Protein–RNA interactions for Protein: P29594

Casp2, Caspase-2, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp2P29594 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
Casp2P29594 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Casp2P29594 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Casp2P29594 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Casp2P29594 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Casp2P29594 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Casp2P29594 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Casp2P29594 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Casp2P29594 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Casp2P29594 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Casp2P29594 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Casp2P29594 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Casp2P29594 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Casp2P29594 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Casp2P29594 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Casp2P29594 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Casp2P29594 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Casp2P29594 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Casp2P29594 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Casp2P29594 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Casp2P29594 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Casp2P29594 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Casp2P29594 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Casp2P29594 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Casp2P29594 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Casp2P29594 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Casp2P29594 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Casp2P29594 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Casp2P29594 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Casp2P29594 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Casp2P29594 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Casp2P29594 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Casp2P29594 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Casp2P29594 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Casp2P29594 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Casp2P29594 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Casp2P29594 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Casp2P29594 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Casp2P29594 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Casp2P29594 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Casp2P29594 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Casp2P29594 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Casp2P29594 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Casp2P29594 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Casp2P29594 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Casp2P29594 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Casp2P29594 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Casp2P29594 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Casp2P29594 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Casp2P29594 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Casp2P29594 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Casp2P29594 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Casp2P29594 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Casp2P29594 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Casp2P29594 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Casp2P29594 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Casp2P29594 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Casp2P29594 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Casp2P29594 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Casp2P29594 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Casp2P29594 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Casp2P29594 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Casp2P29594 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Casp2P29594 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Casp2P29594 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Casp2P29594 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Casp2P29594 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Casp2P29594 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Casp2P29594 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Casp2P29594 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Casp2P29594 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Casp2P29594 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Casp2P29594 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Casp2P29594 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Casp2P29594 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Casp2P29594 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Casp2P29594 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Casp2P29594 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Casp2P29594 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Casp2P29594 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Casp2P29594 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Casp2P29594 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Casp2P29594 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Casp2P29594 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Casp2P29594 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Casp2P29594 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Casp2P29594 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Casp2P29594 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Casp2P29594 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Casp2P29594 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Casp2P29594 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Casp2P29594 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Casp2P29594 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Casp2P29594 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Casp2P29594 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Casp2P29594 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Casp2P29594 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Casp2P29594 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Casp2P29594 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Casp2P29594 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms