RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358923.10

PDE4D-204, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-204ENST00000358923 SCINQ9Y6U3 715 aa18.74■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 M0QZ92 97 aa18.73■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 PHF2O75151 1096 aa18.73■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 LRCH4O75427 683 aa18.73■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 BEST1O76090 585 aa18.73■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 P4HA1P13674 534 aa18.73■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 COILP38432 576 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 PAK2Q13177 524 aa18.73■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 SERINC5Q86VE9 423 aa18.73■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 CD302Q8IX05 232 aa18.73■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 SLC2A14Q8TDB8 520 aa18.73■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa18.73■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 ADAM33Q9BZ11 813 aa18.73■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa18.73■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 LSM8O95777 96 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 CPLX4Q7Z7G2 160 aa18.73■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 CCDC25Q86WR0 208 aa18.73■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 RHOT1Q8IXI2 618 aa18.73■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 OSBPL8Q9BZF1 889 aa18.73■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 PIRO00625 290 aa18.72■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 TOMM70O94826 608 aa18.72■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 PAEPP09466 180 aa18.72■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 INCA1Q0VD86 236 aa18.72■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 USP4Q13107 963 aa18.72■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 MMRN1Q13201 1228 aa18.72■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 CNGA2Q16280 664 aa18.72■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 SYCP2LQ5T4T6 812 aa18.72■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 KIAA0319Q5VV43 1072 aa18.72■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 AGMOQ6ZNB7 445 aa18.72■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 FAM81AQ8TBF8 368 aa18.72■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 VCPIP1Q96JH7 1222 aa18.72■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 ERP44Q9BS26 406 aa18.72■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 VDRP11473 427 aa18.72■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 YY1P25490 414 aa18.72■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 VEGFBP49765 207 aa18.72■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 ITGA7Q13683 1181 aa18.72■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 TAF2Q6P1X5 1199 aa18.72■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 SCYL2Q6P3W7 929 aa18.72■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 VRTNQ9H8Y1 702 aa18.72■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa18.72■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 IP6K2Q9UHH9 426 aa18.72■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 TRPV2Q9Y5S1 764 aa18.72■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa18.72■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 ARL5CA6NH57 179 aa18.72■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 MED7O43513 233 aa18.72■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 TNFRSF8P28908 595 aa18.72■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 PEBP4Q96S96 227 aa18.72■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa18.72■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 COX16Q9P0S2 106 aa18.72■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 SRRDQ9UH36 339 aa18.72■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa18.71■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 ITGB1P05556 798 aa18.71■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 MAGEA8P43361 318 aa18.71■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 CYP3A43Q9HB55 503 aa18.71■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 FSCN2O14926 492 aa18.71■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 UPP2O95045 317 aa18.71■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 NDUFV1P49821 464 aa18.71■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 DUPD1Q68J44 220 aa18.71■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 ADAM2Q99965 735 aa18.71■□□□□ 0.59
PDE4D-204ENST00000358923 C5orf60A6NFR6 353 aa18.7■□□□□ 0.58
PDE4D-204ENST00000358923 SMIM23A6NLE4 172 aa18.7■□□□□ 0.58
PDE4D-204ENST00000358923 RNF8O76064 485 aa18.7■□□□□ 0.58
PDE4D-204ENST00000358923 IMPDH2P12268 514 aa18.7■□□□□ 0.58
PDE4D-204ENST00000358923 KRT17Q04695 432 aa18.7■□□□□ 0.58
PDE4D-204ENST00000358923 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
PDE4D-204ENST00000358923 GALNT15Q8N3T1 639 aa18.7■□□□□ 0.58
PDE4D-204ENST00000358923 RXFP2Q8WXD0 754 aa18.7■□□□□ 0.58
PDE4D-204ENST00000358923 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
PDE4D-204ENST00000358923 LHX5Q9H2C1 402 aa18.7■□□□□ 0.58
PDE4D-204ENST00000358923 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa18.7■□□□□ 0.58
PDE4D-204ENST00000358923 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP18.7■□□□□ 0.58
PDE4D-204ENST00000358923 DNPEPQ9ULA0 475 aa18.7■□□□□ 0.58
PDE4D-204ENST00000358923 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP18.7■□□□□ 0.58
PDE4D-204ENST00000358923 C5orf42Q9H799 3197 aa18.7■□□□□ 0.58
PDE4D-204ENST00000358923 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
PDE4D-204ENST00000358923 CYB561D2O14569 222 aa18.7■□□□□ 0.58
PDE4D-204ENST00000358923 PDGFRAP16234 1089 aa18.7■□□□□ 0.58
PDE4D-204ENST00000358923 MIPP30301 263 aa18.7■□□□□ 0.58
PDE4D-204ENST00000358923 HSD17B3P37058 310 aa18.7■□□□□ 0.58
PDE4D-204ENST00000358923 ACLYP53396 1101 aa18.7■□□□□ 0.58
PDE4D-204ENST00000358923 LPIN1Q14693 890 aa18.7■□□□□ 0.58
PDE4D-204ENST00000358923 ZDHHC24Q6UX98 284 aa18.7■□□□□ 0.58
PDE4D-204ENST00000358923 APPL2Q8NEU8 664 aa18.7■□□□□ 0.58
PDE4D-204ENST00000358923 SLITRK1Q96PX8 696 aa18.7■□□□□ 0.58
PDE4D-204ENST00000358923 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
PDE4D-204ENST00000358923 TMEM30AQ9NV96 361 aa18.7■□□□□ 0.58
PDE4D-204ENST00000358923 GRHL1Q9NZI5 618 aa18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.6 ms