RNA–Protein interactions for RNA: YJL164C

TPK1, Transcript of cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit, yeast

Gene TPK1, Length 1,194 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TPK1	YJL164C	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
TPK1	YJL164C	MRPL39	P36533	70 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TPK1	YJL164C	YBL071C	P38185	102 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TPK1	YJL164C	HUA1	P40325	198 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TPK1	YJL164C	FHN1	P53279	174 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TPK1	YJL164C	API2	Q04413	109 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TPK1	YJL164C	SPG4	Q04438	115 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TPK1	YJL164C	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TPK1	YJL164C	MIG3	P39943	394 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TPK1	YJL164C	SRL1	Q08673	210 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TPK1	YJL164C	YGR121W-A	Q3E816	71 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TPK1	YJL164C	QCR8	P08525	94 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TPK1	YJL164C	PCP1	P53259	346 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TPK1	YJL164C	YOL160W	Q08321	113 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TPK1	YJL164C	PRM7	Q12459	698 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TPK1	YJL164C	YAL064W	P39711	94 aa		5	□□□□□ -1.61
TPK1	YJL164C	ATP15	P21306	62 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TPK1	YJL164C	YEL045C	P32616	141 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TPK1	YJL164C	SHU1	P38751	150 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TPK1	YJL164C	YJR107C-A	P0CT86	78 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TPK1	YJL164C	DDR48	P18899	430 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TPK1	YJL164C	YMR141C	P40211	102 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TPK1	YJL164C	YMR122C	Q03879	124 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TPK1	YJL164C	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TPK1	YJL164C	YER188C-A	P0C0V2	99 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TPK1	YJL164C	YCR043C	P25361	127 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TPK1	YJL164C	YLR111W	Q12528	110 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TPK1	YJL164C	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TPK1	YJL164C	RPS23B	P0CX30	145 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TPK1	YJL164C	YCR022C	P25620	114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TPK1	YJL164C	HSP150	P32478	413 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TPK1	YJL164C	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TPK1	YJL164C	MRPS12	P53732	153 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TPK1	YJL164C	YNL190W	P53872	204 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TPK1	YJL164C	RNH203	Q12338	110 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TPK1	YJL164C	FYV5	P25585	152 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TPK1	YJL164C	UTH1	P36135	365 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TPK1	YJL164C	YER135C	P40082	130 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TPK1	YJL164C	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
TPK1	YJL164C	YIR020C	P40575	100 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TPK1	YJL164C	RGM1	Q00453	211 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TPK1	YJL164C	TRS23	Q03784	219 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TPK1	YJL164C	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
TPK1	YJL164C	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TPK1	YJL164C	YHL037C	P38733	133 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TPK1	YJL164C	YFL015C	P43578	164 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TPK1	YJL164C	YPS5	P53057	165 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TPK1	YJL164C	YGR018C	P53211	109 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TPK1	YJL164C	YGR035W-A	Q45U48	73 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TPK1	YJL164C	YGR045C	P53229	120 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TPK1	YJL164C	SED1	Q01589	338 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TPK1	YJL164C	NOP10	Q6Q547	58 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TPK1	YJL164C	HUB1	Q6Q546	73 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TPK1	YJL164C	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TPK1	YJL164C	RRT1	P38192	103 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPK1	YJL164C	ATP18	P81450	59 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPK1	YJL164C	YPR153W	Q06537	140 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPK1	YJL164C	YLR236C	A0A023PZG4	107 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TPK1	YJL164C	EDC1	P53080	175 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TPK1	YJL164C	YMR244W	Q04018	355 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TPK1	YJL164C	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TPK1	YJL164C	RPS30A	P0CX33	63 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TPK1	YJL164C	RPS30B	P0CX34	63 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TPK1	YJL164C	REE1	P40893	198 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPK1	YJL164C	RPL38	P49167	78 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TPK1	YJL164C	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TPK1	YJL164C	QCR10	P37299	77 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPK1	YJL164C	KRE9	P39005	276 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPK1	YJL164C	YOL166W-A	Q8TGJ1	51 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPK1	YJL164C	YJR146W	P47174	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPK1	YJL164C	TVP23	P38962	199 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TPK1	YJL164C	YCR095W-A	Q3E787	52 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TPK1	YJL164C	LIP1	Q03579	150 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TPK1	YJL164C	HOT13	P36078	116 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TPK1	YJL164C	RPR2	P40571	144 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TPK1	YJL164C	SNA2	P56508	79 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TPK1	YJL164C	YOL014W	Q08110	124 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TPK1	YJL164C	YOR034C-A	Q3E735	80 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TPK1	YJL164C	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TPK1	YJL164C	MRPS8	Q03799	155 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TPK1	YJL164C	YFR032C-B	Q8TGU2	87 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TPK1	YJL164C	YIL102C	P40488	101 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TPK1	YJL164C	YDR114C	Q04597	100 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TPK1	YJL164C	SOM1	Q05676	74 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TPK1	YJL164C	YFR009W-A	P0C5M9	85 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TPK1	YJL164C	SPC1	P46965	94 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TPK1	YJL164C	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TPK1	YJL164C	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
TPK1	YJL164C	YEL008W	P40001	126 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TPK1	YJL164C	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
TPK1	YJL164C	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
TPK1	YJL164C	YGL149W	P53116	101 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TPK1	YJL164C	BSC4	P53841	131 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TPK1	YJL164C	YAR023C	D6VPM8	179 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TPK1	YJL164C	YCR001W	P25347	104 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TPK1	YJL164C	MRX7	P53869	86 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TPK1	YJL164C	YDR010C	Q12426	110 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TPK1	YJL164C	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TPK1	YJL164C	SDH6	Q3E785	79 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TPK1	YJL164C	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65

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