RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362861.1

RNU6-1079P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1079, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1079P, Length 110 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1079P-201ENST00000362861 JAG2Q9Y219 1238 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NCANO14594 1321 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ADAMTS2O95450 1211 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FBXW7Q969H0 707 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MRGPRX2Q96LB1 330 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SCARF1Q14162 830 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NEDD1Q8NHV4 660 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PRRG2O14669 202 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MAN1A2O60476 641 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 IRAK1P51617 712 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CSRNP1Q96S65 589 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CD163Q86VB7 1156 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 EVI5O60447 810 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DSG2Q14126 1118 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TYW1BQ6NUM6 668 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLF2Q8IX21 1173 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 COL8A1P27658 744 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PRSS36Q5K4E3 855 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NKAPLQ5M9Q1 402 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TSKSQ9UJT2 592 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SMAPO00193 183 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DYRK3O43781 588 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ELNP15502 786 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 B8ZZF3 427 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CHRNA4P43681 627 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLC4A3P48751 1232 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ALDH1A1P00352 501 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MKL2Q9ULH7 1088 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PHF14O94880 888 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C8AP07357 584 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BCRP11274 1271 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP2.18□□□□□ -2.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GATA4P43694 442 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GRIN2CQ14957 1233 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MFRPQ9BY79 579 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LRRC4BQ9NT99 713 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NBPF26B4DH59 902 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NR1I2O75469 434 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TRIM32Q13049 653 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SV2AQ7L0J3 742 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
RNU6-1079P-201ENST00000362861 IGHA2P01877 340 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TATDN2Q93075 761 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
RNU6-1079P-201ENST00000362861 WASF2Q9Y6W5 498 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LILRA6Q6PI73 481 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PNMA3Q9UL41 463 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CDC14CA4D256 554 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PIK3R2O00459 728 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-1079P-201ENST00000362861 VWA5B2Q8N398 1253 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SPSB2Q99619 263 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OGFOD2Q6N063 350 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KLHL34Q8N239 644 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TPSG1Q9NRR2 321 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MAP3K9P80192 1104 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PTSQ03393 145 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CCDC155Q8N6L0 562 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-1079P-201ENST00000362861 EPAS1Q99814 870 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ITGA6P23229 1130 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KRTAP5-9P26371 169 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP2.1□□□□□ -2.07
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KMT5BQ4FZB7 885 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-1079P-201ENST00000362861 POU5F2Q8N7G0 328 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CDCA7LQ96GN5 454 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DNMT3LQ9UJW3 386 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-1079P-201ENST00000362861 VGFO15240 615 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
RNU6-1079P-201ENST00000362861 WNT7BP56706 349 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GAS6Q14393 721 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TRIM41Q8WV44 630 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SUV39H2Q9H5I1 410 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MBIPQ9NS73 344 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PCMTD2Q9NV79 361 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DBX1A6NMT0 343 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C3orf80F5H4A9 247 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OIP5O43482 229 aa2.07□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms