Protein–RNA interactions for Protein: P09586

Prl3b1, Prolactin-3B1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prl3b1P09586 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
Prl3b1P09586 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Prl3b1P09586 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Prl3b1P09586 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Prl3b1P09586 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Prl3b1P09586 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Prl3b1P09586 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Prl3b1P09586 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Prl3b1P09586 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Prl3b1P09586 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Prl3b1P09586 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Prl3b1P09586 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Prl3b1P09586 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Prl3b1P09586 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Prl3b1P09586 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Prl3b1P09586 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Prl3b1P09586 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Prl3b1P09586 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Prl3b1P09586 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Prl3b1P09586 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Prl3b1P09586 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Prl3b1P09586 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Prl3b1P09586 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Prl3b1P09586 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Prl3b1P09586 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Prl3b1P09586 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Prl3b1P09586 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Prl3b1P09586 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Prl3b1P09586 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Prl3b1P09586 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Prl3b1P09586 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Prl3b1P09586 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Prl3b1P09586 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Prl3b1P09586 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Prl3b1P09586 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Prl3b1P09586 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Prl3b1P09586 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Prl3b1P09586 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Prl3b1P09586 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Prl3b1P09586 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Prl3b1P09586 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prl3b1P09586 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prl3b1P09586 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prl3b1P09586 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Prl3b1P09586 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prl3b1P09586 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Prl3b1P09586 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Prl3b1P09586 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Prl3b1P09586 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Prl3b1P09586 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Prl3b1P09586 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Prl3b1P09586 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Prl3b1P09586 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Prl3b1P09586 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prl3b1P09586 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Prl3b1P09586 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prl3b1P09586 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prl3b1P09586 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prl3b1P09586 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Prl3b1P09586 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Prl3b1P09586 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prl3b1P09586 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prl3b1P09586 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Prl3b1P09586 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prl3b1P09586 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prl3b1P09586 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prl3b1P09586 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prl3b1P09586 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prl3b1P09586 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Prl3b1P09586 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prl3b1P09586 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prl3b1P09586 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prl3b1P09586 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prl3b1P09586 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prl3b1P09586 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prl3b1P09586 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prl3b1P09586 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prl3b1P09586 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prl3b1P09586 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Prl3b1P09586 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prl3b1P09586 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Prl3b1P09586 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prl3b1P09586 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prl3b1P09586 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prl3b1P09586 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Prl3b1P09586 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prl3b1P09586 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Prl3b1P09586 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prl3b1P09586 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prl3b1P09586 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prl3b1P09586 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prl3b1P09586 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prl3b1P09586 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prl3b1P09586 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prl3b1P09586 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prl3b1P09586 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prl3b1P09586 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Prl3b1P09586 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prl3b1P09586 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prl3b1P09586 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms