RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258148.11

MDM2-201, Transcript of MDM2 proto-oncogene, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MDM2, Length 1,361 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2-201ENST00000258148 TMEM164Q5U3C3 297 aa9.54□□□□□ -0.88
MDM2-201ENST00000258148 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
MDM2-201ENST00000258148 ATP9BO43861 1147 aa9.53□□□□□ -0.88
MDM2-201ENST00000258148 COL9A1P20849 921 aa9.53□□□□□ -0.88
MDM2-201ENST00000258148 USP46P62068 366 aa9.53□□□□□ -0.88
MDM2-201ENST00000258148 GUCA2AQ02747 115 aa9.53□□□□□ -0.88
MDM2-201ENST00000258148 NUDT18Q6ZVK8 323 aa9.53□□□□□ -0.88
MDM2-201ENST00000258148 HLA-CQ95604 372 aa9.53□□□□□ -0.88
MDM2-201ENST00000258148 RSPH4AQ5TD94 716 aa9.52□□□□□ -0.88
MDM2-201ENST00000258148 C3orf67Q6ZVT6 689 aa9.52□□□□□ -0.88
MDM2-201ENST00000258148 STK32AQ8WU08 396 aa9.52□□□□□ -0.88
MDM2-201ENST00000258148 CFAP99D6REC4 459 aa9.51□□□□□ -0.89
MDM2-201ENST00000258148 GCGRP47871 477 aa9.51□□□□□ -0.89
MDM2-201ENST00000258148 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
MDM2-201ENST00000258148 SEC24BO95487 1268 aa9.5□□□□□ -0.89
MDM2-201ENST00000258148 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
MDM2-201ENST00000258148 SEMA3FQ13275 785 aa9.5□□□□□ -0.89
MDM2-201ENST00000258148 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
MDM2-201ENST00000258148 RDH13Q8NBN7 331 aa9.5□□□□□ -0.89
MDM2-201ENST00000258148 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
MDM2-201ENST00000258148 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
MDM2-201ENST00000258148 MTMR2Q13614 643 aa9.5□□□□□ -0.89
MDM2-201ENST00000258148 SLAIN2Q9P270 581 aa9.5□□□□□ -0.89
MDM2-201ENST00000258148 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
MDM2-201ENST00000258148 ERCC3P19447 782 aa9.49□□□□□ -0.89
MDM2-201ENST00000258148 NBPF26B4DH59 902 aa9.48□□□□□ -0.89
MDM2-201ENST00000258148 TATDN2Q93075 761 aa9.48□□□□□ -0.89
MDM2-201ENST00000258148 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
MDM2-201ENST00000258148 PNMA3Q9UL41 463 aa9.47□□□□□ -0.89
MDM2-201ENST00000258148 PIK3CDO00329 1044 aa9.46□□□□□ -0.9
MDM2-201ENST00000258148 SSFA2P28290 1259 aa9.46□□□□□ -0.9
MDM2-201ENST00000258148 NR6A1Q15406 480 aa9.46□□□□□ -0.9
MDM2-201ENST00000258148 SLF2Q8IX21 1173 aa9.46□□□□□ -0.9
MDM2-201ENST00000258148 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
MDM2-201ENST00000258148 EVX2Q03828 476 aa9.45□□□□□ -0.9
MDM2-201ENST00000258148 TSC1Q92574 1164 aa9.45□□□□□ -0.9
MDM2-201ENST00000258148 SOWAHDA6NJG2 315 aa9.44□□□□□ -0.9
MDM2-201ENST00000258148 SLC10A3P09131 477 aa9.44□□□□□ -0.9
MDM2-201ENST00000258148 NUDT7P0C024 238 aa9.44□□□□□ -0.9
MDM2-201ENST00000258148 SIRT1Q96EB6 747 aa9.44□□□□□ -0.9
MDM2-201ENST00000258148 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa9.43□□□□□ -0.9
MDM2-201ENST00000258148 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa9.43□□□□□ -0.9
MDM2-201ENST00000258148 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP9.43□□□□□ -0.9
MDM2-201ENST00000258148 FAM69CQ0P6D2 419 aa9.43□□□□□ -0.9
MDM2-201ENST00000258148 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa9.43□□□□□ -0.9
MDM2-201ENST00000258148 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP9.43□□□□□ -0.94e-9■■■□□ 16.2
MDM2-201ENST00000258148 USP17L3A6NCW0 530 aa9.42□□□□□ -0.9
MDM2-201ENST00000258148 USP17L4A6NCW7 530 aa9.42□□□□□ -0.9
