28Q7Z3Y7 464 aa35.64■■■■□ 3.3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 QRICH2Q9H0J4 1663 aa35.62■■■■□ 3.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CARD11Q9BXL7 1154 aa35.62■■■■□ 3.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP35.59■■■■□ 3.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa35.57■■■■□ 3.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PSME1Q06323 249 aa35.56■■■■□ 3.28
HOXD-AS2-201ENST00000426965 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP35.55■■■■□ 3.28
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP35.55■■■■□ 3.28
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa35.55■■■■□ 3.28
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CABP2Q9NPB3 220 aa35.54■■■■□ 3.28
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCDC61Q9Y6R9 512 aa35.52■■■■□ 3.28
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SBNO1A3KN83 1393 aa35.51■■■■□ 3.28
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa35.5■■■■□ 3.27
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TNS3Q68CZ2 1445 aa35.49■■■■□ 3.27
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ITSN1Q15811 1721 aa35.49■■■■□ 3.27
HOXD-AS2-201ENST00000426965 POTEAQ6S8J7 498 aa35.48■■■■□ 3.27
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PLEKHG3A1L390 1219 aa35.47■■■■□ 3.27
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EVC2Q86UK5 1308 aa35.47■■■■□ 3.27
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ADAMTS2O95450 1211 aa35.46■■■■□ 3.27
HOXD-AS2-201ENST00000426965 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP35.45■■■■□ 3.27
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP35.44■■■■□ 3.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa35.43■■■■□ 3.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ACEP12821 1306 aa35.43■■■■□ 3.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa35.42■■■■□ 3.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C8orf37Q96NL8 207 aa35.42■■■■□ 3.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LMOD2Q6P5Q4 547 aa35.4■■■■□ 3.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ARHGEF10O15013 1369 aa35.38■■■■□ 3.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AFF2P51816 1311 aa35.38■■■■□ 3.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CABLES1Q8TDN4 633 aa35.37■■■■□ 3.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CABP1Q9NZU7 370 aa35.37■■■■□ 3.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa35.35■■■■□ 3.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP35.35■■■■□ 3.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ALS2Q96Q42 1657 aa35.35■■■■□ 3.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP35.34■■■■□ 3.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PLEKHG5O94827 1062 aa35.33■■■■□ 3.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NGLY1Q96IV0 654 aa35.33■■■■□ 3.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TESK2Q96S53 571 aa35.33■■■■□ 3.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 USP47Q96K76 1375 aa35.29■■■■□ 3.24
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP35.28■■■■□ 3.24
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