RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 POGKQ9P215 609 aa36.07■■■■□ 3.36
HTATSF1-202ENST00000425695 PHLPP1O60346 1717 aa36.07■■■■□ 3.36
HTATSF1-202ENST00000425695 C1orf167Q5SNV9 1468 aa36.04■■■■□ 3.36
HTATSF1-202ENST00000425695 DISP3Q9P2K9 1392 aa36.03■■■■□ 3.36
HTATSF1-202ENST00000425695 NUTM2FA1L443 756 aa36.03■■■■□ 3.36
HTATSF1-202ENST00000425695 NBPF1Q3BBV0 1214 aa36.01■■■■□ 3.36
HTATSF1-202ENST00000425695 ORAI2Q96SN7 254 aa36.01■■■■□ 3.36
HTATSF1-202ENST00000425695 DLC1Q96QB1 1528 aa35.99■■■■□ 3.35
HTATSF1-202ENST00000425695 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP35.99■■■■□ 3.35
HTATSF1-202ENST00000425695 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa35.98■■■■□ 3.35
HTATSF1-202ENST00000425695 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP35.96■■■■□ 3.35
HTATSF1-202ENST00000425695 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa35.94■■■■□ 3.34
HTATSF1-202ENST00000425695 ESCO1Q5FWF5 840 aa35.94■■■■□ 3.34
HTATSF1-202ENST00000425695 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP35.94■■■■□ 3.34
HTATSF1-202ENST00000425695 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP35.92■■■■□ 3.34
HTATSF1-202ENST00000425695 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP35.92■■■■□ 3.34
HTATSF1-202ENST00000425695 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP35.91■■■■□ 3.34
HTATSF1-202ENST00000425695 TONSLQ96HA7 1378 aa35.89■■■■□ 3.34
HTATSF1-202ENST00000425695 JCADQ9P266 1359 aa35.89■■■■□ 3.34
HTATSF1-202ENST00000425695 NHSL1Q5SYE7 1610 aa35.87■■■■□ 3.33
HTATSF1-202ENST00000425695 FMN2Q9NZ56 1722 aa35.87■■■■□ 3.33
HTATSF1-202ENST00000425695 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP35.85■■■■□ 3.33
HTATSF1-202ENST00000425695 NBPF8Q3BBV2 869 aa35.84■■■■□ 3.33
HTATSF1-202ENST00000425695 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP35.81■■■■□ 3.32
HTATSF1-202ENST00000425695 FOXO3O43524 673 aa35.8■■■■□ 3.32
HTATSF1-202ENST00000425695 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP35.8■■■■□ 3.32
HTATSF1-202ENST00000425695 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa35.79■■■■□ 3.32
HTATSF1-202ENST00000425695 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP35.79■■■■□ 3.32
HTATSF1-202ENST00000425695 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP35.77■■■■□ 3.32
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HTATSF1-202ENST00000425695 ADGRB2O60241 1585 aa35.76■■■■□ 3.31
HTATSF1-202ENST00000425695 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.31
HTATSF1-202ENST00000425695 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP35.75■■■■□ 3.31
HTATSF1-202ENST00000425695 NPHP3Q7Z494 1330 aa35.75■■■■□ 3.31
HTATSF1-202ENST00000425695 PHF8Q9UPP1 1060 aa35.74■■■■□ 3.31
HTATSF1-202ENST00000425695 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP35.72■■■■□ 3.31
HTATSF1-202ENST00000425695 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP35.72■■■■□ 3.31
HTATSF1-202ENST00000425695 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP35.72■■■■□ 3.31
HTATSF1-202ENST00000425695 SHPRHQ149N8 1683 aa35.72■■■■□ 3.31
HTATSF1-202ENST00000425695 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa35.71■■■■□ 3.31
HTATSF1-202ENST00000425695 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP35.7■■■■□ 3.31
HTATSF1-202ENST00000425695 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa35.69■■■■□ 3.3
HTATSF1-202ENST00000425695 PRR36Q9H6K5 1346 aa35.68■■■■□ 3.3
HTATSF1-202ENST00000425695 ILDR2Q71H61 639 aa35.68■■■■□ 3.3
HTATSF1-202ENST00000425695 CDK19Q9BWU1 502 aa35.68■■■■□ 3.3
HTATSF1-202ENST00000425695 USP32Q8NFA0 1604 aa35.68■■■■□ 3.3
HTATSF1-202ENST00000425695 ANKARQ7Z5J8 1434 aa35.67■■■■□ 3.3
HTATSF1-202ENST00000425695 PNPLA6Q8IY17 1366 aa35.66■■■■□ 3.3
HTATSF1-202ENST00000425695 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP35.65■■■■□ 3.3
HTATSF1-202ENST00000425695 KIF1AQ12756 1690 aa35.65■■■■□ 3.3
HTATSF1-202ENST00000425695 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
HTATSF1-202ENST00000425695 KRT28Q7Z3Y7 464 aa35.64■■■■□ 3.3
HTATSF1-202ENST00000425695 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
HTATSF1-202ENST00000425695 PXDNQ92626 1479 aa35.64■■■■□ 3.3
HTATSF1-202ENST00000425695 LRP6O75581 1613 aa35.64■■■■□ 3.3
HTATSF1-202ENST00000425695 TULP4Q9NRJ4 1543 aa35.63■■■■□ 3.29
HTATSF1-202ENST00000425695 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP35.62■■■■□ 3.29
HTATSF1-202ENST00000425695 CARD11Q9BXL7 1154 aa35.61■■■■□ 3.29
HTATSF1-202ENST00000425695 PSME1Q06323 249 aa35.6■■■■□ 3.29
HTATSF1-202ENST00000425695 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP35.6■■■■□ 3.29
HTATSF1-202ENST00000425695 CLSPNQ9HAW4 1339 aa35.59■■■■□ 3.29
HTATSF1-202ENST00000425695 GPRASP1Q5JY77 1395 aa35.58■■■■□ 3.29
HTATSF1-202ENST00000425695 QRICH2Q9H0J4 1663 aa35.58■■■■□ 3.29
HTATSF1-202ENST00000425695 RALGAPBQ86X10 1494 aa35.55■■■■□ 3.28
HTATSF1-202ENST00000425695 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP35.55■■■■□ 3.28
HTATSF1-202ENST00000425695 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
HTATSF1-202ENST00000425695 CABP2Q9NPB3 220 aa35.53■■■■□ 3.28
HTATSF1-202ENST00000425695 ATP7BP35670 1465 aa35.53■■■■□ 3.28
HTATSF1-202ENST00000425695 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa35.52■■■■□ 3.28
HTATSF1-202ENST00000425695 ADAMTS2O95450 1211 aa35.51■■■■□ 3.28
HTATSF1-202ENST00000425695 LMOD2Q6P5Q4 547 aa35.5■■■■□ 3.27
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC61Q9Y6R9 512 aa35.49■■■■□ 3.27
HTATSF1-202ENST00000425695 PLEKHG5O94827 1062 aa35.47■■■■□ 3.27
HTATSF1-202ENST00000425695 ITSN1Q15811 1721 aa35.46■■■■□ 3.27
HTATSF1-202ENST00000425695 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa35.46■■■■□ 3.27
HTATSF1-202ENST00000425695 POTEAQ6S8J7 498 aa35.45■■■■□ 3.27
HTATSF1-202ENST00000425695 C8orf37Q96NL8 207 aa35.45■■■■□ 3.27
HTATSF1-202ENST00000425695 EVC2Q86UK5 1308 aa35.45■■■■□ 3.27
HTATSF1-202ENST00000425695 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP35.43■■■■□ 3.26
HTATSF1-202ENST00000425695 TNS3Q68CZ2 1445 aa35.43■■■■□ 3.26
HTATSF1-202ENST00000425695 SBNO1A3KN83 1393 aa35.43■■■■□ 3.26
HTATSF1-202ENST00000425695 ACEP12821 1306 aa35.4■■■■□ 3.26
HTATSF1-202ENST00000425695 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP35.4■■■■□ 3.26
HTATSF1-202ENST00000425695 PLEKHG3A1L390 1219 aa35.39■■■■□ 3.26
HTATSF1-202ENST00000425695 NGLY1Q96IV0 654 aa35.39■■■■□ 3.26
HTATSF1-202ENST00000425695 AFF2P51816 1311 aa35.38■■■■□ 3.25
HTATSF1-202ENST00000425695 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa35.38■■■■□ 3.25
HTATSF1-202ENST00000425695 CABLES1Q8TDN4 633 aa35.38■■■■□ 3.25
HTATSF1-202ENST00000425695 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa35.38■■■■□ 3.25
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP35.36■■■■□ 3.25
HTATSF1-202ENST00000425695 CABP1Q9NZU7 370 aa35.36■■■■□ 3.25
HTATSF1-202ENST00000425695 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP35.35■■■■□ 3.25
HTATSF1-202ENST00000425695 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP35.34■■■■□ 3.25
HTATSF1-202ENST00000425695 ARHGEF10O15013 1369 aa35.34■■■■□ 3.25
HTATSF1-202ENST00000425695 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP35.33■■■■□ 3.25
HTATSF1-202ENST00000425695 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa35.31■■■■□ 3.24
HTATSF1-202ENST00000425695 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa35.29■■■■□ 3.24
HTATSF1-202ENST00000425695 ALS2Q96Q42 1657 aa35.26■■■■□ 3.23
HTATSF1-202ENST00000425695 NUTM2GQ5VZR2 741 aa35.25■■■■□ 3.23
HTATSF1-202ENST00000425695 USP21Q9UK80 565 aa35.23■■■■□ 3.23
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