Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42.29■■■■■ 4.36
Hoxc13P50207 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Hoxc13P50207 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Hoxc13P50207 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Hoxc13P50207 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
Hoxc13P50207 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Hoxc13P50207 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
Hoxc13P50207 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
Hoxc13P50207 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Hoxc13P50207 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Hoxc13P50207 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Hoxc13P50207 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Hoxc13P50207 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
Hoxc13P50207 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Hoxc13P50207 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Hoxc13P50207 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
Hoxc13P50207 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Hoxc13P50207 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Hoxc13P50207 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Hoxc13P50207 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Hoxc13P50207 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Hoxc13P50207 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Hoxc13P50207 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Hoxc13P50207 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Hoxc13P50207 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Hoxc13P50207 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
Hoxc13P50207 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Hoxc13P50207 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Hoxc13P50207 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Hoxc13P50207 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Hoxc13P50207 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
Hoxc13P50207 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Hoxc13P50207 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Hoxc13P50207 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Hoxc13P50207 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Hoxc13P50207 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Hoxc13P50207 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Hoxc13P50207 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Hoxc13P50207 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Hoxc13P50207 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Hoxc13P50207 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Hoxc13P50207 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Hoxc13P50207 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Hoxc13P50207 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Hoxc13P50207 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Hoxc13P50207 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Hoxc13P50207 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Hoxc13P50207 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Hoxc13P50207 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Hoxc13P50207 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Hoxc13P50207 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Hoxc13P50207 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Hoxc13P50207 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Hoxc13P50207 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Hoxc13P50207 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Hoxc13P50207 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Hoxc13P50207 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Hoxc13P50207 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Hoxc13P50207 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Hoxc13P50207 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Hoxc13P50207 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Hoxc13P50207 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Hoxc13P50207 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Hoxc13P50207 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Hoxc13P50207 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Hoxc13P50207 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Hoxc13P50207 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Hoxc13P50207 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Hoxc13P50207 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Hoxc13P50207 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Hoxc13P50207 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Hoxc13P50207 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Hoxc13P50207 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Hoxc13P50207 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
Hoxc13P50207 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
Hoxc13P50207 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Hoxc13P50207 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
Hoxc13P50207 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Hoxc13P50207 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Hoxc13P50207 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Hoxc13P50207 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Hoxc13P50207 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Hoxc13P50207 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
Hoxc13P50207 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Hoxc13P50207 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Hoxc13P50207 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Hoxc13P50207 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Hoxc13P50207 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Hoxc13P50207 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Hoxc13P50207 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Hoxc13P50207 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Hoxc13P50207 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Hoxc13P50207 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Hoxc13P50207 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Hoxc13P50207 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Hoxc13P50207 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Hoxc13P50207 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Hoxc13P50207 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Hoxc13P50207 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Hoxc13P50207 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms