RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411961.6

ANKRD54-204, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ANKRD54, Length 946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-204ENST00000411961 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
ANKRD54-204ENST00000411961 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
ANKRD54-204ENST00000411961 SHPRHQ149N8 1683 aa28.61■■■□□ 2.17
ANKRD54-204ENST00000411961 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
ANKRD54-204ENST00000411961 STAC3Q96MF2 364 aa28.6■■■□□ 2.17
ANKRD54-204ENST00000411961 ORAI2Q96SN7 254 aa28.6■■■□□ 2.17
ANKRD54-204ENST00000411961 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
ANKRD54-204ENST00000411961 SIRT1Q96EB6 747 aa28.59■■■□□ 2.17
ANKRD54-204ENST00000411961 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa28.58■■■□□ 2.17
ANKRD54-204ENST00000411961 ESCO1Q5FWF5 840 aa28.57■■■□□ 2.16
ANKRD54-204ENST00000411961 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa28.57■■■□□ 2.16
ANKRD54-204ENST00000411961 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
ANKRD54-204ENST00000411961 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
ANKRD54-204ENST00000411961 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
ANKRD54-204ENST00000411961 NUTM2FA1L443 756 aa28.54■■■□□ 2.16
ANKRD54-204ENST00000411961 POGKQ9P215 609 aa28.54■■■□□ 2.16
ANKRD54-204ENST00000411961 PRAM1Q96QH2 718 aa28.51■■■□□ 2.15
ANKRD54-204ENST00000411961 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.5■■■□□ 2.15
ANKRD54-204ENST00000411961 LRP6O75581 1613 aa28.5■■■□□ 2.15
ANKRD54-204ENST00000411961 POTEAQ6S8J7 498 aa28.49■■■□□ 2.15
ANKRD54-204ENST00000411961 TRAK1Q9UPV9 953 aa28.48■■■□□ 2.15
ANKRD54-204ENST00000411961 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
ANKRD54-204ENST00000411961 NPHP3Q7Z494 1330 aa28.47■■■□□ 2.15
ANKRD54-204ENST00000411961 PNPLA6Q8IY17 1366 aa28.46■■■□□ 2.15
ANKRD54-204ENST00000411961 FMN2Q9NZ56 1722 aa28.45■■■□□ 2.14
ANKRD54-204ENST00000411961 DLC1Q96QB1 1528 aa28.44■■■□□ 2.14
ANKRD54-204ENST00000411961 FOXO3O43524 673 aa28.44■■■□□ 2.14
ANKRD54-204ENST00000411961 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
ANKRD54-204ENST00000411961 ADGRB1O14514 1584 aa28.43■■■□□ 2.14
ANKRD54-204ENST00000411961 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
ANKRD54-204ENST00000411961 C8orf37Q96NL8 207 aa28.37■■■□□ 2.13
ANKRD54-204ENST00000411961 KIF1AQ12756 1690 aa28.36■■■□□ 2.13
ANKRD54-204ENST00000411961 ADAMTS2O95450 1211 aa28.36■■■□□ 2.13
ANKRD54-204ENST00000411961 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
ANKRD54-204ENST00000411961 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
ANKRD54-204ENST00000411961 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
ANKRD54-204ENST00000411961 PHF8Q9UPP1 1060 aa28.35■■■□□ 2.13
ANKRD54-204ENST00000411961 AFF2P51816 1311 aa28.34■■■□□ 2.13
ANKRD54-204ENST00000411961 PXDNQ92626 1479 aa28.34■■■□□ 2.13
ANKRD54-204ENST00000411961 KRT28Q7Z3Y7 464 aa28.32■■■□□ 2.12
ANKRD54-204ENST00000411961 NGLY1Q96IV0 654 aa28.32■■■□□ 2.12
ANKRD54-204ENST00000411961 NEUROD1Q13562 356 aa28.31■■■□□ 2.12
ANKRD54-204ENST00000411961 PSME1Q06323 249 aa28.3■■■□□ 2.12
ANKRD54-204ENST00000411961 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.3■■■□□ 2.12
ANKRD54-204ENST00000411961 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa28.29■■■□□ 2.12
ANKRD54-204ENST00000411961 ADGRB2O60241 1585 aa28.29■■■□□ 2.12
ANKRD54-204ENST00000411961 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
ANKRD54-204ENST00000411961 ANKARQ7Z5J8 1434 aa28.28■■■□□ 2.12
ANKRD54-204ENST00000411961 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
