RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455157.6

SSUH2-208, Transcript of ssu-2 homolog (C. elegans), human

TSL 2

Gene SSUH2, Length 3,219 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSUH2-208	ENST00000455157	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	TMC2	Q8TDI7	906 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	BTBD7	Q9P203	1132 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157		K7ERI5	159 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	TXNDC9	O14530	226 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	COPE	O14579	308 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	MAP3K6	O95382	1288 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	PSMG1	O95456	288 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	ABHD2	P08910	425 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	GRIA2	P42262	883 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	OSTN	P61366	133 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	VPS72	Q15906	364 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	DACT2	Q5SW24	774 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	KCTD6	Q8NC69	237 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	GAB3	Q8WWW8	586 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	THTPA	Q9BU02	230 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	STRA6	Q9BX79	667 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	FEM1B	Q9UK73	627 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157		H7C0C1	242 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	C2CD2L	O14523	706 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	11.84	□□□□□ -0.51	3e-8	■■■□□ 17.9
SSUH2-208	ENST00000455157	KLRC2	P26717	231 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	ATP5O	P48047	213 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	NOMO3	P69849	1222 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	SPP2	Q13103	211 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	DGKZ	Q13574	1117 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	TTC7B	Q86TV6	843 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF677	Q86XU0	584 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	PCNT	O95613	3336 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	NDUFB5	O43674	189 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	WEE2	P0C1S8	567 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	HAL	P42357	657 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	JAK3	P52333	1124 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	NRL	P54845	237 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	ITGA7	Q13683	1181 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	ANO5	Q75V66	913 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	MON1B	Q7L1V2	547 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	ALLC	Q8N6M5	410 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	SNX27	Q96L92	541 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSUH2-208	ENST00000455157	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SSUH2-208	ENST00000455157	OPHN1	O60890	802 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SSUH2-208	ENST00000455157	ENTPD3	O75355	529 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SSUH2-208	ENST00000455157	OR6B1	O95007	311 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SSUH2-208	ENST00000455157	PDGFRB	P09619	1106 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SSUH2-208	ENST00000455157	NCKAP1L	P55160	1127 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SSUH2-208	ENST00000455157	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	11.83	□□□□□ -0.52
SSUH2-208	ENST00000455157	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	11.83	□□□□□ -0.52
SSUH2-208	ENST00000455157	KRT76	Q01546	638 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SSUH2-208	ENST00000455157	NCOA4	Q13772	614 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SSUH2-208	ENST00000455157	ITGA9	Q13797	1035 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SSUH2-208	ENST00000455157	BCL2A1	Q16548	175 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SSUH2-208	ENST00000455157	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SSUH2-208	ENST00000455157	C4orf19	Q8IY42	314 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SSUH2-208	ENST00000455157	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SSUH2-208	ENST00000455157	MIPEP	Q99797	713 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SSUH2-208	ENST00000455157	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SSUH2-208	ENST00000455157	HESX1	Q9UBX0	185 aa		11.83	□□□□□ -0.52

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.4 ms