RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	LEFTY2	O00292	366 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	MED7	O43513	233 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	TADA3	O75528	432 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	MBD3	O95983	291 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	ADH1C	P00326	375 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	PAEP	P09466	180 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	VDR	P11473	427 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	DRD1	P21728	446 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	BCAT1	P54687	386 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	PON2	Q15165	354 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF77	Q15935	545 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM270	Q6UE05	265 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	TATDN2	Q93075	761 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	CLDN23	Q96B33	292 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	OTUB2	Q96DC9	234 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	SMO	Q99835	787 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	ECT2	Q9H8V3	914 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	GCNT4	Q9P109	453 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	NAGPA	Q9UK23	515 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	SCML2	Q9UQR0	700 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	NME7	Q9Y5B8	376 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	PTPRD	P23468	1912 aa		11.96	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		11.96	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		11.96	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	TRIO	O75962	3097 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	E2F8	A0AVK6	867 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	ARNTL	O00327	626 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	TLR5	O60602	858 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	KRT5	P13647	590 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	CXCL12	P48061	93 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	MRE11	P49959	708 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	MFAP3	P55082	362 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	GCNT1	Q02742	428 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	USP4	Q13107	963 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	POTEH	Q6S545	545 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	GBP6	Q6ZN66	633 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	HINFP	Q9BQA5	517 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	CHRD	Q9H2X0	955 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	THAP9	Q9H5L6	903 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	GMIP	Q9P107	970 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	RAB23	Q9ULC3	237 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	TNFRSF10B	O14763	440 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	GFRA3	O60609	400 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	SETSIP	P0DME0	302 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	NBL1	P41271	181 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	PLA2G4A	P47712	749 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	SOX9	P48436	509 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	CACNA2D1	P54289	1103 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	RAD23B	P54727	409 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	SNX16	P57768	344 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	TNK2	Q07912	1038 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	RNF139	Q8WU17	664 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	CD101	Q93033	1021 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	TWNK	Q96RR1	684 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC22A12	Q96S37	553 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-231	ENST00000496246	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		11.94	□□□□□ -0.5

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms