RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 ORAI2Q96SN7 254 aa30.42■■■□□ 2.46
SH3BP4-204ENST00000416021 C1orf167Q5SNV9 1468 aa30.42■■■□□ 2.46
SH3BP4-204ENST00000416021 ADGRB1O14514 1584 aa30.41■■■□□ 2.46
SH3BP4-204ENST00000416021 NUTM2FA1L443 756 aa30.39■■■□□ 2.46
SH3BP4-204ENST00000416021 NBPF1Q3BBV0 1214 aa30.39■■■□□ 2.46
SH3BP4-204ENST00000416021 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
SH3BP4-204ENST00000416021 ESCO1Q5FWF5 840 aa30.37■■■□□ 2.45
SH3BP4-204ENST00000416021 KNDC1Q76NI1 1749 aa30.36■■■□□ 2.45
SH3BP4-204ENST00000416021 DLC1Q96QB1 1528 aa30.34■■■□□ 2.45
SH3BP4-204ENST00000416021 JCADQ9P266 1359 aa30.33■■■□□ 2.45
SH3BP4-204ENST00000416021 PHLPP1O60346 1717 aa30.31■■■□□ 2.44
SH3BP4-204ENST00000416021 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
SH3BP4-204ENST00000416021 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
SH3BP4-204ENST00000416021 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
SH3BP4-204ENST00000416021 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa30.29■■■□□ 2.44
SH3BP4-204ENST00000416021 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
SH3BP4-204ENST00000416021 FOXO3O43524 673 aa30.25■■■□□ 2.43
SH3BP4-204ENST00000416021 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
SH3BP4-204ENST00000416021 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
SH3BP4-204ENST00000416021 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
SH3BP4-204ENST00000416021 NBPF8Q3BBV2 869 aa30.24■■■□□ 2.43
SH3BP4-204ENST00000416021 TONSLQ96HA7 1378 aa30.24■■■□□ 2.43
SH3BP4-204ENST00000416021 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
SH3BP4-204ENST00000416021 WASLO00401 505 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
SH3BP4-204ENST00000416021 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa30.22■■■□□ 2.43
SH3BP4-204ENST00000416021 NPHP3Q7Z494 1330 aa30.21■■■□□ 2.43
SH3BP4-204ENST00000416021 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa30.2■■■□□ 2.43
SH3BP4-204ENST00000416021 ILDR2Q71H61 639 aa30.18■■■□□ 2.42
SH3BP4-204ENST00000416021 PHF8Q9UPP1 1060 aa30.18■■■□□ 2.42
SH3BP4-204ENST00000416021 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
SH3BP4-204ENST00000416021 NHSL1Q5SYE7 1610 aa30.16■■■□□ 2.42
SH3BP4-204ENST00000416021 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
SH3BP4-204ENST00000416021 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
SH3BP4-204ENST00000416021 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
SH3BP4-204ENST00000416021 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
SH3BP4-204ENST00000416021 CDK19Q9BWU1 502 aa30.14■■■□□ 2.42
SH3BP4-204ENST00000416021 FMN2Q9NZ56 1722 aa30.13■■■□□ 2.41
SH3BP4-204ENST00000416021 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa30.13■■■□□ 2.41
SH3BP4-204ENST00000416021 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
SH3BP4-204ENST00000416021 KRT28Q7Z3Y7 464 aa30.12■■■□□ 2.41
SH3BP4-204ENST00000416021 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
SH3BP4-204ENST00000416021 PRR36Q9H6K5 1346 aa30.11■■■□□ 2.41
SH3BP4-204ENST00000416021 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
SH3BP4-204ENST00000416021 PNPLA6Q8IY17 1366 aa30.11■■■□□ 2.41
SH3BP4-204ENST00000416021 ANKARQ7Z5J8 1434 aa30.11■■■□□ 2.41
SH3BP4-204ENST00000416021 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
SH3BP4-204ENST00000416021 ADGRB2O60241 1585 aa30.09■■■□□ 2.41
SH3BP4-204ENST00000416021 PSME1Q06323 249 aa30.09■■■□□ 2.41
SH3BP4-204ENST00000416021 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
SH3BP4-204ENST00000416021 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
SH3BP4-204ENST00000416021 CLSPNQ9HAW4 1339 aa30.07■■■□□ 2.4
SH3BP4-204ENST00000416021 CARD11Q9BXL7 1154 aa30.06■■■□□ 2.4
SH3BP4-204ENST00000416021 PXDNQ92626 1479 aa30.06■■■□□ 2.4
SH3BP4-204ENST00000416021 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa30.04■■■□□ 2.4
SH3BP4-204ENST00000416021 SHPRHQ149N8 1683 aa30.04■■■□□ 2.4
SH3BP4-204ENST00000416021 LRP6O75581 1613 aa30.04■■■□□ 2.4
SH3BP4-204ENST00000416021 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
SH3BP4-204ENST00000416021 GPRASP1Q5JY77 1395 aa30.03■■■□□ 2.4
SH3BP4-204ENST00000416021 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa30.02■■■□□ 2.4
SH3BP4-204ENST00000416021 TULP4Q9NRJ4 1543 aa30.01■■■□□ 2.4
SH3BP4-204ENST00000416021 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC61Q9Y6R9 512 aa30.01■■■□□ 2.39
SH3BP4-204ENST00000416021 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
SH3BP4-204ENST00000416021 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa30■■■□□ 2.39
SH3BP4-204ENST00000416021 CABP2Q9NPB3 220 aa29.99■■■□□ 2.39
SH3BP4-204ENST00000416021 USP32Q8NFA0 1604 aa29.99■■■□□ 2.39
SH3BP4-204ENST00000416021 ADAMTS2O95450 1211 aa29.98■■■□□ 2.39
SH3BP4-204ENST00000416021 KIF1AQ12756 1690 aa29.98■■■□□ 2.39
SH3BP4-204ENST00000416021 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
SH3BP4-204ENST00000416021 POTEAQ6S8J7 498 aa29.97■■■□□ 2.39
SH3BP4-204ENST00000416021 LMOD2Q6P5Q4 547 aa29.95■■■□□ 2.39
SH3BP4-204ENST00000416021 SBNO1A3KN83 1393 aa29.94■■■□□ 2.38
SH3BP4-204ENST00000416021 PLEKHG3A1L390 1219 aa29.94■■■□□ 2.38
SH3BP4-204ENST00000416021 C8orf37Q96NL8 207 aa29.94■■■□□ 2.38
SH3BP4-204ENST00000416021 EVC2Q86UK5 1308 aa29.94■■■□□ 2.38
SH3BP4-204ENST00000416021 RALGAPBQ86X10 1494 aa29.93■■■□□ 2.38
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
SH3BP4-204ENST00000416021 ATP7BP35670 1465 aa29.93■■■□□ 2.38
SH3BP4-204ENST00000416021 NGLY1Q96IV0 654 aa29.91■■■□□ 2.38
SH3BP4-204ENST00000416021 ACEP12821 1306 aa29.9■■■□□ 2.38
SH3BP4-204ENST00000416021 AFF2P51816 1311 aa29.89■■■□□ 2.38
SH3BP4-204ENST00000416021 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
SH3BP4-204ENST00000416021 TNS3Q68CZ2 1445 aa29.88■■■□□ 2.37
SH3BP4-204ENST00000416021 PLEKHG5O94827 1062 aa29.87■■■□□ 2.37
SH3BP4-204ENST00000416021 CABP1Q9NZU7 370 aa29.87■■■□□ 2.37
SH3BP4-204ENST00000416021 CABLES1Q8TDN4 633 aa29.86■■■□□ 2.37
SH3BP4-204ENST00000416021 ARHGEF10O15013 1369 aa29.85■■■□□ 2.37
SH3BP4-204ENST00000416021 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
SH3BP4-204ENST00000416021 QRICH2Q9H0J4 1663 aa29.83■■■□□ 2.37
SH3BP4-204ENST00000416021 SOCS7O14512 581 aa29.83■■■□□ 2.37
SH3BP4-204ENST00000416021 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
SH3BP4-204ENST00000416021 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
SH3BP4-204ENST00000416021 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa29.82■■■□□ 2.36
SH3BP4-204ENST00000416021 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa29.81■■■□□ 2.36
SH3BP4-204ENST00000416021 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
SH3BP4-204ENST00000416021 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
SH3BP4-204ENST00000416021 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa29.78■■■□□ 2.36
SH3BP4-204ENST00000416021 USP21Q9UK80 565 aa29.78■■■□□ 2.36
SH3BP4-204ENST00000416021 RXRBP28702 533 aa29.76■■■□□ 2.35
SH3BP4-204ENST00000416021 TESK2Q96S53 571 aa29.74■■■□□ 2.35
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