Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41.77■■■■■ 4.28
Krtap5-3Q9D226 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Krtap5-3Q9D226 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Krtap5-3Q9D226 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Krtap5-3Q9D226 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Krtap5-3Q9D226 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
Krtap5-3Q9D226 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Krtap5-3Q9D226 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
Krtap5-3Q9D226 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
Krtap5-3Q9D226 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Krtap5-3Q9D226 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Krtap5-3Q9D226 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
Krtap5-3Q9D226 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Krtap5-3Q9D226 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
Krtap5-3Q9D226 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Krtap5-3Q9D226 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Krtap5-3Q9D226 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Krtap5-3Q9D226 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Krtap5-3Q9D226 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Krtap5-3Q9D226 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Krtap5-3Q9D226 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Krtap5-3Q9D226 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Krtap5-3Q9D226 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Krtap5-3Q9D226 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Krtap5-3Q9D226 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Krtap5-3Q9D226 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Krtap5-3Q9D226 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Krtap5-3Q9D226 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Krtap5-3Q9D226 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Krtap5-3Q9D226 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Krtap5-3Q9D226 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Krtap5-3Q9D226 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Krtap5-3Q9D226 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
Krtap5-3Q9D226 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Krtap5-3Q9D226 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Krtap5-3Q9D226 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Krtap5-3Q9D226 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Krtap5-3Q9D226 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Krtap5-3Q9D226 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Krtap5-3Q9D226 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Krtap5-3Q9D226 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Krtap5-3Q9D226 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Krtap5-3Q9D226 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Krtap5-3Q9D226 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Krtap5-3Q9D226 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Krtap5-3Q9D226 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Krtap5-3Q9D226 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Krtap5-3Q9D226 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Krtap5-3Q9D226 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Krtap5-3Q9D226 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Krtap5-3Q9D226 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Krtap5-3Q9D226 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Krtap5-3Q9D226 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Krtap5-3Q9D226 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Krtap5-3Q9D226 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Krtap5-3Q9D226 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Krtap5-3Q9D226 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Krtap5-3Q9D226 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Krtap5-3Q9D226 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Krtap5-3Q9D226 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Krtap5-3Q9D226 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Krtap5-3Q9D226 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Krtap5-3Q9D226 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Krtap5-3Q9D226 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Krtap5-3Q9D226 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Krtap5-3Q9D226 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Krtap5-3Q9D226 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Krtap5-3Q9D226 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Krtap5-3Q9D226 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Krtap5-3Q9D226 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Krtap5-3Q9D226 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Krtap5-3Q9D226 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Krtap5-3Q9D226 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Krtap5-3Q9D226 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Krtap5-3Q9D226 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Krtap5-3Q9D226 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Krtap5-3Q9D226 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Krtap5-3Q9D226 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Krtap5-3Q9D226 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Krtap5-3Q9D226 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Krtap5-3Q9D226 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Krtap5-3Q9D226 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Krtap5-3Q9D226 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Krtap5-3Q9D226 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Krtap5-3Q9D226 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Krtap5-3Q9D226 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Krtap5-3Q9D226 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Krtap5-3Q9D226 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Krtap5-3Q9D226 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Krtap5-3Q9D226 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Krtap5-3Q9D226 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Krtap5-3Q9D226 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Krtap5-3Q9D226 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Krtap5-3Q9D226 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Krtap5-3Q9D226 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Krtap5-3Q9D226 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Krtap5-3Q9D226 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Krtap5-3Q9D226 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Krtap5-3Q9D226 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Krtap5-3Q9D226 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms