RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324444.7

SYNE4-201, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SYNE4, Length 1,354 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-201ENST00000324444 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
SYNE4-201ENST00000324444 CADPS2Q86UW7 1296 aa25.2■■□□□ 1.63
SYNE4-201ENST00000324444 KNDC1Q76NI1 1749 aa25.2■■□□□ 1.62
SYNE4-201ENST00000324444 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SYNE4-201ENST00000324444 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
SYNE4-201ENST00000324444 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SYNE4-201ENST00000324444 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.15■■□□□ 1.62
SYNE4-201ENST00000324444 DLC1Q96QB1 1528 aa25.14■■□□□ 1.62
SYNE4-201ENST00000324444 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
SYNE4-201ENST00000324444 TECPR2O15040 1411 aa25.14■■□□□ 1.61
SYNE4-201ENST00000324444 PHLPP1O60346 1717 aa25.13■■□□□ 1.61
SYNE4-201ENST00000324444 DCCP43146 1447 aa25.13■■□□□ 1.61
SYNE4-201ENST00000324444 SOCS7O14512 581 aa25.13■■□□□ 1.61
SYNE4-201ENST00000324444 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SYNE4-201ENST00000324444 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
SYNE4-201ENST00000324444 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.11■■□□□ 1.61
SYNE4-201ENST00000324444 ABCC11Q96J66 1382 aa25.11■■□□□ 1.61
SYNE4-201ENST00000324444 PTCH1Q13635 1447 aa25.11■■□□□ 1.61
SYNE4-201ENST00000324444 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa25.1■■□□□ 1.61
SYNE4-201ENST00000324444 ROBO2Q9HCK4 1378 aa25.07■■□□□ 1.6
SYNE4-201ENST00000324444 BRINP3Q76B58 766 aa25.06■■□□□ 1.6
SYNE4-201ENST00000324444 NALCNQ8IZF0 1738 aa25.06■■□□□ 1.6
SYNE4-201ENST00000324444 QRICH2Q9H0J4 1663 aa25.06■■□□□ 1.6
SYNE4-201ENST00000324444 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
SYNE4-201ENST00000324444 MST1RQ04912 1400 aa25.06■■□□□ 1.6
SYNE4-201ENST00000324444 JCADQ9P266 1359 aa25.06■■□□□ 1.6
SYNE4-201ENST00000324444 CDCA8Q53HL2 280 aa25.05■■□□□ 1.6
SYNE4-201ENST00000324444 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
SYNE4-201ENST00000324444 TMF1P82094 1093 aa25.04■■□□□ 1.6
SYNE4-201ENST00000324444 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.04■■□□□ 1.6
SYNE4-201ENST00000324444 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa25.03■■□□□ 1.6
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC7Q96M83 1385 aa25.02■■□□□ 1.6
SYNE4-201ENST00000324444 SIRT1Q96EB6 747 aa25.01■■□□□ 1.59
SYNE4-201ENST00000324444 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25■■□□□ 1.59
SYNE4-201ENST00000324444 TESK2Q96S53 571 aa25■■□□□ 1.59
SYNE4-201ENST00000324444 STK26Q9P289 416 aa25■■□□□ 1.59
SYNE4-201ENST00000324444 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
SYNE4-201ENST00000324444 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
SYNE4-201ENST00000324444 KIF7Q2M1P5 1343 aa24.97■■□□□ 1.59
SYNE4-201ENST00000324444 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.59
SYNE4-201ENST00000324444 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.95■■□□□ 1.59
SYNE4-201ENST00000324444 PRAM1Q96QH2 718 aa24.94■■□□□ 1.58
SYNE4-201ENST00000324444 ADGRB2O60241 1585 aa24.94■■□□□ 1.58
SYNE4-201ENST00000324444 C1orf167Q5SNV9 1468 aa24.94■■□□□ 1.58
SYNE4-201ENST00000324444 NHSL1Q5SYE7 1610 aa24.93■■□□□ 1.58
SYNE4-201ENST00000324444 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
SYNE4-201ENST00000324444 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa24.92■■□□□ 1.58
SYNE4-201ENST00000324444 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
SYNE4-201ENST00000324444 TULP4Q9NRJ4 1543 aa24.91■■□□□ 1.58
