Protein–RNA interactions for Protein: P36423

Tbxas1, Thromboxane-A synthase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbxas1P36423 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.79■■■■■ 4.12
Tbxas1P36423 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Tbxas1P36423 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Tbxas1P36423 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Tbxas1P36423 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
Tbxas1P36423 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Tbxas1P36423 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
Tbxas1P36423 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Tbxas1P36423 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Tbxas1P36423 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Tbxas1P36423 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Tbxas1P36423 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Tbxas1P36423 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Tbxas1P36423 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Tbxas1P36423 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Tbxas1P36423 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Tbxas1P36423 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Tbxas1P36423 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Tbxas1P36423 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Tbxas1P36423 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Tbxas1P36423 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Tbxas1P36423 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Tbxas1P36423 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Tbxas1P36423 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Tbxas1P36423 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Tbxas1P36423 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Tbxas1P36423 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Tbxas1P36423 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Tbxas1P36423 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Tbxas1P36423 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Tbxas1P36423 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Tbxas1P36423 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Tbxas1P36423 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Tbxas1P36423 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Tbxas1P36423 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Tbxas1P36423 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Tbxas1P36423 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Tbxas1P36423 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Tbxas1P36423 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Tbxas1P36423 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Tbxas1P36423 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Tbxas1P36423 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Tbxas1P36423 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Tbxas1P36423 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Tbxas1P36423 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Tbxas1P36423 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Tbxas1P36423 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Tbxas1P36423 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Tbxas1P36423 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Tbxas1P36423 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Tbxas1P36423 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Tbxas1P36423 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Tbxas1P36423 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Tbxas1P36423 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Tbxas1P36423 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Tbxas1P36423 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Tbxas1P36423 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Tbxas1P36423 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Tbxas1P36423 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Tbxas1P36423 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Tbxas1P36423 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Tbxas1P36423 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Tbxas1P36423 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Tbxas1P36423 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Tbxas1P36423 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Tbxas1P36423 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Tbxas1P36423 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Tbxas1P36423 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Tbxas1P36423 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Tbxas1P36423 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Tbxas1P36423 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Tbxas1P36423 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Tbxas1P36423 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Tbxas1P36423 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Tbxas1P36423 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Tbxas1P36423 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Tbxas1P36423 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Tbxas1P36423 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Tbxas1P36423 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Tbxas1P36423 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Tbxas1P36423 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Tbxas1P36423 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Tbxas1P36423 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Tbxas1P36423 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Tbxas1P36423 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Tbxas1P36423 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Tbxas1P36423 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Tbxas1P36423 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Tbxas1P36423 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Tbxas1P36423 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Tbxas1P36423 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Tbxas1P36423 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Tbxas1P36423 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Tbxas1P36423 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Tbxas1P36423 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tbxas1P36423 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Tbxas1P36423 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tbxas1P36423 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tbxas1P36423 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tbxas1P36423 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms