RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HSF2BPO75031 334 aa22.89■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BEST1O76090 585 aa22.89■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCL5P13501 91 aa22.89■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADCY1Q08828 1119 aa22.89■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADIGQ0VDE8 80 aa22.89■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BOLA3Q53S33 107 aa22.89■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM171BQ6P995 826 aa22.89■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BBS12Q6ZW61 710 aa22.89■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VSIG1Q86XK7 387 aa22.89■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCTD6Q8NC69 237 aa22.89■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 I3L4J1 428 aa22.88■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARSEP51690 589 aa22.88■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATP11AP98196 1134 aa22.88■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDO1Q16878 200 aa22.88■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IQCKQ8N0W5 287 aa22.88■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 APBB2Q92870 758 aa22.88■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RNF208Q9H0X6 261 aa22.88■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WHRNQ9P202 907 aa22.88■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NLRC5Q86WI3 1866 aa22.87■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AGPSO00116 658 aa22.87■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DDHD2O94830 711 aa22.87■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RAB6CQ53S08 254 aa22.87■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HSP90B2PQ58FF3 399 aa22.87■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMC3Q7Z5M5 1100 aa22.87■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COLGALT2Q8IYK4 626 aa22.87■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TTC13Q8NBP0 860 aa22.87■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HSPH1Q92598 858 aa22.87■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SMARCD1Q96GM5 515 aa22.87■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PKMYT1Q99640 499 aa22.87■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RAB6CQ9H0N0 254 aa22.87■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRRC4Q9HBW1 653 aa22.87■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa22.87■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PCDHB8Q9UN66 801 aa22.87■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MDM4O15151 490 aa22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 B4GALT3O60512 393 aa22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AP1G2O75843 785 aa22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FBXO21O94952 628 aa22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ITGB1P05556 798 aa22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MATKP42679 507 aa22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HDAC4P56524 1084 aa22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PDK2Q15119 407 aa22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPDYCQ5MJ68 293 aa22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF280BQ86YH2 543 aa22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DBF4BQ8NFT6 615 aa22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM71BQ8TC56 605 aa22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FBXO25Q8TCJ0 367 aa22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SEPT8Q92599 483 aa22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ART4Q93070 314 aa22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC114Q96M63 670 aa22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SMOQ99835 787 aa22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TXLNGYQ9BZA5 131 aa22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TBC1D13Q9NVG8 400 aa22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PATJQ8NI35 1801 aa22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ENPP3O14638 875 aa22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DAB1O75553 588 aa22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CD48P09326 243 aa22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GGCXP38435 758 aa22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLTPP55058 493 aa22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAP3K7CLP57077 242 aa22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RAB41Q5JT25 222 aa22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OVOS1Q6IE37 1185 aa22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STRADAQ7RTN6 431 aa22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZMIZ2Q8NF64 920 aa22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC35B2Q8TB61 432 aa22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HASPINQ8TF76 798 aa22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DNPEPQ9ULA0 475 aa22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TET1Q8NFU7 2136 aa22.85■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF487B1APH4 448 aa22.85■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPFIA2O75334 1257 aa22.85■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SYF2O95926 243 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IVDP26440 423 aa22.85■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VCPP55072 806 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MTMR3Q13615 1198 aa22.85■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OASLQ15646 514 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAP7D3Q8IWC1 876 aa22.85■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa22.85■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 THEM5Q8N1Q8 247 aa22.85■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC89Q8N998 374 aa22.85■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MYLPFQ96A32 169 aa22.85■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ASIC3Q9UHC3 531 aa22.85■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TTC3P53804 2025 aa22.85■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CST8O60676 142 aa22.84■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ITGAVP06756 1048 aa22.84■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ITIH2P19823 946 aa22.84■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TKTL1P51854 596 aa22.84■■□□□ 1.25
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDH6P55285 790 aa22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.1 ms