RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366976.3

NSL1-201, Transcript of NSL1, MIS12 kinetochore complex component, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NSL1, Length 722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSL1-201ENST00000366976 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.61■■□□□ 1.21
NSL1-201ENST00000366976 C1orf167Q5SNV9 1468 aa22.6■■□□□ 1.21
NSL1-201ENST00000366976 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
NSL1-201ENST00000366976 STK26Q9P289 416 aa22.59■■□□□ 1.21
NSL1-201ENST00000366976 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.59■■□□□ 1.21
NSL1-201ENST00000366976 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.58■■□□□ 1.21
NSL1-201ENST00000366976 DLC1Q96QB1 1528 aa22.58■■□□□ 1.21
NSL1-201ENST00000366976 LRP6O75581 1613 aa22.57■■□□□ 1.2
NSL1-201ENST00000366976 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
NSL1-201ENST00000366976 SHPRHQ149N8 1683 aa22.57■■□□□ 1.2
NSL1-201ENST00000366976 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.56■■□□□ 1.2
NSL1-201ENST00000366976 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.56■■□□□ 1.2
NSL1-201ENST00000366976 ADGRB1O14514 1584 aa22.55■■□□□ 1.2
NSL1-201ENST00000366976 NHSL1Q5SYE7 1610 aa22.52■■□□□ 1.2
NSL1-201ENST00000366976 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
NSL1-201ENST00000366976 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.5■■□□□ 1.19
NSL1-201ENST00000366976 PRAM1Q96QH2 718 aa22.49■■□□□ 1.19
NSL1-201ENST00000366976 ORAI2Q96SN7 254 aa22.48■■□□□ 1.19
NSL1-201ENST00000366976 POGKQ9P215 609 aa22.48■■□□□ 1.19
NSL1-201ENST00000366976 NPHP3Q7Z494 1330 aa22.48■■□□□ 1.19
NSL1-201ENST00000366976 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP22.47■■□□□ 1.19
NSL1-201ENST00000366976 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.47■■□□□ 1.19
NSL1-201ENST00000366976 ESCO1Q5FWF5 840 aa22.45■■□□□ 1.18
NSL1-201ENST00000366976 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
NSL1-201ENST00000366976 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
NSL1-201ENST00000366976 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.44■■□□□ 1.18
NSL1-201ENST00000366976 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
NSL1-201ENST00000366976 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.42■■□□□ 1.18
NSL1-201ENST00000366976 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.42■■□□□ 1.18
NSL1-201ENST00000366976 ADGRB2O60241 1585 aa22.42■■□□□ 1.18
NSL1-201ENST00000366976 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.41■■□□□ 1.18
NSL1-201ENST00000366976 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.39■■□□□ 1.18
NSL1-201ENST00000366976 POTEDQ86YR6 584 aa22.39■■□□□ 1.17
NSL1-201ENST00000366976 FOXO3O43524 673 aa22.37■■□□□ 1.17
NSL1-201ENST00000366976 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
NSL1-201ENST00000366976 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.37■■□□□ 1.17
NSL1-201ENST00000366976 KIF1AQ12756 1690 aa22.36■■□□□ 1.17
NSL1-201ENST00000366976 WASLO00401 505 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
NSL1-201ENST00000366976 PXDNQ92626 1479 aa22.35■■□□□ 1.17
NSL1-201ENST00000366976 RXRBP28702 533 aa22.35■■□□□ 1.17
NSL1-201ENST00000366976 PHF8Q9UPP1 1060 aa22.35■■□□□ 1.17
NSL1-201ENST00000366976 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
NSL1-201ENST00000366976 PSME1Q06323 249 aa22.34■■□□□ 1.17
NSL1-201ENST00000366976 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.34■■□□□ 1.17
NSL1-201ENST00000366976 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
NSL1-201ENST00000366976 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
NSL1-201ENST00000366976 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
NSL1-201ENST00000366976 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.32■■□□□ 1.16
NSL1-201ENST00000366976 NUTM2FA1L443 756 aa22.31■■□□□ 1.16