MDM2-201ENST00000258148 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
MDM2-201ENST00000258148 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
MDM2-201ENST00000258148 USP17L2Q6R6M4 530 aa9.42□□□□□ -0.9
MDM2-201ENST00000258148 USP17L1Q7RTZ2 530 aa9.42□□□□□ -0.9
MDM2-201ENST00000258148 SMAPO00193 183 aa9.41□□□□□ -0.9
MDM2-201ENST00000258148 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa9.41□□□□□ -0.9
MDM2-201ENST00000258148 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
MDM2-201ENST00000258148 BCL2L12Q9HB09 334 aa9.41□□□□□ -0.9
MDM2-201ENST00000258148 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
MDM2-201ENST00000258148 NR1H3Q13133 447 aa9.4□□□□□ -0.9
MDM2-201ENST00000258148 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
MDM2-201ENST00000258148 FAM196BA6NMK8 535 aa9.39□□□□□ -0.91
MDM2-201ENST00000258148 TCF3P15923 654 aa9.39□□□□□ -0.91
MDM2-201ENST00000258148 SERPINB4P48594 390 aa9.39□□□□□ -0.91
MDM2-201ENST00000258148 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
MDM2-201ENST00000258148 BCL2L13Q9BXK5 485 aa9.39□□□□□ -0.91
MDM2-201ENST00000258148 USP17L5A8MUK1 530 aa9.38□□□□□ -0.91
MDM2-201ENST00000258148 USP17L15C9J2P7 530 aa9.38□□□□□ -0.91
MDM2-201ENST00000258148 USP17L10C9JJH3 530 aa9.38□□□□□ -0.91
MDM2-201ENST00000258148 USP17L13C9JLJ4 530 aa9.38□□□□□ -0.91
MDM2-201ENST00000258148 USP17L12C9JPN9 530 aa9.38□□□□□ -0.91
MDM2-201ENST00000258148 USP17L11C9JVI0 530 aa9.38□□□□□ -0.91
MDM2-201ENST00000258148 USP17L21D6R901 530 aa9.38□□□□□ -0.91
MDM2-201ENST00000258148 USP17L18D6R9N7 530 aa9.38□□□□□ -0.91
MDM2-201ENST00000258148 USP17L22D6RA61 530 aa9.38□□□□□ -0.91
MDM2-201ENST00000258148 USP17L17D6RBQ6 530 aa9.38□□□□□ -0.91
MDM2-201ENST00000258148 USP17L19D6RCP7 530 aa9.38□□□□□ -0.91
MDM2-201ENST00000258148 USP17L20D6RJB6 530 aa9.38□□□□□ -0.91
MDM2-201ENST00000258148 USP17L24Q0WX57 530 aa9.38□□□□□ -0.91
MDM2-201ENST00000258148 NPAS4Q8IUM7 802 aa9.38□□□□□ -0.91
MDM2-201ENST00000258148 PNMA1Q8ND90 353 aa9.38□□□□□ -0.91
MDM2-201ENST00000258148 SLC39A7Q92504 469 aa9.38□□□□□ -0.91
MDM2-201ENST00000258148 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
MDM2-201ENST00000258148 C6orf229H3BNL8 230 aa9.37□□□□□ -0.91
MDM2-201ENST00000258148 FBXO45P0C2W1 286 aa9.37□□□□□ -0.91
MDM2-201ENST00000258148 ARSIQ5FYB1 569 aa9.37□□□□□ -0.91
MDM2-201ENST00000258148 PACS2Q86VP3 889 aa9.37□□□□□ -0.91
MDM2-201ENST00000258148 FAM174AQ8TBP5 190 aa9.37□□□□□ -0.91
MDM2-201ENST00000258148 GIPC2Q8TF65 315 aa9.37□□□□□ -0.91
MDM2-201ENST00000258148 MARSP56192 900 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
MDM2-201ENST00000258148 PTK7Q13308 1070 aa9.36□□□□□ -0.91
MDM2-201ENST00000258148 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
MDM2-201ENST00000258148 SKIP12755 728 aa9.35□□□□□ -0.91
MDM2-201ENST00000258148 VAMP1P23763 118 aa9.35□□□□□ -0.91
MDM2-201ENST00000258148 CCDC125Q86Z20 511 aa9.35□□□□□ -0.91
MDM2-201ENST00000258148 DEPDC4Q8N2C3 294 aa9.35□□□□□ -0.91
MDM2-201ENST00000258148 C8orf37Q96NL8 207 aa9.35□□□□□ -0.91
MDM2-201ENST00000258148 C7P10643 843 aa9.34□□□□□ -0.91
MDM2-201ENST00000258148 PTPREP23469 700 aa9.34□□□□□ -0.91
MDM2-201ENST00000258148 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa9.34□□□□□ -0.91
MDM2-201ENST00000258148 GPR153Q6NV75 609 aa9.34□□□□□ -0.91
MDM2-201ENST00000258148 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms