RNA–Protein interactions for RNA: YKR086W

PRP16, Transcript of DEAH-box RNA helicase involved in second catalytic step of splicing and in exon ligation, yeast

Gene PRP16, Length 3,216 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRP16	YKR086W	YBL071C	P38185	102 aa		0.28	□□□□□ -2.36
PRP16	YKR086W	YCL001W-A	P87012	153 aa		0.28	□□□□□ -2.36
PRP16	YKR086W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		0.28	□□□□□ -2.36
PRP16	YKR086W	TAR1	Q8TGM6	124 aa		0.28	□□□□□ -2.36
PRP16	YKR086W	PAU2	P32612	120 aa		0.28	□□□□□ -2.36
PRP16	YKR086W	YGR121W-A	Q3E816	71 aa		0.28	□□□□□ -2.36
PRP16	YKR086W	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	0.28	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	0.27	□□□□□ -2.37	not detected
PRP16	YKR086W	IMP2	P46972	177 aa		0.27	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	YML054C-A	Q3E809	52 aa		0.27	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		0.27	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	YMR122W-A	Q3E842	84 aa		0.27	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	PAU24	P38155	120 aa		0.27	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	YBR242W	P38331	238 aa		0.27	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	SPC24	Q04477	213 aa		0.27	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	YDR182W-A	Q3E796	67 aa		0.27	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	0.26	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	RPC10	P40422	70 aa		0.26	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	YAL065C	O13511	128 aa		0.26	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	YDR034C-A	P0C289	58 aa		0.26	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	KSH1	Q8TGJ3	72 aa		0.26	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	ECM12	O13529	151 aa		0.26	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	MRX7	P53869	86 aa		0.26	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	PMP3	P87284	55 aa		0.26	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		0.26	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	ENV10	Q99382	181 aa		0.26	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	QCR9	P22289	66 aa		0.25	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	HSP10	P38910	106 aa		0.25	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	ERV14	P53173	138 aa		0.25	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	YOR314W	Q12506	109 aa		0.25	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		0.25	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	PCC1	Q3E833	88 aa		0.25	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		0.25	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	MIC27	P50945	234 aa		0.25	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	TOM7	P53507	60 aa		0.25	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	YDR042C	Q03205	200 aa		0.25	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	SEN15	Q04675	128 aa		0.25	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	YPL261C	Q08976	102 aa		0.25	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	DAD1	Q12248	94 aa		0.25	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	RPL29	P05747	59 aa	Predicted RBP	0.25	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	YHR173C	P38864	112 aa		0.25	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	CYB5	P40312	120 aa		0.25	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		0.25	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	COX7	P10174	60 aa		0.24	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	YCR050C	P25630	102 aa		0.24	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	YJR128W	P47162	119 aa		0.24	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	YMR103C	Q04436	120 aa		0.24	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		0.24	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	YBR016W	P38216	128 aa		0.24	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	ATX1	P38636	73 aa		0.24	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		0.24	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		0.24	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	YER188C-A	P0C0V2	99 aa		0.23	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	YBL039W-B	P0C268	59 aa		0.23	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	YOL013W-A	P0C272	63 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	HMRA1	P0CY11	126 aa		0.23	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	RPB11	P38902	120 aa		0.23	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	TOS6	P48560	102 aa		0.23	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		0.23	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	YHR130C	P38834	111 aa		0.23	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	PAU7	P39545	55 aa		0.23	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	PAU5	P43575	122 aa		0.23	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	YOR105W	Q08504	108 aa		0.23	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	SUS1	Q6WNK7	96 aa		0.23	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	YGL014C-A	P0C5N1	53 aa		0.23	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	YMR141C	P40211	102 aa		0.23	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	YIL163C	P40448	117 aa		0.23	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	FYV7	Q12247	151 aa		0.23	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	YHR073W-A	P0C5N7	58 aa		0.22	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	SNA2	P56508	79 aa		0.22	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	Q0032	Q9ZZX7	96 aa		0.22	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	PAU19	P0CE85	124 aa		0.22	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	PAU3	P25610	124 aa		0.22	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	PAU15	P40585	124 aa		0.22	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	YNL042W-B	Q3E7Z2	85 aa		0.22	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	COA2	Q3E823	68 aa		0.22	□□□□□ -2.37
PRP16	YKR086W	PAU4	P53427	120 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PRP16	YKR086W	YOR304C-A	O14468	76 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PRP16	YKR086W	PAU1	P0CE88	120 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PRP16	YKR086W	PAU14	P0CE89	120 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PRP16	YKR086W	PAU6	P0CE90	120 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PRP16	YKR086W	PAU18	P0CE91	120 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PRP16	YKR086W	PAU8	P0CE92	120 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PRP16	YKR086W	PAU11	P0CE93	120 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PRP16	YKR086W	PAU16	P35994	123 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PRP16	YKR086W	PAU13	P38725	120 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PRP16	YKR086W	HHY1	P39982	102 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PRP16	YKR086W	RSM18	P40033	138 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PRP16	YKR086W	PAU10	Q03050	120 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PRP16	YKR086W	PAU20	Q08322	120 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PRP16	YKR086W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PRP16	YKR086W	PAU9	Q3E770	120 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PRP16	YKR086W	YLR285C-A	Q3E771	56 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PRP16	YKR086W	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PRP16	YKR086W	YLR157W-D	P0CE99	70 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PRP16	YKR086W	YKL044W	P36092	106 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PRP16	YKR086W	MVB12	P42939	101 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PRP16	YKR086W	CWP2	P43497	92 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PRP16	YKR086W	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		0.21	□□□□□ -2.38

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 53.7 ms