SYNE4-201ENST00000324444 SHPRHQ149N8 1683 aa24.91■■□□□ 1.58
SYNE4-201ENST00000324444 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.91■■□□□ 1.58
SYNE4-201ENST00000324444 LRP6O75581 1613 aa24.9■■□□□ 1.58
SYNE4-201ENST00000324444 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
SYNE4-201ENST00000324444 ORAI2Q96SN7 254 aa24.89■■□□□ 1.57
SYNE4-201ENST00000324444 POGKQ9P215 609 aa24.89■■□□□ 1.57
SYNE4-201ENST00000324444 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.88■■□□□ 1.57
SYNE4-201ENST00000324444 POTEAQ6S8J7 498 aa24.87■■□□□ 1.57
SYNE4-201ENST00000324444 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
SYNE4-201ENST00000324444 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
SYNE4-201ENST00000324444 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.85■■□□□ 1.57
SYNE4-201ENST00000324444 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
SYNE4-201ENST00000324444 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
SYNE4-201ENST00000324444 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.84■■□□□ 1.57
SYNE4-201ENST00000324444 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
SYNE4-201ENST00000324444 EVC2Q86UK5 1308 aa24.84■■□□□ 1.57
SYNE4-201ENST00000324444 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
SYNE4-201ENST00000324444 ESCO1Q5FWF5 840 aa24.8■■□□□ 1.56
SYNE4-201ENST00000324444 MYOM1P52179 1685 aa24.8■■□□□ 1.56
SYNE4-201ENST00000324444 NUTM2FA1L443 756 aa24.8■■□□□ 1.56
SYNE4-201ENST00000324444 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.79■■□□□ 1.56
SYNE4-201ENST00000324444 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
SYNE4-201ENST00000324444 ANP32CO43423 234 aa24.79■■□□□ 1.56
SYNE4-201ENST00000324444 FMN2Q9NZ56 1722 aa24.76■■□□□ 1.55
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
SYNE4-201ENST00000324444 NPHP3Q7Z494 1330 aa24.73■■□□□ 1.55
SYNE4-201ENST00000324444 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa24.73■■□□□ 1.55
SYNE4-201ENST00000324444 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
SYNE4-201ENST00000324444 USP32Q8NFA0 1604 aa24.73■■□□□ 1.55
SYNE4-201ENST00000324444 FOXO3O43524 673 aa24.72■■□□□ 1.55
SYNE4-201ENST00000324444 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.72■■□□□ 1.55
SYNE4-201ENST00000324444 ATP7BP35670 1465 aa24.72■■□□□ 1.55
SYNE4-201ENST00000324444 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.7■■□□□ 1.55
SYNE4-201ENST00000324444 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
SYNE4-201ENST00000324444 CDK19Q9BWU1 502 aa24.7■■□□□ 1.55
SYNE4-201ENST00000324444 AFF2P51816 1311 aa24.68■■□□□ 1.54
SYNE4-201ENST00000324444 ITSN1Q15811 1721 aa24.68■■□□□ 1.54
SYNE4-201ENST00000324444 PXDNQ92626 1479 aa24.68■■□□□ 1.54
SYNE4-201ENST00000324444 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
SYNE4-201ENST00000324444 MIER1Q8N108 512 aa24.67■■□□□ 1.54
SYNE4-201ENST00000324444 C8orf37Q96NL8 207 aa24.67■■□□□ 1.54
SYNE4-201ENST00000324444 CABP2Q9NPB3 220 aa24.67■■□□□ 1.54
SYNE4-201ENST00000324444 ANKARQ7Z5J8 1434 aa24.67■■□□□ 1.54
SYNE4-201ENST00000324444 ADAMTS2O95450 1211 aa24.67■■□□□ 1.54
SYNE4-201ENST00000324444 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
SYNE4-201ENST00000324444 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
SYNE4-201ENST00000324444 KIF1AQ12756 1690 aa24.65■■□□□ 1.54
SYNE4-201ENST00000324444 PRR36Q9H6K5 1346 aa24.64■■□□□ 1.54
SYNE4-201ENST00000324444 PANK3Q9H999 370 aa24.64■■□□□ 1.53
SYNE4-201ENST00000324444 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
SYNE4-201ENST00000324444 PHF8Q9UPP1 1060 aa24.62■■□□□ 1.53
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