RNA–Protein interactions for RNA: YLR008C

PAM18, Transcript of Subunit of the import motor (PAM complex), yeast

Gene PAM18, Length 507 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM18	YLR008C	YHR173C	P38864	112 aa		2.83	□□□□□ -1.96
PAM18	YLR008C	PAU7	P39545	55 aa		2.83	□□□□□ -1.96
PAM18	YLR008C	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	2.83	□□□□□ -1.96
PAM18	YLR008C	YMR007W	Q03675	126 aa		2.83	□□□□□ -1.96
PAM18	YLR008C	DAD1	Q12248	94 aa		2.83	□□□□□ -1.96
PAM18	YLR008C	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		2.83	□□□□□ -1.96
PAM18	YLR008C	ENV10	Q99382	181 aa		2.83	□□□□□ -1.96
PAM18	YLR008C	VPS13	Q07878	3144 aa		2.82	□□□□□ -1.96
PAM18	YLR008C	BRP1	P53194	125 aa		2.82	□□□□□ -1.96
PAM18	YLR008C	NAT5	Q08689	176 aa		2.82	□□□□□ -1.96
PAM18	YLR008C	OST5	Q92316	86 aa		2.82	□□□□□ -1.96
PAM18	YLR008C	DCV1	P43595	202 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PAM18	YLR008C	YPR153W	Q06537	140 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PAM18	YLR008C	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
PAM18	YLR008C	YDL157C	Q12082	118 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PAM18	YLR008C	YPR013C	Q12145	317 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PAM18	YLR008C	YDR119W-A	Q2V2P9	66 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PAM18	YLR008C	YBL071C	P38185	102 aa		2.8	□□□□□ -1.96
PAM18	YLR008C	YER084W	P40057	128 aa		2.8	□□□□□ -1.96
PAM18	YLR008C	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
PAM18	YLR008C	SIP18	P50263	79 aa		2.8	□□□□□ -1.96
PAM18	YLR008C	ICY1	Q04329	127 aa		2.8	□□□□□ -1.96
PAM18	YLR008C	YOL118C	Q08259	102 aa		2.8	□□□□□ -1.96
PAM18	YLR008C	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		2.8	□□□□□ -1.96
PAM18	YLR008C	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		2.8	□□□□□ -1.96
PAM18	YLR008C	YLR236C	A0A023PZG4	107 aa		2.79	□□□□□ -1.96
PAM18	YLR008C	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
PAM18	YLR008C	RPS23B	P0CX30	145 aa		2.79	□□□□□ -1.96
PAM18	YLR008C	SEC11	P15367	167 aa		2.79	□□□□□ -1.96
PAM18	YLR008C	YHL005C	P38752	130 aa		2.79	□□□□□ -1.96
PAM18	YLR008C	YIR020C	P40575	100 aa		2.79	□□□□□ -1.96
PAM18	YLR008C	YPR195C	Q06594	109 aa		2.79	□□□□□ -1.96
PAM18	YLR008C	PPT2	Q12036	173 aa		2.79	□□□□□ -1.96
PAM18	YLR008C	RTC6	O14464	93 aa		2.78	□□□□□ -1.96
PAM18	YLR008C	YJL197C-A	P0C5P0	93 aa		2.78	□□□□□ -1.96
PAM18	YLR008C	TOM6	P33448	61 aa		2.78	□□□□□ -1.96
PAM18	YLR008C	RSM18	P40033	138 aa		2.78	□□□□□ -1.96
PAM18	YLR008C	YIL163C	P40448	117 aa		2.78	□□□□□ -1.96
PAM18	YLR008C	YFL051C	P43552	160 aa		2.78	□□□□□ -1.96
PAM18	YLR008C	YGL149W	P53116	101 aa		2.78	□□□□□ -1.96
PAM18	YLR008C	RGM1	Q00453	211 aa		2.78	□□□□□ -1.96
PAM18	YLR008C	FIT2	Q08906	153 aa		2.78	□□□□□ -1.96
PAM18	YLR008C	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		2.78	□□□□□ -1.96
PAM18	YLR008C	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
PAM18	YLR008C	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
PAM18	YLR008C	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
PAM18	YLR008C	YIL014C-A	Q02598	104 aa		2.77	□□□□□ -1.97
PAM18	YLR008C	YPI1	P43587	155 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PAM18	YLR008C	YGL260W	P53056	76 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PAM18	YLR008C	YIL102C-A	Q2V2P5	75 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PAM18	YLR008C	CMC4	Q3E7A9	73 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PAM18	YLR008C	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PAM18	YLR008C	FAB1	P34756	2278 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PAM18	YLR008C	UTH1	P36135	365 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PAM18	YLR008C	ATX1	P38636	73 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PAM18	YLR008C	KRE9	P39005	276 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PAM18	YLR008C	IMP2	P46972	177 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PAM18	YLR008C	ICS3	P47034	131 aa		2.75	□□□□□ -1.97
PAM18	YLR008C	COX8	P04039	78 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PAM18	YLR008C	COX23	P38824	151 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PAM18	YLR008C	LST8	P41318	303 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PAM18	YLR008C	YLR194C	Q05777	254 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PAM18	YLR008C	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PAM18	YLR008C	YNL198C	P40166	100 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PAM18	YLR008C	TOM7	P53507	60 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PAM18	YLR008C	DAD4	P69851	72 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PAM18	YLR008C	MGR2	Q02889	113 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PAM18	YLR008C	TAO3	P40468	2376 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PAM18	YLR008C	YBR209W	P38311	105 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PAM18	YLR008C	TOS6	P48560	102 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PAM18	YLR008C	YDR381C-A	Q3E6R5	114 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PAM18	YLR008C	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
PAM18	YLR008C	PFY1	P07274	126 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PAM18	YLR008C	QCR8	P08525	94 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PAM18	YLR008C	YHL037C	P38733	133 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PAM18	YLR008C	YEL014C	P39999	101 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PAM18	YLR008C	MIX17	Q03667	156 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PAM18	YLR008C	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PAM18	YLR008C	CCW14	O13547	238 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PAM18	YLR008C	RPL36B	O14455	100 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
PAM18	YLR008C	RPL36A	P05745	100 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
PAM18	YLR008C	POR2	P40478	281 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PAM18	YLR008C	YDR114C	Q04597	100 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PAM18	YLR008C	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PAM18	YLR008C	RPL39	P04650	51 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PAM18	YLR008C	NHP2	P32495	156 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
PAM18	YLR008C	YBR027C	P38220	110 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PAM18	YLR008C	YHR022C	P38763	256 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PAM18	YLR008C	SPI1	P40092	148 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PAM18	YLR008C	YFL041W-A	Q3E817	63 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PAM18	YLR008C	SED1	Q01589	338 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PAM18	YLR008C	YPL038W-A	Q3E7B4	63 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PAM18	YLR008C	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
PAM18	YLR008C	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
PAM18	YLR008C	YMR141C	P40211	102 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PAM18	YLR008C	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
PAM18	YLR008C	HPA2	Q06592	156 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PAM18	YLR008C	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PAM18	YLR008C	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PAM18	YLR008C	HMRA2	P0CY13	119 aa		2.66	□□□□□ -1.98

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