RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000060956.12

Trappc1-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc1, Length 628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Grik3B1AS29 919 aa5.85□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm9992B2RWK3 458 aa5.85□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Syce3B5KM66 88 aa5.85□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 4930444G20RikD3Z741 495 aa5.85□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Plekha5E9Q6H8 1269 aa5.85□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Taf4E9QAP7 1042 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ebf3O08791 596 aa5.85□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cd46O88174 365 aa5.85□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Scrg1O88745 98 aa5.85□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 JchainP01592 159 aa5.85□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Jmjd7P0C872 316 aa5.85□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 MpoP11247 718 aa5.85□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Hoxc13P50207 328 aa5.85□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Upp1P52624 311 aa5.85□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 ArntP53762 791 aa5.85□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Psmc5P62196 406 aa5.85□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cuzd1P70412 606 aa5.85□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Hvcn1Q3U2S8 269 aa5.85□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 MyrfQ3UR85 1138 aa5.85□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Q3V0E1 1183 aa5.85□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Abi3bpQ59IW6 1179 aa5.85□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Klra7Q60654 280 aa5.85□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Vsig8Q6P3A4 417 aa5.85□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm21985Q6P6P5 1106 aa5.85□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 PdgfrlQ6PE55 375 aa5.85□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cfap97Q6ZPR1 541 aa5.85□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Unc93aQ710D3 458 aa5.85□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr412Q7TRW7 312 aa5.85□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Znf598Q80YR4 908 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Asnsd1Q8BFS9 627 aa5.85□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Lancl3Q8CD19 420 aa5.85□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ttc27Q8CD92 847 aa5.85□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Coq6Q8R1S0 476 aa5.85□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Igsf8Q8R366 611 aa5.85□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tbc1d22aQ8R5A6 516 aa5.85□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr30Q8VGD8 315 aa5.85□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr799Q8VGI7 311 aa5.85□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ddx1Q91VR5 740 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Spdl1Q923A2 608 aa5.85□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ddah1Q9CWS0 285 aa5.85□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cep89Q9CZX2 791 aa5.85□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tmprss6Q9DBI0 811 aa5.85□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 IydQ9DCX8 285 aa5.85□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 PaplnQ9EPX2 1280 aa5.85□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Hacl1Q9QXE0 581 aa5.85□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Actr10Q9QZB7 417 aa5.85□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Myo9aQ8C170 2542 aa5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 DspE9Q557 2883 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm21936A0A1Y7VJE9 144 aa5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm5788A0A1Y7VK80 144 aa5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cyp2b13A6H6J2 491 aa5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm28043E0CXC2 719 aa5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm973E9Q295 1059 aa5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Itga10E9Q6R1 1167 aa5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Raph1F2Z3U3 1266 aa5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm5039J3QNT6 144 aa5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm2035J3QP87 144 aa5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Vmn2r12L7N217 831 aa5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ptch2O35595 1182 aa5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mpp3O88910 568 aa5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Me1P06801 572 aa5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 TyrP11344 533 aa5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ms4a1P19437 291 aa5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ms4a2P20490 235 aa5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Arpp19P56212 112 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 EvcP57680 1005 aa5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Nucb2P81117 420 aa5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cdk7Q03147 346 aa5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cfap157Q0VFX2 523 aa5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Trim71Q1PSW8 855 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm2016Q3TQZ4 144 aa5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm8332Q3UTA4 144 aa5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Vps51Q3UVL4 782 aa5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 ErmnQ5EBJ4 281 aa5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ctc1Q5SUQ9 1212 aa5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Znf235Q61116 645 aa5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 RadilQ69Z89 1099 aa5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ccdc57Q6PHN1 1016 aa5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cd300lfQ6SJQ7 337 aa5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Serpinb3dQ6UKZ0 387 aa5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tbx10Q810F8 385 aa5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tmem108Q8BHE4 574 aa5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm5662Q8BX20 144 aa5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ttc39bQ8BYY4 617 aa5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 CcinQ8CDE2 588 aa5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Bola3Q8CEI1 110 aa5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mtmr3Q8K296 1196 aa5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mrpl38Q8K2M0 380 aa5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Prodh2Q8VCZ9 456 aa5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fitm1Q91V79 292 aa5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ppp2r5dQ91V89 594 aa5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pcdhga6Q91XY2 932 aa5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Prpf3Q922U1 683 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Prss28Q924N9 274 aa5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Smarcd2Q99JR8 531 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Asb11Q9CQ31 323 aa5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Emc2Q9CRD2 297 aa5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 BccipQ9CWI3 316 aa5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Krtap5-3Q9D226 196 aa5.84□□□□□ -1.47
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Etnk1Q9D4V0 363 aa5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14.4 ms