Protein–RNA interactions for Protein: P20443

Sag, S-arrestin, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SagP20443 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
SagP20443 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SagP20443 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SagP20443 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SagP20443 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
SagP20443 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SagP20443 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SagP20443 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SagP20443 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SagP20443 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
SagP20443 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SagP20443 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SagP20443 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SagP20443 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
SagP20443 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SagP20443 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
SagP20443 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SagP20443 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SagP20443 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SagP20443 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SagP20443 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SagP20443 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SagP20443 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SagP20443 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
SagP20443 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SagP20443 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SagP20443 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SagP20443 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SagP20443 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SagP20443 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SagP20443 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SagP20443 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
SagP20443 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SagP20443 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SagP20443 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SagP20443 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SagP20443 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SagP20443 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SagP20443 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SagP20443 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SagP20443 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SagP20443 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SagP20443 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SagP20443 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SagP20443 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SagP20443 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SagP20443 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SagP20443 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SagP20443 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SagP20443 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SagP20443 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SagP20443 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SagP20443 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SagP20443 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SagP20443 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SagP20443 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SagP20443 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SagP20443 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SagP20443 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SagP20443 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SagP20443 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SagP20443 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SagP20443 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SagP20443 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SagP20443 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SagP20443 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SagP20443 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SagP20443 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SagP20443 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SagP20443 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SagP20443 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SagP20443 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SagP20443 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SagP20443 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SagP20443 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SagP20443 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SagP20443 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SagP20443 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SagP20443 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SagP20443 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SagP20443 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SagP20443 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SagP20443 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SagP20443 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SagP20443 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SagP20443 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SagP20443 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SagP20443 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SagP20443 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SagP20443 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SagP20443 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SagP20443 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SagP20443 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SagP20443 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SagP20443 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SagP20443 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SagP20443 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SagP20443 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SagP20443 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SagP20443 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms