RNA–Protein interactions for RNA: YKR013W

PRY2, Transcript of Sterol binding protein involved in the export of acetylated sterols, yeast

Gene PRY2, Length 990 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRY2	YKR013W	YAR023C	D6VPM8	179 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRY2	YKR013W	RAD6	P06104	172 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRY2	YKR013W	YGR039W	P53225	103 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PRY2	YKR013W	TSC3	Q3E790	80 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PRY2	YKR013W	MDN1	Q12019	4910 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PRY2	YKR013W	YFR009W-A	P0C5M9	85 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRY2	YKR013W	YLR307C-A	Q3E825	87 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PRY2	YKR013W	FYV5	P25585	152 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PRY2	YKR013W	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PRY2	YKR013W	YPL080C	Q02826	108 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PRY2	YKR013W	YBR230W-A	Q3E762	66 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PRY2	YKR013W	IGD1	P43598	195 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PRY2	YKR013W	YDR034C-A	P0C289	58 aa		5	□□□□□ -1.61
PRY2	YKR013W	TOM6	P33448	61 aa		5	□□□□□ -1.61
PRY2	YKR013W	SNA2	P56508	79 aa		5	□□□□□ -1.61
PRY2	YKR013W	YLR285C-A	Q3E771	56 aa		5	□□□□□ -1.61
PRY2	YKR013W	YNL042W-B	Q3E7Z2	85 aa		5	□□□□□ -1.61
PRY2	YKR013W	YJL127C-B	Q3E828	52 aa		5	□□□□□ -1.61
PRY2	YKR013W	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PRY2	YKR013W	EDC1	P53080	175 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PRY2	YKR013W	YDR029W	Q12111	104 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRY2	YKR013W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRY2	YKR013W	TDA2	P40045	126 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRY2	YKR013W	YGL041C-B	Q3E750	60 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRY2	YKR013W	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRY2	YKR013W	YLR156W	P0CE96	114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRY2	YKR013W	YLR159W	P0CE97	114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRY2	YKR013W	YLR161W	P0CE98	114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRY2	YKR013W	LCL2	Q08045	131 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRY2	YKR013W	Q0032	Q9ZZX7	96 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRY2	YKR013W	COX23	P38824	151 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRY2	YKR013W	ICS3	P47034	131 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRY2	YKR013W	BET1	P22804	142 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRY2	YKR013W	ECM12	O13529	151 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRY2	YKR013W	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PRY2	YKR013W	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PRY2	YKR013W	RSM18	P40033	138 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRY2	YKR013W	RPL38	P49167	78 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PRY2	YKR013W	ATP20	Q12233	115 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRY2	YKR013W	YER039C-A	P0CD97	72 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRY2	YKR013W	YGL193C	P53097	103 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRY2	YKR013W	YDR246W-A	Q3E763	66 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRY2	YKR013W	YHR213W-B	Q8TGK1	99 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRY2	YKR013W	YER187W	P40102	141 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRY2	YKR013W	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
PRY2	YKR013W	TDA8	Q6B2U8	126 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRY2	YKR013W	YCR050C	P25630	102 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRY2	YKR013W	PEX22	P39718	180 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRY2	YKR013W	RPL36B	O14455	100 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PRY2	YKR013W	YOR314W	Q12506	109 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRY2	YKR013W	YJL133C-A	Q3E7A3	74 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRY2	YKR013W	YKL069W	P36088	180 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRY2	YKR013W	YOL014W	Q08110	124 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRY2	YKR013W	DDR2	P89113	61 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRY2	YKR013W	LCL1	Q02786	101 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRY2	YKR013W	ECM19	Q06011	112 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRY2	YKR013W	YOR072W	Q08486	104 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRY2	YKR013W	HOT13	P36078	116 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRY2	YKR013W	AIM4	P38305	123 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PRY2	YKR013W	YDR182W-A	Q3E796	67 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRY2	YKR013W	YLR415C	O13578	112 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRY2	YKR013W	YEL045C	P32616	141 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PRY2	YKR013W	BSC4	P53841	131 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PRY2	YKR013W	YHR007C-A	Q07074	71 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PRY2	YKR013W	NOP10	Q6Q547	58 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PRY2	YKR013W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PRY2	YKR013W	YLR162W	Q06235	118 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRY2	YKR013W	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PRY2	YKR013W	MIC10	Q96VH5	97 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PRY2	YKR013W	RPL36A	P05745	100 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PRY2	YKR013W	MMS2	P53152	137 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PRY2	YKR013W	YGR121W-A	Q3E816	71 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PRY2	YKR013W	YJL197C-A	P0C5P0	93 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PRY2	YKR013W	YOL166W-A	Q8TGJ1	51 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PRY2	YKR013W	SPG1	P50088	95 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRY2	YKR013W	SBH1	P52870	82 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PRY2	YKR013W	LIP1	Q03579	150 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PRY2	YKR013W	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PRY2	YKR013W	YAR064W	P39563	99 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRY2	YKR013W	YOL013W-A	P0C272	63 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PRY2	YKR013W	DDR48	P18899	430 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PRY2	YKR013W	YFL067W	P43537	175 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRY2	YKR013W	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRY2	YKR013W	YOL097W-A	Q3E7Y9	61 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRY2	YKR013W	YHL005C	P38752	130 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRY2	YKR013W	YIL102C	P40488	101 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRY2	YKR013W	YLR157W-D	P0CE99	70 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRY2	YKR013W	YBR027C	P38220	110 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRY2	YKR013W	YGL149W	P53116	101 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRY2	YKR013W	KTI11	Q3E840	82 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRY2	YKR013W	RPS30A	P0CX33	63 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PRY2	YKR013W	RPS30B	P0CX34	63 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PRY2	YKR013W	YCR043C	P25361	127 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRY2	YKR013W	YOR268C	Q08734	132 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRY2	YKR013W	YGR164W	P53291	111 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRY2	YKR013W	YPR153W	Q06537	140 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRY2	YKR013W	YHR125W	P38831	101 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRY2	YKR013W	YKL065W-A	Q2V2P2	73 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRY2	YKR013W	KSH1	Q8TGJ3	72 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRY2	YKR013W	YDL012C	Q12489	107 aa		4.59	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 53.8 ms