RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253193.8

LRP3-201, Transcript of LDL receptor related protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP3, Length 3,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3-201ENST00000253193 RARSP54136 660 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
LRP3-201ENST00000253193 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
LRP3-201ENST00000253193 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
LRP3-201ENST00000253193 PTPRTO14522 1441 aa23.5■■□□□ 1.35
LRP3-201ENST00000253193 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa23.49■■□□□ 1.35
LRP3-201ENST00000253193 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa23.49■■□□□ 1.35
LRP3-201ENST00000253193 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
LRP3-201ENST00000253193 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa23.48■■□□□ 1.35
LRP3-201ENST00000253193 TRPM2O94759 1503 aa23.48■■□□□ 1.35
LRP3-201ENST00000253193 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
LRP3-201ENST00000253193 ATP7AQ04656 1500 aa23.47■■□□□ 1.35
LRP3-201ENST00000253193 RLBP1P12271 317 aa23.47■■□□□ 1.35
LRP3-201ENST00000253193 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
LRP3-201ENST00000253193 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
LRP3-201ENST00000253193 TERF2IPQ9NYB0 399 aa23.46■■□□□ 1.35
LRP3-201ENST00000253193 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
LRP3-201ENST00000253193 ERVK-7P63135 1459 aa23.46■■□□□ 1.35
LRP3-201ENST00000253193 WDR63Q8IWG1 891 aa23.46■■□□□ 1.35
LRP3-201ENST00000253193 ASXL2Q76L83 1435 aa23.45■■□□□ 1.35
LRP3-201ENST00000253193 MLECQ14165 292 aa23.45■■□□□ 1.35
LRP3-201ENST00000253193 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa23.45■■□□□ 1.35
LRP3-201ENST00000253193 SEC24BO95487 1268 aa23.45■■□□□ 1.34
LRP3-201ENST00000253193 RIPK4P57078 832 aa23.44■■□□□ 1.34
LRP3-201ENST00000253193 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
LRP3-201ENST00000253193 CLTCL1P53675 1640 aa23.44■■□□□ 1.34
LRP3-201ENST00000253193 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
LRP3-201ENST00000253193 MADDQ8WXG6 1647 aa23.44■■□□□ 1.34
LRP3-201ENST00000253193 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
LRP3-201ENST00000253193 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.42■■□□□ 1.34
LRP3-201ENST00000253193 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
LRP3-201ENST00000253193 PRAM1Q96QH2 718 aa23.42■■□□□ 1.34
LRP3-201ENST00000253193 SYNMO15061 1565 aa23.42■■□□□ 1.34
LRP3-201ENST00000253193 IDI1Q13907 227 aa23.41■■□□□ 1.34
LRP3-201ENST00000253193 OSCARQ8IYS5 282 aa23.41■■□□□ 1.34
LRP3-201ENST00000253193 LAMC1P11047 1609 aa23.41■■□□□ 1.34
LRP3-201ENST00000253193 CD109Q6YHK3 1445 aa23.4■■□□□ 1.34
LRP3-201ENST00000253193 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
LRP3-201ENST00000253193 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
LRP3-201ENST00000253193 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.37■■□□□ 1.33
LRP3-201ENST00000253193 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.37■■□□□ 1.33
LRP3-201ENST00000253193 MVPQ14764 893 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
LRP3-201ENST00000253193 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
LRP3-201ENST00000253193 FBLN1P23142 703 aa23.36■■□□□ 1.33
LRP3-201ENST00000253193 TMPOP42166 694 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
LRP3-201ENST00000253193 HMOX1P09601 288 aa23.35■■□□□ 1.33
LRP3-201ENST00000253193 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
LRP3-201ENST00000253193 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
LRP3-201ENST00000253193 CABP1Q9NZU7 370 aa23.34■■□□□ 1.33
LRP3-201ENST00000253193 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
LRP3-201ENST00000253193 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
LRP3-201ENST00000253193 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.33■■□□□ 1.33
LRP3-201ENST00000253193 NINLQ9Y2I6 1382 aa23.33■■□□□ 1.33
LRP3-201ENST00000253193 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
LRP3-201ENST00000253193 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
LRP3-201ENST00000253193 DDX19BQ9UMR2 479 aa23.32■■□□□ 1.32
LRP3-201ENST00000253193 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.31■■□□□ 1.32
LRP3-201ENST00000253193 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.31■■□□□ 1.32
LRP3-201ENST00000253193 USP19O94966 1318 aa23.31■■□□□ 1.32
LRP3-201ENST00000253193 NPATQ14207 1427 aa23.3■■□□□ 1.32
LRP3-201ENST00000253193 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.3■■□□□ 1.32
LRP3-201ENST00000253193 LNPKQ9C0E8 428 aa23.3■■□□□ 1.32
LRP3-201ENST00000253193 SHROOM2Q13796 1616 aa23.3■■□□□ 1.32
LRP3-201ENST00000253193 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
LRP3-201ENST00000253193 CDK19Q9BWU1 502 aa23.29■■□□□ 1.32
LRP3-201ENST00000253193 SOX12O15370 315 aa23.29■■□□□ 1.32
LRP3-201ENST00000253193 TRIM27P14373 513 aa23.29■■□□□ 1.32
LRP3-201ENST00000253193 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa23.28■■□□□ 1.32
LRP3-201ENST00000253193 AAMPQ13685 434 aa23.28■■□□□ 1.32
LRP3-201ENST00000253193 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
LRP3-201ENST00000253193 TET3O43151 1660 aa23.28■■□□□ 1.32
LRP3-201ENST00000253193 PRKAR2BP31323 418 aa23.28■■□□□ 1.32
LRP3-201ENST00000253193 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
LRP3-201ENST00000253193 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.26■■□□□ 1.31
LRP3-201ENST00000253193 TMEM57Q8N5G2 664 aa23.26■■□□□ 1.31
LRP3-201ENST00000253193 FYB1O15117 783 aa23.26■■□□□ 1.31
LRP3-201ENST00000253193 C22orf23Q9BZE7 217 aa23.26■■□□□ 1.31
LRP3-201ENST00000253193 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23.26■■□□□ 1.31
LRP3-201ENST00000253193 IQGAP1P46940 1657 aa23.26■■□□□ 1.31
LRP3-201ENST00000253193 MYOM2P54296 1465 aa23.26■■□□□ 1.31
LRP3-201ENST00000253193 HSCBQ8IWL3 235 aa23.25■■□□□ 1.31
LRP3-201ENST00000253193 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.25■■□□□ 1.31
LRP3-201ENST00000253193 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa23.25■■□□□ 1.31
LRP3-201ENST00000253193 WAPLQ7Z5K2 1190 aa23.25■■□□□ 1.31
LRP3-201ENST00000253193 ANKRD45Q5TZF3 282 aa23.24■■□□□ 1.31
LRP3-201ENST00000253193 NUTM2FA1L443 756 aa23.24■■□□□ 1.31
LRP3-201ENST00000253193 CCDC27Q2M243 656 aa23.24■■□□□ 1.31
LRP3-201ENST00000253193 C1orf115Q9H7X2 142 aa23.24■■□□□ 1.31
LRP3-201ENST00000253193 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.24■■□□□ 1.31
LRP3-201ENST00000253193 A0A1W2PP64 1363 aa23.22■■□□□ 1.31
LRP3-201ENST00000253193 TBC1D2Q9BYX2 928 aa23.21■■□□□ 1.31
LRP3-201ENST00000253193 FOXD4L1Q9NU39 408 aa23.21■■□□□ 1.31
LRP3-201ENST00000253193 ABCA6Q8N139 1617 aa23.21■■□□□ 1.31
LRP3-201ENST00000253193 APBB1O00213 710 aa23.2■■□□□ 1.31
LRP3-201ENST00000253193 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
LRP3-201ENST00000253193 KIF16BQ96L93 1317 aa23.19■■□□□ 1.3
LRP3-201ENST00000253193 CEP152O94986 1710 aa23.19■■□□□ 1.3
LRP3-201ENST00000253193 TBC1D32Q96NH3 1257 aa23.18■■□□□ 1.3
LRP3-201ENST00000253193 TRIM35Q9UPQ4 493 aa23.17■■□□□ 1.3
LRP3-201ENST00000253193 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.17■■□□□ 1.3
LRP3-201ENST00000253193 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
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