NSL1-201ENST00000366976 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
NSL1-201ENST00000366976 NEUROD1Q13562 356 aa22.31■■□□□ 1.16
NSL1-201ENST00000366976 SBNO1A3KN83 1393 aa22.3■■□□□ 1.16
NSL1-201ENST00000366976 KRT28Q7Z3Y7 464 aa22.3■■□□□ 1.16
NSL1-201ENST00000366976 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
NSL1-201ENST00000366976 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
NSL1-201ENST00000366976 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22.3■■□□□ 1.16
NSL1-201ENST00000366976 AFF2P51816 1311 aa22.3■■□□□ 1.16
NSL1-201ENST00000366976 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa22.3■■□□□ 1.16
NSL1-201ENST00000366976 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
NSL1-201ENST00000366976 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
NSL1-201ENST00000366976 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
NSL1-201ENST00000366976 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.25■■□□□ 1.15
NSL1-201ENST00000366976 RGS12O14924 1447 aa22.25■■□□□ 1.15
NSL1-201ENST00000366976 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.25■■□□□ 1.15
NSL1-201ENST00000366976 USP32Q8NFA0 1604 aa22.24■■□□□ 1.15
NSL1-201ENST00000366976 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.24■■□□□ 1.15
NSL1-201ENST00000366976 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.24■■□□□ 1.15
NSL1-201ENST00000366976 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.24■■□□□ 1.15
NSL1-201ENST00000366976 ARHGEF10O15013 1369 aa22.24■■□□□ 1.15
NSL1-201ENST00000366976 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
NSL1-201ENST00000366976 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
NSL1-201ENST00000366976 CDK19Q9BWU1 502 aa22.23■■□□□ 1.15
NSL1-201ENST00000366976 TONSLQ96HA7 1378 aa22.23■■□□□ 1.15
NSL1-201ENST00000366976 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.22■■□□□ 1.15
NSL1-201ENST00000366976 TNS3Q68CZ2 1445 aa22.22■■□□□ 1.15
NSL1-201ENST00000366976 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.21■■□□□ 1.15
NSL1-201ENST00000366976 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
NSL1-201ENST00000366976 PLEKHG3A1L390 1219 aa22.21■■□□□ 1.15
NSL1-201ENST00000366976 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
NSL1-201ENST00000366976 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
NSL1-201ENST00000366976 NGLY1Q96IV0 654 aa22.2■■□□□ 1.14
NSL1-201ENST00000366976 ATP7BP35670 1465 aa22.2■■□□□ 1.14
NSL1-201ENST00000366976 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.19■■□□□ 1.14
NSL1-201ENST00000366976 C8orf37Q96NL8 207 aa22.19■■□□□ 1.14
NSL1-201ENST00000366976 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.18■■□□□ 1.14
NSL1-201ENST00000366976 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
NSL1-201ENST00000366976 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
NSL1-201ENST00000366976 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
NSL1-201ENST00000366976 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
NSL1-201ENST00000366976 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.16■■□□□ 1.14
NSL1-201ENST00000366976 ADAMTS2O95450 1211 aa22.16■■□□□ 1.14
NSL1-201ENST00000366976 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
NSL1-201ENST00000366976 ITSN1Q15811 1721 aa22.16■■□□□ 1.14
NSL1-201ENST00000366976 SLC24A1O60721 1099 aa22.15■■□□□ 1.14
NSL1-201ENST00000366976 EVC2Q86UK5 1308 aa22.14■■□□□ 1.14
NSL1-201ENST00000366976 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.12■■□□□ 1.13
NSL1-201ENST00000366976 USP21Q9UK80 565 aa22.12■■□□□ 1.13
NSL1-201ENST00000366976 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
NSL1-201ENST00000366976 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
NSL1-201ENST00000366976 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
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