ANKRD54-204ENST00000411961 WASLO00401 505 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
ANKRD54-204ENST00000411961 RXRBP28702 533 aa28.27■■■□□ 2.12
ANKRD54-204ENST00000411961 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
ANKRD54-204ENST00000411961 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.12
ANKRD54-204ENST00000411961 L3MBTL2Q969R5 705 aa28.26■■■□□ 2.11
ANKRD54-204ENST00000411961 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa28.25■■■□□ 2.11
ANKRD54-204ENST00000411961 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa28.24■■■□□ 2.11
ANKRD54-204ENST00000411961 NBPF1Q3BBV0 1214 aa28.24■■■□□ 2.11
ANKRD54-204ENST00000411961 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
ANKRD54-204ENST00000411961 USP32Q8NFA0 1604 aa28.22■■■□□ 2.11
ANKRD54-204ENST00000411961 LMOD2Q6P5Q4 547 aa28.21■■■□□ 2.11
ANKRD54-204ENST00000411961 TULP4Q9NRJ4 1543 aa28.2■■■□□ 2.1
ANKRD54-204ENST00000411961 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
ANKRD54-204ENST00000411961 USP21Q9UK80 565 aa28.19■■■□□ 2.1
ANKRD54-204ENST00000411961 GPRASP1Q5JY77 1395 aa28.17■■■□□ 2.1
ANKRD54-204ENST00000411961 TNS3Q68CZ2 1445 aa28.17■■■□□ 2.1
ANKRD54-204ENST00000411961 PRR36Q9H6K5 1346 aa28.17■■■□□ 2.1
ANKRD54-204ENST00000411961 SBNO1A3KN83 1393 aa28.16■■■□□ 2.1
ANKRD54-204ENST00000411961 PLEKHG5O94827 1062 aa28.16■■■□□ 2.1
ANKRD54-204ENST00000411961 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
ANKRD54-204ENST00000411961 CDK19Q9BWU1 502 aa28.16■■■□□ 2.1
ANKRD54-204ENST00000411961 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
ANKRD54-204ENST00000411961 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
ANKRD54-204ENST00000411961 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
ANKRD54-204ENST00000411961 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
ANKRD54-204ENST00000411961 ARHGEF10O15013 1369 aa28.12■■■□□ 2.09
ANKRD54-204ENST00000411961 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
ANKRD54-204ENST00000411961 ITSN1Q15811 1721 aa28.12■■■□□ 2.09
ANKRD54-204ENST00000411961 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
ANKRD54-204ENST00000411961 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
ANKRD54-204ENST00000411961 CABLES1Q8TDN4 633 aa28.09■■■□□ 2.09
ANKRD54-204ENST00000411961 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
ANKRD54-204ENST00000411961 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa28.07■■■□□ 2.08
ANKRD54-204ENST00000411961 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
ANKRD54-204ENST00000411961 CCDC61Q9Y6R9 512 aa28.06■■■□□ 2.08
ANKRD54-204ENST00000411961 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
ANKRD54-204ENST00000411961 ATP7BP35670 1465 aa28.06■■■□□ 2.08
ANKRD54-204ENST00000411961 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
ANKRD54-204ENST00000411961 TONSLQ96HA7 1378 aa28.03■■■□□ 2.08
ANKRD54-204ENST00000411961 QRICH2Q9H0J4 1663 aa28.03■■■□□ 2.08
ANKRD54-204ENST00000411961 BCL9LQ86UU0 1499 aa28.02■■■□□ 2.08
ANKRD54-204ENST00000411961 ATRNO75882 1429 aa28.01■■■□□ 2.08
ANKRD54-204ENST00000411961 UNC5CLQ8IV45 518 aa28■■■□□ 2.07
ANKRD54-204ENST00000411961 RGS12O14924 1447 aa28■■■□□ 2.07
ANKRD54-204ENST00000411961 ACEP12821 1306 aa27.99■■■□□ 2.07
ANKRD54-204ENST00000411961 CABP2Q9NPB3 220 aa27.99■■■□□ 2.07
ANKRD54-204ENST00000411961 ALS2Q96Q42 1657 aa27.98■■■□□ 2.07
ANKRD54-204ENST00000411961 NBPF8Q3BBV2 869 aa27.98■■■□□ 2.07
ANKRD54-204ENST00000411961 PLEKHG3A1L390 1219 aa27.97■■■□□ 2.07
ANKRD54-204ENST00000411961 ABCA3Q99758 1704 aa27.97■■■□□ 2.07
ANKRD54-204ENST00000411961 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa27.97■■■□□ 2.07
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