RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031145.6

Pdcl2-201, Transcript of Phosducin-like protein 2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdcl2, Length 1,181 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 TbataQ7TSD4 393 aa8.44□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Polr2eQ80UW8 210 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 TbckQ8BM85 762 aa8.44□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Pi15Q8BS03 258 aa8.44□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 BoraQ8BS90 525 aa8.44□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ccdc169Q8BXX9 214 aa8.44□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Slc41a2Q8BYR8 573 aa8.44□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Csgalnact2Q8C1F4 542 aa8.44□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Tmem161bQ8C2L6 487 aa8.44□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Hgh1Q8C3I8 393 aa8.44□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Lamtor4Q8CF66 99 aa8.44□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ago2Q8CJG0 860 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Habp2Q8K0D2 558 aa8.44□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 SarafQ8R3Q0 334 aa8.44□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 BbxQ8VBW5 907 aa8.44□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Zfp566Q8VCI1 386 aa8.44□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Olfr1353Q8VGU8 309 aa8.44□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Pcdhb10Q91VE5 797 aa8.44□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Dlg2Q91XM9 852 aa8.44□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Med15Q924H2 789 aa8.44□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ackr4Q924I3 350 aa8.44□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Cyp4f13Q99N19 523 aa8.44□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 CactinQ9CS00 772 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ears2Q9CXJ1 523 aa8.44□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 RnmtQ9D0L8 465 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 PpihQ9D868 188 aa8.44□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Dmrtc1Q9D9R7 182 aa8.44□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 PdcQ9QW08 244 aa8.44□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 C1qtnf1Q9QXP7 281 aa8.44□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Tspan3Q9QY33 253 aa8.44□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Acot9Q9R0X4 439 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Zfhx2Q2MHN3 2562 aa8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ms4a12A0A087WSB9 263 aa8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gm12695A2AGB2 545 aa8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Olfr456B2RT27 312 aa8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ces1bD3Z5G7 567 aa8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Slc27a6E9Q9W4 619 aa8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Vmn2r71L7N2D8 855 aa8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Aldh1a7O35945 501 aa8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Epb41l2O70318 988 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Zfp1P08042 402 aa8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Oas1aP11928 367 aa8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Nfkb1P25799 971 aa8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Tbxas1P36423 533 aa8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Usp10P52479 792 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Oaz1P54369 227 aa8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Slc26a1P58735 704 aa8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gtf2bP62915 316 aa8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Sptlc2P97363 560 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Fut7Q11131 389 aa8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 ZufspQ3T9Z9 577 aa8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ndst1Q3UHN9 882 aa8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Zfp791Q497V9 528 aa8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Grhl3Q5FWH3 603 aa8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Hsf5Q5ND04 624 aa8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Znf235Q61116 645 aa8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Heatr6Q6P1G0 1184 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Arhgap26Q6ZQ82 814 aa8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Olfr389Q7TRX7 312 aa8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Lats2Q7TSJ6 1042 aa8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Tcp10aQ80W76 438 aa8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Tspan18Q80WR1 248 aa8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Haus7Q8BKT8 364 aa8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Lrfn3Q8BLY3 626 aa8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ttc26Q8BS45 554 aa8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Usp37Q8C0R0 979 aa8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 NemfQ8CCP0 1064 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Atat1Q8K341 421 aa8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Oas1gQ8K469 367 aa8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Vmn1r42Q8VBS7 329 aa8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Rpap2Q8VC34 614 aa8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Taf12Q8VE65 161 aa8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Olfr458Q8VF80 313 aa8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Olfr457Q8VGP5 313 aa8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Vmn1r43Q8VIC9 329 aa8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Q922C1 641 aa8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 CmasQ99KK2 432 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 BccipQ9CWI3 316 aa8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 DlstQ9D2G2 454 aa8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 PgcQ9D7R7 392 aa8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 NckipsdQ9ESJ4 714 aa8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Extl1Q9JKV7 669 aa8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Cpsf3Q9QXK7 684 aa8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 AmfrQ9R049 643 aa8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Sept5Q9Z2Q6 369 aa8.43□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Igkv16-104A0A0B4J1I1 116 aa8.42□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gm7168A0AUV4 508 aa8.42□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Lrrc38A2VDH3 298 aa8.42□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Tmem215A7E1Z1 235 aa8.42□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 4933406M09RikG3XA12 479 aa8.42□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Vmn2r12L7N217 831 aa8.42□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Itgb3O54890 787 aa8.42□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 P01631 113 aa8.42□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Adh5P28474 374 aa8.42□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Tnfrsf4P47741 272 aa8.42□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Prdx5P99029 210 aa8.42□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Sox8Q04886 464 aa8.42□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 R3hdm4Q4VBF2 262 aa8.42□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Sun3Q5SS91 320 aa8.42□□□□□ -1.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Prl2c1Q5SVL9 228 aa8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 51.8 ms