RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261407.8

LPCAT3-201, Transcript of lysophosphatidylcholine acyltransferase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LPCAT3, Length 2,268 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT3-201ENST00000261407 STK26Q9P289 416 aa25.17■■□□□ 1.62
LPCAT3-201ENST00000261407 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
LPCAT3-201ENST00000261407 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.17■■□□□ 1.62
LPCAT3-201ENST00000261407 GLI2P10070 1586 aa25.16■■□□□ 1.62
LPCAT3-201ENST00000261407 KDM2BQ8NHM5 1336 aa25.16■■□□□ 1.62
LPCAT3-201ENST00000261407 PIK3C2BO00750 1634 aa25.15■■□□□ 1.62
LPCAT3-201ENST00000261407 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
LPCAT3-201ENST00000261407 MTHFSP49914 203 aa25.15■■□□□ 1.62
LPCAT3-201ENST00000261407 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.15■■□□□ 1.62
LPCAT3-201ENST00000261407 WWC1Q8IX03 1113 aa25.15■■□□□ 1.62
LPCAT3-201ENST00000261407 E9PSI1 815 aa25.14■■□□□ 1.62
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LPCAT3-201ENST00000261407 MS4A1P11836 297 aa25.12■■□□□ 1.61
LPCAT3-201ENST00000261407 RICTORQ6R327 1708 aa25.12■■□□□ 1.61
LPCAT3-201ENST00000261407 EVC2Q86UK5 1308 aa25.11■■□□□ 1.61
LPCAT3-201ENST00000261407 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
LPCAT3-201ENST00000261407 NBR1Q14596 966 aa25.11■■□□□ 1.61
LPCAT3-201ENST00000261407 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
LPCAT3-201ENST00000261407 CGNL1Q0VF96 1302 aa25.1■■□□□ 1.61
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LPCAT3-201ENST00000261407 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.08■■□□□ 1.61
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LPCAT3-201ENST00000261407 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.06■■□□□ 1.6
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LPCAT3-201ENST00000261407 FAM69CQ0P6D2 419 aa25■■□□□ 1.59
LPCAT3-201ENST00000261407 NGEFQ8N5V2 710 aa25■■□□□ 1.59
LPCAT3-201ENST00000261407 PANK1Q8TE04 598 aa25■■□□□ 1.59
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LPCAT3-201ENST00000261407 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.98■■□□□ 1.59
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LPCAT3-201ENST00000261407 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.98■■□□□ 1.59
LPCAT3-201ENST00000261407 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.98■■□□□ 1.59
LPCAT3-201ENST00000261407 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.97■■□□□ 1.59
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LPCAT3-201ENST00000261407 CFAP53Q96M91 514 aa24.97■■□□□ 1.59
LPCAT3-201ENST00000261407 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
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LPCAT3-201ENST00000261407 COG6Q9Y2V7 657 aa24.97■■□□□ 1.59
LPCAT3-201ENST00000261407 ZFYVE9O95405 1425 aa24.97■■□□□ 1.59
LPCAT3-201ENST00000261407 BCL2L13Q9BXK5 485 aa24.96■■□□□ 1.59
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LPCAT3-201ENST00000261407 C8orf34Q49A92 452 aa24.91■■□□□ 1.58
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LPCAT3-201ENST00000261407 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
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LPCAT3-201ENST00000261407 WDR63Q8IWG1 891 aa24.9■■□□□ 1.58
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LPCAT3-201ENST00000261407 CD163L1Q9NR16 1453 aa24.88■■□□□ 1.57
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LPCAT3-201ENST00000261407 TSPOAP1O95153 1857 aa24.87■■□□□ 1.57
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LPCAT3-201ENST00000261407 CLUAP1Q96AJ1 413 aa24.87■■□□□ 1.57
LPCAT3-201ENST00000261407 FAM161AQ3B820 660 aa24.86■■□□□ 1.57
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LPCAT3-201ENST00000261407 SLC4A3P48751 1232 aa24.83■■□□□ 1.57
LPCAT3-201ENST00000261407 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.83■■□□□ 1.57
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LPCAT3-201ENST00000261407 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa24.79■■□□□ 1.56
LPCAT3-201ENST00000261407 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
LPCAT3-201ENST00000261407 TMPOP42166 694 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
LPCAT3-201ENST00000261407 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.79■■□□□ 1.56
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LPCAT3-201ENST00000261407 ADGRB2O60241 1585 aa24.77■■□□□ 1.56
LPCAT3-201ENST00000261407 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
LPCAT3-201ENST00000261407 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.77■■□□□ 1.56
LPCAT3-201ENST00000261407 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.77■■□□□ 1.56
LPCAT3-201ENST00000261407 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.77■■□□□ 1.56
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