RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000090006.11

Itgb1-201, Transcript of Integrin beta-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Itgb1, Length 3,815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Tet3Q8BG87 1668 aa14.92□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Pds5aQ6A026 1332 aa14.92□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Zmynd8A2A484 1235 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Gm3893E9Q1I1 302 aa14.92□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 2610028H24RikG5E8K1 270 aa14.92□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 NumblO08919 604 aa14.92□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Serpina1cQ00896 412 aa14.92□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Tfdp1Q08639 410 aa14.92□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Samd11Q1RNF8 542 aa14.92□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Mettl17Q3U2U7 461 aa14.92□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 PRAG1Q571I4 1179 aa14.92□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Pla2g4cQ64GA5 597 aa14.92□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Acot11Q8VHQ9 594 aa14.92□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Crtc3Q91X84 619 aa14.92□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Inpp4aQ9EPW0 939 aa14.92□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Asap1Q9QWY8 1147 aa14.92□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Ankfn1A0A140LIW7 1083 aa14.92□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Zfp558E9Q1J0 407 aa14.92□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Inpp5aE9QAS7 422 aa14.92□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Prl3b1P09586 222 aa14.92□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Tnnc2P20801 160 aa14.92□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Eno3P21550 434 aa14.92□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Nedd8P29595 81 aa14.92□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Vamp7P70280 220 aa14.92□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 CiitaP79621 1155 aa14.92□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Nt5dc3Q3UHB1 546 aa14.92□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Snx25Q3ZT31 840 aa14.92□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Ankrd13bQ5F259 626 aa14.92□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Olfr295Q7TS08 309 aa14.92□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Vmn2r43Q80Z08 845 aa14.92□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Amhr2Q8K592 568 aa14.92□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Tssk3Q9D2E1 268 aa14.92□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Map2P20357 1828 aa14.92□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Myh11O08638 1972 aa14.91□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Ccdc8D3YZV8 685 aa14.91□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Zscan4bE9Q3G0 505 aa14.91□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Pcdh9F8VPK8 1237 aa14.91□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Adcy1O88444 1118 aa14.91□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Pdha2P35487 391 aa14.91□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Stxbp5lQ5DQR4 1185 aa14.91□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Tcf12Q61286 706 aa14.91□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Magea3Q6T340 320 aa14.91□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Cpsf7Q8BTV2 471 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Samd4aQ8CBY1 711 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Q9DAQ4 598 aa14.91□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Gm13941A2AJ38 245 aa14.91□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Klhdc7aA2APT9 773 aa14.91□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 4930544D05RikJ3QK56 214 aa14.91□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Spin2fJ3QPU0 254 aa14.91□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Hcn2O88703 863 aa14.91□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 HdcP23738 662 aa14.91□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Tmem247Q497K7 211 aa14.91□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Eif2dQ61211 570 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 E2f7Q6S7F2 904 aa14.91□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Q8BGA7 448 aa14.91□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Bhlhe22Q8C6A8 355 aa14.91□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Slc39a3Q99K24 317 aa14.91□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Tex13bQ99MW5 186 aa14.91□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Vta1Q9CR26 309 aa14.91□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Rad18Q9QXK2 509 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Gm45233A0A0N4SVE0 221 aa14.91□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Wdr95D3Z7A8 784 aa14.91□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Fbrsl1E9Q9T0 1031 aa14.91□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Cyp4f17G3UW78 524 aa14.91□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Ncam1P13595 1115 aa14.91□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Hk1P17710 974 aa14.91□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 SagP20443 403 aa14.91□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Il12bP43432 335 aa14.91□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Tubgcp3P58854 905 aa14.91□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Stip1Q60864 543 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Itih1Q61702 907 aa14.91□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 WaplQ65Z40 1200 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Pqlc1Q80XM9 271 aa14.91□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 TxlngQ8BHN1 524 aa14.91□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Kiaa0391Q8JZY4 584 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Cdc26Q99JP4 85 aa14.91□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Cyp4f16Q99N17 524 aa14.91□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 EtfbQ9DCW4 255 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Tsc22d3Q9Z2S7 137 aa14.91□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Apol11aE9PZG0 334 aa14.9□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Pitpnm1O35954 1243 aa14.9□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Casp2P29594 452 aa14.9□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 InaP46660 501 aa14.9□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Hspa4lP48722 838 aa14.9□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Krt26Q3TRJ4 462 aa14.9□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Sp4Q62445 782 aa14.9□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Gpr156Q6PCP7 798 aa14.9□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Olfr814Q7TRH4 310 aa14.9□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Lrrc27Q80YS5 523 aa14.9□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 P2ry10Q8BFU7 328 aa14.9□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Abraxas1Q8BPZ8 407 aa14.9□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Stxbp5Q8K400 1152 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Slc18a1Q8R090 521 aa14.9□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 PlvapQ91VC4 438 aa14.9□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Med10Q9CXU0 135 aa14.9□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Ccdc77Q9CZH8 489 aa14.9□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Ndc80Q9D0F1 642 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Tcirg1Q9JHF5 834 aa14.9□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 Epb41l3Q9WV92 929 aa14.9□□□□□ -0.02
Itgb1-201ENSMUST00000090006 DldO08749 509 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.2 ms