RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564601.5

RNPS1-210, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 3

Gene RNPS1, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-210ENST00000564601 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 SLC7A9P82251 487 aa20.37■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 INCA1Q0VD86 236 aa20.37■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 LAIR1Q6GTX8 287 aa20.37■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 WDR5BQ86VZ2 330 aa20.37■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 CRYBG2Q8N1P7 616 aa20.37■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 PDZD8Q8NEN9 1154 aa20.37■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 SPATA20Q8TB22 786 aa20.37■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 OVCA2Q8WZ82 227 aa20.37■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 FBXO32Q969P5 355 aa20.37■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 EEF2KMTQ96G04 330 aa20.37■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 TIGD1Q96MW7 591 aa20.37■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 NIF3L1Q9GZT8 377 aa20.37■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 MYH10P35580 1976 aa20.37■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 TNFRSF10BO14763 440 aa20.36■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 CETN3O15182 167 aa20.36■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 ABL1P00519 1130 aa20.36■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 EPB41P11171 864 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 PXNP49023 591 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 SLC5A3P53794 718 aa20.36■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 MESP2Q0VG99 397 aa20.36■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 KRT39Q6A163 491 aa20.36■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 CCDC150Q8NCX0 1101 aa20.36■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 SLC2A14Q8TDB8 520 aa20.36■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 SMARCE1Q969G3 411 aa20.36■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 CYP3A43Q9HB55 503 aa20.36■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 FAM49BQ9NUQ9 324 aa20.36■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa20.36■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 LEFTY2O00292 366 aa20.35■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 OPRD1P41143 372 aa20.35■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 PGFP49763 221 aa20.35■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 MXI1P50539 228 aa20.35■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 SPEM2Q0P670 501 aa20.35■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 PRR23BQ6ZRT6 265 aa20.35■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 C12orf29Q8N999 325 aa20.35■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 ZMIZ2Q8NF64 920 aa20.35■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 SCAMP5Q8TAC9 235 aa20.35■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 TSG101Q99816 390 aa20.35■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 P2RY13Q9BPV8 354 aa20.35■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 CPQQ9Y646 472 aa20.35■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 STX10O60499 249 aa20.34■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 SFTPA1Q8IWL2 248 aa20.34■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 KIAA1958Q8N8K9 716 aa20.34■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 EXOC4Q96A65 974 aa20.34■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 TWNKQ96RR1 684 aa20.34■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 SMOQ99835 787 aa20.34■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 NT5C1AQ9BXI3 368 aa20.34■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa20.34■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 COMMD8Q9NX08 183 aa20.34■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 IL37Q9NZH6 218 aa20.34■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 SDK1Q7Z5N4 2213 aa20.34■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 TPRP12270 2363 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 FAM92AA1XBS5 289 aa20.33■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 CILPO75339 1184 aa20.33■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 BEST1O76090 585 aa20.33■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 NFATC1O95644 943 aa20.33■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 CYP17A1P05093 508 aa20.33■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 RETP07949 1114 aa20.33■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 FAM200BP0CF97 657 aa20.33■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 CD58P19256 250 aa20.33■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 DRD1P21728 446 aa20.33■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 SDHBP21912 280 aa20.33■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 NR1H3Q13133 447 aa20.33■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 FBXL13Q8NEE6 735 aa20.33■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 CD101Q93033 1021 aa20.33■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 SMPD4Q9NXE4 827 aa20.33■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 GMEB2Q9UKD1 530 aa20.33■□□□□ 0.85
RNPS1-210ENST00000564601 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
RNPS1-210ENST00000564601 ADORA2BP29275 332 aa20.32■□□□□ 0.84
RNPS1-210ENST00000564601 CNR2P34972 360 aa20.32■□□□□ 0.84
RNPS1-210ENST00000564601 TUBP50607 506 aa20.32■□□□□ 0.84
RNPS1-210ENST00000564601 PMS1P54277 932 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
RNPS1-210ENST00000564601 MAP3K7CLP57077 242 aa20.32■□□□□ 0.84
RNPS1-210ENST00000564601 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
RNPS1-210ENST00000564601 LRRC63Q05C16 580 aa20.32■□□□□ 0.84
RNPS1-210ENST00000564601 SNX30Q5VWJ9 437 aa20.32■□□□□ 0.84
RNPS1-210ENST00000564601 ANKRD40Q6AI12 368 aa20.32■□□□□ 0.84
RNPS1-210ENST00000564601 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa20.32■□□□□ 0.84
RNPS1-210ENST00000564601 C12orf40Q86WS4 652 aa20.32■□□□□ 0.84
RNPS1-210ENST00000564601 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
RNPS1-210ENST00000564601 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa20.32■□□□□ 0.84
RNPS1-210ENST00000564601 SEMA4DQ92854 862 aa20.32■□□□□ 0.84
RNPS1-210ENST00000564601 WBP2Q969T9 261 aa20.32■□□□□ 0.84
RNPS1-210ENST00000564601 FAXDC2Q96IV6 333 aa20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90 ms