RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364561.1

RNU6-1277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1277P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1277P-201ENST00000364561 USP51Q70EK9 711 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MAML3Q96JK9 1138 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CRAMP1Q96RY5 1269 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PRKD2Q9BZL6 878 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DLL3Q9NYJ7 618 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PRG2P13727 222 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 INSRRP14616 1297 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TNFRSF1BP20333 461 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CERKQ8TCT0 537 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 AKT1S1Q96B36 256 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ERBB4Q15303 1308 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MAST4O15021 2626 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GRIN3BO60391 1043 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF202O95125 648 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ELNP15502 786 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ERFEQ4G0M1 354 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NELL1Q92832 810 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 VOPP1Q96AW1 172 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SHISA4Q96DD7 197 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C11orf21Q9P2W6 132 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HCN2Q9UL51 889 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 COL7A1Q02388 2944 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 INHBBP09529 407 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PKN1Q16512 942 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NAALADL2Q58DX5 795 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 XKR4Q5GH76 650 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FBXL22Q6P050 247 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 USP43Q70EL4 1123 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TMEM255BQ8WV15 326 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 BRINP2Q9C0B6 783 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 VPS33BQ9H267 617 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DACH1Q9UI36 760 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 STAB1Q9NY15 2570 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 POTEFA5A3E0 1075 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KRBA1A5PL33 1030 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PHF20L1A8MW92 1017 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SYN1P17600 705 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 VEGFBP49765 207 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PTPN5P54829 565 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 E2F1Q01094 437 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SVOPQ8N4V2 548 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 WFDC1Q9HC57 220 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CRIM1Q9NZV1 1036 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KIR3DL1P43629 444 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DOC2BQ14184 412 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KIR3DS1Q14943 382 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ECM1Q16610 540 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1277P-201ENST00000364561 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LCNL1Q6ZST4 164 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NPAS3Q8IXF0 933 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OSCARQ8IYS5 282 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF687Q8N1G0 1237 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZDHHC16Q969W1 377 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FAM187AA6NFU0 413 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1277P-201ENST00000364561 H3BM21 787 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CAPN15O75808 1086 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SLPIP03973 132 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CBSLP0DN79 551 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CBSP35520 551 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FAM69CQ0P6D2 419 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SPRED3Q2MJR0 410 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TSGA10IPQ3SY00 556 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CYB5RLQ6IPT4 315 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1277P-201ENST00000364561 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C20orf173Q96LM9 149 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MYRFQ9Y2G1 1151 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DMRT2Q9Y5R5 561 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1277P-201ENST00000364561 V9GY48 417 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FAT4Q6V0I7 4981 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FUT4P22083 530 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KRTAP12-2P59991 146 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP-0.75□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8 ms