RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 C19orf44Q9H6X5 657 aa27.55■■■□□ 2
HOXD11-201ENST00000249504 UBAP1LF5GYI3 381 aa27.54■■■□□ 2
HOXD11-201ENST00000249504 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP27.54■■■□□ 2
HOXD11-201ENST00000249504 TOM1O60784 492 aa27.53■■■□□ 2
HOXD11-201ENST00000249504 DCCP43146 1447 aa27.51■■■□□ 2
HOXD11-201ENST00000249504 ATF3P18847 181 aa27.51■■□□□ 1.99
HOXD11-201ENST00000249504 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
HOXD11-201ENST00000249504 CADPS2Q86UW7 1296 aa27.49■■□□□ 1.99
HOXD11-201ENST00000249504 USP47Q96K76 1375 aa27.47■■□□□ 1.99
HOXD11-201ENST00000249504 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa27.47■■□□□ 1.99
HOXD11-201ENST00000249504 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
HOXD11-201ENST00000249504 QRICH2Q9H0J4 1663 aa27.45■■□□□ 1.98
HOXD11-201ENST00000249504 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
HOXD11-201ENST00000249504 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
HOXD11-201ENST00000249504 FBXO41Q8TF61 875 aa27.44■■□□□ 1.98
HOXD11-201ENST00000249504 ADGRB2O60241 1585 aa27.43■■□□□ 1.98
HOXD11-201ENST00000249504 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP27.43■■□□□ 1.98
HOXD11-201ENST00000249504 PIP4K2BP78356 416 aa27.41■■□□□ 1.98
HOXD11-201ENST00000249504 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
HOXD11-201ENST00000249504 SLAIN2Q9P270 581 aa27.4■■□□□ 1.98
HOXD11-201ENST00000249504 FMN2Q9NZ56 1722 aa27.39■■□□□ 1.98
HOXD11-201ENST00000249504 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
HOXD11-201ENST00000249504 MST1RQ04912 1400 aa27.39■■□□□ 1.97
HOXD11-201ENST00000249504 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXD11-201ENST00000249504 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXD11-201ENST00000249504 C1orf167Q5SNV9 1468 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXD11-201ENST00000249504 NUTM2FA1L443 756 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXD11-201ENST00000249504 WASLO00401 505 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
HOXD11-201ENST00000249504 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
HOXD11-201ENST00000249504 TULP4Q9NRJ4 1543 aa27.29■■□□□ 1.96
HOXD11-201ENST00000249504 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa27.29■■□□□ 1.96
HOXD11-201ENST00000249504 TESK2Q96S53 571 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXD11-201ENST00000249504 ANKARQ7Z5J8 1434 aa27.27■■□□□ 1.96
HOXD11-201ENST00000249504 CDK19Q9BWU1 502 aa27.27■■□□□ 1.96
HOXD11-201ENST00000249504 EVC2Q86UK5 1308 aa27.27■■□□□ 1.96
HOXD11-201ENST00000249504 USP32Q8NFA0 1604 aa27.26■■□□□ 1.95
HOXD11-201ENST00000249504 BRINP3Q76B58 766 aa27.26■■□□□ 1.95
HOXD11-201ENST00000249504 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
HOXD11-201ENST00000249504 ESCO1Q5FWF5 840 aa27.25■■□□□ 1.95
HOXD11-201ENST00000249504 ORAI2Q96SN7 254 aa27.24■■□□□ 1.95
HOXD11-201ENST00000249504 ITSN1Q15811 1721 aa27.23■■□□□ 1.95
HOXD11-201ENST00000249504 ATP7BP35670 1465 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXD11-201ENST00000249504 KIF1AQ12756 1690 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXD11-201ENST00000249504 PRR36Q9H6K5 1346 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXD11-201ENST00000249504 SLC24A1O60721 1099 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXD11-201ENST00000249504 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
HOXD11-201ENST00000249504 CABP2Q9NPB3 220 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXD11-201ENST00000249504 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
HOXD11-201ENST00000249504 PHLPP1O60346 1717 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXD11-201ENST00000249504 NHSL1Q5SYE7 1610 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXD11-201ENST00000249504 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
HOXD11-201ENST00000249504 PHF8Q9UPP1 1060 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXD11-201ENST00000249504 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXD11-201ENST00000249504 DISP3Q9P2K9 1392 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXD11-201ENST00000249504 HSPA1LP34931 641 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXD11-201ENST00000249504 TMF1P82094 1093 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC61Q9Y6R9 512 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXD11-201ENST00000249504 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa27.14■■□□□ 1.94
HOXD11-201ENST00000249504 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
HOXD11-201ENST00000249504 NPHP3Q7Z494 1330 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXD11-201ENST00000249504 ATAD2Q6PL18 1390 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXD11-201ENST00000249504 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
HOXD11-201ENST00000249504 FOXO3O43524 673 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXD11-201ENST00000249504 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXD11-201ENST00000249504 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
HOXD11-201ENST00000249504 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC7Q96M83 1385 aa27.07■■□□□ 1.92
HOXD11-201ENST00000249504 KIF7Q2M1P5 1343 aa27.07■■□□□ 1.92
HOXD11-201ENST00000249504 CDCA8Q53HL2 280 aa27.07■■□□□ 1.92
HOXD11-201ENST00000249504 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
HOXD11-201ENST00000249504 WASHC2AQ641Q2 1341 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXD11-201ENST00000249504 PLEKHG3A1L390 1219 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXD11-201ENST00000249504 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
HOXD11-201ENST00000249504 CABP1Q9NZU7 370 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXD11-201ENST00000249504 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
HOXD11-201ENST00000249504 PSME1Q06323 249 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXD11-201ENST00000249504 PXDNQ92626 1479 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXD11-201ENST00000249504 MYOM1P52179 1685 aa27.03■■□□□ 1.92
HOXD11-201ENST00000249504 ACEP12821 1306 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXD11-201ENST00000249504 KRT28Q7Z3Y7 464 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXD11-201ENST00000249504 TMC1Q8TDI8 760 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXD11-201ENST00000249504 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
HOXD11-201ENST00000249504 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
HOXD11-201ENST00000249504 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.98■■□□□ 1.91
HOXD11-201ENST00000249504 NINLQ9Y2I6 1382 aa26.98■■□□□ 1.91
HOXD11-201ENST00000249504 JCADQ9P266 1359 aa26.97■■□□□ 1.91
HOXD11-201ENST00000249504 AKAP12Q02952 1782 aa26.97■■□□□ 1.91
HOXD11-201ENST00000249504 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
HOXD11-201ENST00000249504 SHPRHQ149N8 1683 aa26.95■■□□□ 1.91
HOXD11-201ENST00000249504 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa26.95■■□□□ 1.9
HOXD11-201ENST00000249504 SBNO1A3KN83 1393 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXD11-201ENST00000249504 TNS3Q68CZ2 1445 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXD11-201ENST00000249504 USP6P35125 1406 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXD11-201ENST00000249504 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
HOXD11-201ENST00000249504 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
HOXD11-201ENST00000249504 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXD11-201ENST00000249504 TERF2IPQ9NYB0 399 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXD11-201ENST00000249504 PNPLA6Q8IY17 1366 aa26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms