RNA–Protein interactions for RNA: YLR369W

SSQ1, Transcript of Mitochondrial hsp70-type molecular chaperone, yeastyeast

Gene SSQ1, Length 1,974 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSQ1YLR369W PET8P38921 284 aa1.34□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W RPL33BP41056 107 aaKnown RBP1.34□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W HUR1P45820 110 aa1.34□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W ICS3P47034 131 aa1.34□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W YGL193CP53097 103 aa1.34□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W YHR173CP38864 112 aa1.33□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W SPI1P40092 148 aa1.33□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W YOR268CQ08734 132 aa1.33□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W YML100W-AQ8TGT0 57 aa1.33□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W RPL26AP05743 127 aaKnown RBP1.32□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W YBR209WP38311 105 aa1.32□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W YKL065W-AQ2V2P2 73 aa1.32□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W YOR381W-AQ3E804 55 aa1.32□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W TDA8Q6B2U8 126 aa1.32□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W AIM4P38305 123 aaPredicted RBP1.32□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W YHL005CP38752 130 aa1.32□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W YEL067CP39978 195 aa1.32□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W DCV1P43595 202 aa1.32□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W YNR077CP53758 84 aa1.32□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W YOR314WQ12506 109 aa1.32□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W YLR285C-AQ3E771 56 aa1.32□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W YAL065CO13511 128 aa1.31□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W HMRA2P0CY13 119 aa1.31□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W YAL064WP39711 94 aa1.31□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W MGR2Q02889 113 aa1.31□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W YLR194CQ05777 254 aa1.31□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W ATP20Q12233 115 aa1.31□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W TIM22Q12328 207 aa1.31□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W YAR023CD6VPM8 179 aa1.3□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W RPL26BP53221 127 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W MPC3P53311 146 aa1.3□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W ERI1P62651 68 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W ECM19Q06011 112 aa1.3□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W FIT2Q08906 153 aa1.3□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W COA3Q3E7B2 85 aa1.3□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W YGR121W-AQ3E816 71 aa1.3□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W YLR156WP0CE96 114 aa1.3□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W YLR159WP0CE97 114 aa1.3□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W YLR161WP0CE98 114 aa1.3□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W TOS6P48560 102 aa1.3□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W YDR246W-AQ3E763 66 aa1.3□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W YLR342W-AQ3E810 57 aa1.3□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W OST5Q92316 86 aa1.3□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W FYV5P25585 152 aa1.29□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W YKR032WP36127 104 aa1.29□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W MSA2P36157 363 aa1.29□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W EDC2P40023 145 aaPredicted RBP1.29□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W VTC1P40046 129 aaRIP-Chip data1.29□□□□□ -2.2not detected
SSQ1YLR369W YMR122CQ03879 124 aa1.29□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W YLR162WQ06235 118 aa1.29□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W YBR200W-AQ3E755 54 aa1.29□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W YDR182W-AQ3E796 67 aa1.29□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W RPL36BO14455 100 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W RPL36AP05745 100 aaPredicted RBP1.28□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W YER188C-AP0C0V2 99 aa1.28□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W YDL022C-AP0C5L6 82 aa1.28□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W DAD4P69851 72 aa1.28□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W IRC21Q04772 201 aa1.28□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W YPR010C-AA5Z2X5 72 aa1.28□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W YOR008C-AQ3E7B9 74 aa1.28□□□□□ -2.2
SSQ1YLR369W YMR141CP40211 102 aa1.27□□□□□ -2.21
SSQ1YLR369W HUA1P40325 198 aa1.27□□□□□ -2.21
SSQ1YLR369W RGM1Q00453 211 aa1.27□□□□□ -2.21
SSQ1YLR369W YOR020W-AQ3E824 90 aa1.27□□□□□ -2.21
SSQ1YLR369W YMR122W-AQ3E842 84 aa1.27□□□□□ -2.21
SSQ1YLR369W YFR032C-BQ8TGU2 87 aa1.27□□□□□ -2.21
SSQ1YLR369W YJR107C-AP0CT86 78 aa1.27□□□□□ -2.21
SSQ1YLR369W ATP15P21306 62 aa1.27□□□□□ -2.21
SSQ1YLR369W QCR10P37299 77 aa1.27□□□□□ -2.21
SSQ1YLR369W SHU1P38751 150 aa1.27□□□□□ -2.21
SSQ1YLR369W EDC1P53080 175 aaPredicted RBP1.27□□□□□ -2.21
SSQ1YLR369W YNL190WP53872 204 aa1.27□□□□□ -2.21
SSQ1YLR369W LIP1Q03579 150 aa1.27□□□□□ -2.21
SSQ1YLR369W YPR153WQ06537 140 aa1.27□□□□□ -2.21
SSQ1YLR369W YOL014WQ08110 124 aa1.27□□□□□ -2.21
SSQ1YLR369W NOP10Q6Q547 58 aaPredicted RBP1.27□□□□□ -2.21
SSQ1YLR369W QCR8P08525 94 aa1.26□□□□□ -2.21
SSQ1YLR369W RPS30AP0CX33 63 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
SSQ1YLR369W RPS30BP0CX34 63 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
SSQ1YLR369W PMP3P87284 55 aa1.26□□□□□ -2.21
SSQ1YLR369W SOM1Q05676 74 aa1.26□□□□□ -2.21
SSQ1YLR369W YCR095W-AQ3E787 52 aa1.26□□□□□ -2.21
SSQ1YLR369W CMC4Q3E7A9 73 aa1.26□□□□□ -2.21
SSQ1YLR369W YBL008W-AQ3E821 79 aa1.26□□□□□ -2.21
SSQ1YLR369W HUB1Q6Q546 73 aa1.26□□□□□ -2.21
SSQ1YLR369W ARC15P40518 154 aaRIP-Chip data1.25□□□□□ -2.21not detected
SSQ1YLR369W RPL38P49167 78 aaKnown RBP1.25□□□□□ -2.21
SSQ1YLR369W MRPS12P53732 153 aa1.25□□□□□ -2.21
SSQ1YLR369W SNA2P56508 79 aa1.25□□□□□ -2.21
SSQ1YLR369W ATP18P81450 59 aa1.25□□□□□ -2.21
SSQ1YLR369W YOL166W-AQ8TGJ1 51 aa1.25□□□□□ -2.21
SSQ1YLR369W YLR236CA0A023PZG4 107 aa1.24□□□□□ -2.21
SSQ1YLR369W YGL149WP53116 101 aa1.24□□□□□ -2.21
SSQ1YLR369W BSC4P53841 131 aa1.24□□□□□ -2.21
SSQ1YLR369W MRX7P53869 86 aa1.24□□□□□ -2.21
SSQ1YLR369W YIL156W-BQ2V2P4 73 aa1.23□□□□□ -2.21
SSQ1YLR369W YOR034C-AQ3E735 80 aa1.23□□□□□ -2.21
SSQ1YLR369W YIL102CP40488 101 aa1.23□□□□□ -2.21
SSQ1YLR369W YBR219CP38317 127 aa1.22□□□□□ -2.21
SSQ1YLR369W COX23P38824 151 aa1.22□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.7 ms