RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402613.3

VSTM2A-202, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 2A, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VSTM2A, Length 1,076 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2A-202ENST00000402613 ORAI2Q96SN7 254 aa34.61■■■■□ 3.13
VSTM2A-202ENST00000402613 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP34.6■■■■□ 3.13
VSTM2A-202ENST00000402613 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa34.57■■■■□ 3.13
VSTM2A-202ENST00000402613 ADGRB1O14514 1584 aa34.55■■■■□ 3.12
VSTM2A-202ENST00000402613 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP34.55■■■■□ 3.12
VSTM2A-202ENST00000402613 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa34.55■■■■□ 3.12
VSTM2A-202ENST00000402613 PRAM1Q96QH2 718 aa34.54■■■■□ 3.12
VSTM2A-202ENST00000402613 NHSL1Q5SYE7 1610 aa34.54■■■■□ 3.12
VSTM2A-202ENST00000402613 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP34.53■■■■□ 3.12
VSTM2A-202ENST00000402613 ESCO1Q5FWF5 840 aa34.51■■■■□ 3.12
VSTM2A-202ENST00000402613 TRAK1Q9UPV9 953 aa34.5■■■■□ 3.11
VSTM2A-202ENST00000402613 NUTM2FA1L443 756 aa34.49■■■■□ 3.11
VSTM2A-202ENST00000402613 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP34.49■■■■□ 3.11
VSTM2A-202ENST00000402613 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP34.49■■■■□ 3.11
VSTM2A-202ENST00000402613 POGKQ9P215 609 aa34.49■■■■□ 3.11
VSTM2A-202ENST00000402613 DLC1Q96QB1 1528 aa34.49■■■■□ 3.11
VSTM2A-202ENST00000402613 SOCS7O14512 581 aa34.48■■■■□ 3.11
VSTM2A-202ENST00000402613 SHPRHQ149N8 1683 aa34.46■■■■□ 3.11
VSTM2A-202ENST00000402613 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP34.46■■■■□ 3.11
VSTM2A-202ENST00000402613 LRP6O75581 1613 aa34.44■■■■□ 3.1
VSTM2A-202ENST00000402613 SIN3AQ96ST3 1273 aa34.43■■■■□ 3.1
VSTM2A-202ENST00000402613 NPHP3Q7Z494 1330 aa34.4■■■■□ 3.1
VSTM2A-202ENST00000402613 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP34.4■■■■□ 3.1
VSTM2A-202ENST00000402613 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP34.4■■■■□ 3.1
VSTM2A-202ENST00000402613 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP34.4■■■■□ 3.1
VSTM2A-202ENST00000402613 PNPLA6Q8IY17 1366 aa34.39■■■■□ 3.1
VSTM2A-202ENST00000402613 FOXO3O43524 673 aa34.39■■■■□ 3.1
VSTM2A-202ENST00000402613 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP34.39■■■■□ 3.1
VSTM2A-202ENST00000402613 L3MBTL2Q969R5 705 aa34.38■■■■□ 3.09
VSTM2A-202ENST00000402613 FMN2Q9NZ56 1722 aa34.37■■■■□ 3.09
VSTM2A-202ENST00000402613 POTEAQ6S8J7 498 aa34.36■■■■□ 3.09
VSTM2A-202ENST00000402613 NEUROD1Q13562 356 aa34.35■■■■□ 3.09
VSTM2A-202ENST00000402613 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP34.33■■■■□ 3.09
VSTM2A-202ENST00000402613 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP34.32■■■■□ 3.09
VSTM2A-202ENST00000402613 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP34.32■■■■□ 3.08
VSTM2A-202ENST00000402613 NBPF1Q3BBV0 1214 aa34.32■■■■□ 3.08
VSTM2A-202ENST00000402613 PXDNQ92626 1479 aa34.3■■■■□ 3.08
VSTM2A-202ENST00000402613 PHF8Q9UPP1 1060 aa34.29■■■■□ 3.08
VSTM2A-202ENST00000402613 ADGRB2O60241 1585 aa34.28■■■■□ 3.08
VSTM2A-202ENST00000402613 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa34.27■■■■□ 3.08
VSTM2A-202ENST00000402613 ANKARQ7Z5J8 1434 aa34.25■■■■□ 3.07
VSTM2A-202ENST00000402613 WASLO00401 505 aaPredicted RBP34.25■■■■□ 3.07
VSTM2A-202ENST00000402613 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP34.24■■■■□ 3.07
VSTM2A-202ENST00000402613 KRT28Q7Z3Y7 464 aa34.22■■■■□ 3.07
VSTM2A-202ENST00000402613 KIF1AQ12756 1690 aa34.22■■■■□ 3.07
VSTM2A-202ENST00000402613 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP34.21■■■■□ 3.07
VSTM2A-202ENST00000402613 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP34.2■■■■□ 3.07
VSTM2A-202ENST00000402613 ADAMTS2O95450 1211 aa34.19■■■■□ 3.06
VSTM2A-202ENST00000402613 C8orf37Q96NL8 207 aa34.19■■■■□ 3.06
VSTM2A-202ENST00000402613 PRR36Q9H6K5 1346 aa34.19■■■■□ 3.06
VSTM2A-202ENST00000402613 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa34.18■■■■□ 3.06
VSTM2A-202ENST00000402613 USP32Q8NFA0 1604 aa34.18■■■■□ 3.06
VSTM2A-202ENST00000402613 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP34.18■■■■□ 3.06
VSTM2A-202ENST00000402613 AFF2P51816 1311 aa34.17■■■■□ 3.06
VSTM2A-202ENST00000402613 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa34.17■■■■□ 3.06
VSTM2A-202ENST00000402613 PSME1Q06323 249 aa34.16■■■■□ 3.06
VSTM2A-202ENST00000402613 TULP4Q9NRJ4 1543 aa34.15■■■■□ 3.06
VSTM2A-202ENST00000402613 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP34.15■■■■□ 3.06
VSTM2A-202ENST00000402613 NGLY1Q96IV0 654 aa34.12■■■■□ 3.05
VSTM2A-202ENST00000402613 CDK19Q9BWU1 502 aa34.11■■■■□ 3.05
VSTM2A-202ENST00000402613 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP34.09■■■■□ 3.05
VSTM2A-202ENST00000402613 SBNO1A3KN83 1393 aa34.09■■■■□ 3.05
VSTM2A-202ENST00000402613 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP34.08■■■■□ 3.05
VSTM2A-202ENST00000402613 TNS3Q68CZ2 1445 aa34.06■■■■□ 3.04
VSTM2A-202ENST00000402613 NBPF8Q3BBV2 869 aa34.06■■■■□ 3.04
VSTM2A-202ENST00000402613 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP34.05■■■■□ 3.04
VSTM2A-202ENST00000402613 ATP7BP35670 1465 aa34.04■■■■□ 3.04
VSTM2A-202ENST00000402613 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa34.04■■■■□ 3.04
VSTM2A-202ENST00000402613 GPRASP1Q5JY77 1395 aa34.03■■■■□ 3.04
VSTM2A-202ENST00000402613 TONSLQ96HA7 1378 aa34.03■■■■□ 3.04
VSTM2A-202ENST00000402613 RXRBP28702 533 aa34.03■■■■□ 3.04
VSTM2A-202ENST00000402613 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP34.03■■■■□ 3.04
VSTM2A-202ENST00000402613 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP34.02■■■■□ 3.04
VSTM2A-202ENST00000402613 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP34.02■■■■□ 3.04
VSTM2A-202ENST00000402613 LMOD2Q6P5Q4 547 aa34.01■■■■□ 3.03
VSTM2A-202ENST00000402613 CCDC61Q9Y6R9 512 aa34■■■■□ 3.03
VSTM2A-202ENST00000402613 ARHGEF10O15013 1369 aa33.99■■■■□ 3.03
VSTM2A-202ENST00000402613 USP21Q9UK80 565 aa33.99■■■■□ 3.03
VSTM2A-202ENST00000402613 CABLES1Q8TDN4 633 aa33.97■■■■□ 3.03
VSTM2A-202ENST00000402613 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP33.95■■■■□ 3.03
VSTM2A-202ENST00000402613 PLEKHG5O94827 1062 aa33.94■■■■□ 3.02
VSTM2A-202ENST00000402613 PLEKHG3A1L390 1219 aa33.93■■■■□ 3.02
VSTM2A-202ENST00000402613 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP33.93■■■■□ 3.02
VSTM2A-202ENST00000402613 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP33.93■■■■□ 3.02
VSTM2A-202ENST00000402613 CABP2Q9NPB3 220 aa33.92■■■■□ 3.02
VSTM2A-202ENST00000402613 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP33.9■■■■□ 3.02
VSTM2A-202ENST00000402613 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP33.9■■■■□ 3.02
VSTM2A-202ENST00000402613 ACEP12821 1306 aa33.9■■■■□ 3.02
VSTM2A-202ENST00000402613 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP33.9■■■■□ 3.02
VSTM2A-202ENST00000402613 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP33.9■■■■□ 3.02
VSTM2A-202ENST00000402613 ITSN1Q15811 1721 aa33.9■■■■□ 3.02
VSTM2A-202ENST00000402613 QRICH2Q9H0J4 1663 aa33.89■■■■□ 3.02
VSTM2A-202ENST00000402613 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP33.88■■■■□ 3.01
VSTM2A-202ENST00000402613 BCL9LQ86UU0 1499 aa33.88■■■■□ 3.01
VSTM2A-202ENST00000402613 CARD11Q9BXL7 1154 aa33.87■■■■□ 3.01
VSTM2A-202ENST00000402613 EVC2Q86UK5 1308 aa33.86■■■■□ 3.01
VSTM2A-202ENST00000402613 PCGF6Q9BYE7 350 aa33.86■■■■□ 3.01
VSTM2A-202ENST00000402613 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa33.85■■■■□ 3.01
VSTM2A-202ENST00000402613 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP33.84■■■■□ 3.01
VSTM2A-202ENST00000402613 ATRNO75882 1429 aa33.84■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.9 ms