Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
Snx25Q3ZT31 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Snx25Q3ZT31 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Snx25Q3ZT31 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
Snx25Q3ZT31 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Snx25Q3ZT31 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
Snx25Q3ZT31 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Snx25Q3ZT31 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Snx25Q3ZT31 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Snx25Q3ZT31 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Snx25Q3ZT31 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Snx25Q3ZT31 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Snx25Q3ZT31 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Snx25Q3ZT31 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Snx25Q3ZT31 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Snx25Q3ZT31 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Snx25Q3ZT31 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Snx25Q3ZT31 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Snx25Q3ZT31 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Snx25Q3ZT31 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Snx25Q3ZT31 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Snx25Q3ZT31 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Snx25Q3ZT31 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Snx25Q3ZT31 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Snx25Q3ZT31 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Snx25Q3ZT31 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Snx25Q3ZT31 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Snx25Q3ZT31 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Snx25Q3ZT31 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
Snx25Q3ZT31 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Snx25Q3ZT31 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Snx25Q3ZT31 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Snx25Q3ZT31 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Snx25Q3ZT31 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Snx25Q3ZT31 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Snx25Q3ZT31 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Snx25Q3ZT31 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Snx25Q3ZT31 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Snx25Q3ZT31 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Snx25Q3ZT31 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Snx25Q3ZT31 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Snx25Q3ZT31 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Snx25Q3ZT31 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Snx25Q3ZT31 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Snx25Q3ZT31 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Snx25Q3ZT31 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Snx25Q3ZT31 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Snx25Q3ZT31 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Snx25Q3ZT31 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Snx25Q3ZT31 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
Snx25Q3ZT31 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Snx25Q3ZT31 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Snx25Q3ZT31 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Snx25Q3ZT31 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Snx25Q3ZT31 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Snx25Q3ZT31 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Snx25Q3ZT31 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Snx25Q3ZT31 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Snx25Q3ZT31 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Snx25Q3ZT31 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Snx25Q3ZT31 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Snx25Q3ZT31 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Snx25Q3ZT31 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Snx25Q3ZT31 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Snx25Q3ZT31 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Snx25Q3ZT31 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Snx25Q3ZT31 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Snx25Q3ZT31 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Snx25Q3ZT31 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Snx25Q3ZT31 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Snx25Q3ZT31 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Snx25Q3ZT31 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Snx25Q3ZT31 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Snx25Q3ZT31 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Snx25Q3ZT31 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Snx25Q3ZT31 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Snx25Q3ZT31 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Snx25Q3ZT31 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Snx25Q3ZT31 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Snx25Q3ZT31 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Snx25Q3ZT31 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Snx25Q3ZT31 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Snx25Q3ZT31 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Snx25Q3ZT31 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Snx25Q3ZT31 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Snx25Q3ZT31 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Snx25Q3ZT31 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Snx25Q3ZT31 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Snx25Q3ZT31 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Snx25Q3ZT31 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Snx25Q3ZT31 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Snx25Q3ZT31 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Snx25Q3ZT31 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Snx25Q3ZT31 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Snx25Q3ZT31 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Snx25Q3ZT31 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Snx25Q3ZT31 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Snx25Q3ZT31 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Snx25Q3ZT31 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Snx25Q3ZT31 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms