RNA–Protein interactions for RNA: YMR253C

YMR253C, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR253C, Length 1,245 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR253CYMR253C VHS2P40463 436 aa5.88□□□□□ -1.47
YMR253CYMR253C IMP2P46972 177 aa5.88□□□□□ -1.47
YMR253CYMR253C YLR412C-AQ3E742 68 aa5.88□□□□□ -1.47
YMR253CYMR253C YHR213WP0CI67 198 aa5.87□□□□□ -1.47
YMR253CYMR253C YHL018WP38744 120 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
YMR253CYMR253C AIM19P40502 157 aa5.87□□□□□ -1.47
YMR253CYMR253C YMR181CQ03231 154 aa5.87□□□□□ -1.47
YMR253CYMR253C KTI12P34253 313 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
YMR253CYMR253C GLE2P40066 365 aa5.86□□□□□ -1.47
YMR253CYMR253C SIM1P40472 476 aa5.86□□□□□ -1.47
YMR253CYMR253C SDC1Q03323 175 aa5.86□□□□□ -1.47
YMR253CYMR253C TRP1P00912 224 aa5.85□□□□□ -1.47
YMR253CYMR253C RPL42AP0CX27 106 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
YMR253CYMR253C RPL42BP0CX28 106 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
YMR253CYMR253C YDR209CQ03480 137 aa5.85□□□□□ -1.47
YMR253CYMR253C YOR008C-AQ3E7B9 74 aa5.85□□□□□ -1.47
YMR253CYMR253C YSY6P38374 65 aa5.84□□□□□ -1.47
YMR253CYMR253C URM1P40554 99 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
YMR253CYMR253C YGR164WP53291 111 aa5.84□□□□□ -1.47
YMR253CYMR253C PBA1Q05778 276 aa5.84□□□□□ -1.47
YMR253CYMR253C EMC6Q12431 108 aa5.84□□□□□ -1.47
YMR253CYMR253C MPC2P38857 129 aa5.83□□□□□ -1.48
YMR253CYMR253C RRT13P40042 185 aa5.83□□□□□ -1.48
YMR253CYMR253C GLO1P50107 326 aa5.83□□□□□ -1.48
YMR253CYMR253C MRPS12P53732 153 aa5.83□□□□□ -1.48
YMR253CYMR253C DAP1Q12091 152 aa5.83□□□□□ -1.48
YMR253CYMR253C PRM7Q12459 698 aa5.83□□□□□ -1.48
YMR253CYMR253C YMR175W-AQ3E766 64 aa5.83□□□□□ -1.48
YMR253CYMR253C RPL18AP0CX49 186 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
YMR253CYMR253C RPL18BP0CX50 186 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
YMR253CYMR253C IES6P32617 166 aa5.82□□□□□ -1.48
YMR253CYMR253C MSA2P36157 363 aa5.82□□□□□ -1.48
YMR253CYMR253C DCV1P43595 202 aa5.82□□□□□ -1.48
YMR253CYMR253C RPL28P02406 149 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
YMR253CYMR253C ADH5P38113 351 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
YMR253CYMR253C RRT1P38192 103 aa5.81□□□□□ -1.48
YMR253CYMR253C YLR042CQ07990 161 aa5.81□□□□□ -1.48
YMR253CYMR253C YIL046W-AQ3E7Z4 54 aa5.81□□□□□ -1.48
YMR253CYMR253C ATP15P21306 62 aa5.8□□□□□ -1.48
YMR253CYMR253C PEX17P40155 199 aa5.8□□□□□ -1.48
YMR253CYMR253C YNL190WP53872 204 aa5.8□□□□□ -1.48
YMR253CYMR253C YDR114CQ04597 100 aa5.8□□□□□ -1.48
YMR253CYMR253C KSH1Q8TGJ3 72 aa5.8□□□□□ -1.48
YMR253CYMR253C BLM10P43583 2143 aa5.8□□□□□ -1.48
YMR253CYMR253C RPL16BP26785 198 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
YMR253CYMR253C CTR2P38865 189 aa5.79□□□□□ -1.48
YMR253CYMR253C YER084WP40057 128 aa5.79□□□□□ -1.48
YMR253CYMR253C YER187WP40102 141 aa5.79□□□□□ -1.48
YMR253CYMR253C YFL015CP43578 164 aa5.79□□□□□ -1.48
YMR253CYMR253C YJL027CP47063 138 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
YMR253CYMR253C MRPL39P36533 70 aa5.78□□□□□ -1.48
YMR253CYMR253C MTC6P38849 526 aa5.78□□□□□ -1.48
YMR253CYMR253C HUR1P45820 110 aa5.78□□□□□ -1.48
YMR253CYMR253C POL2P21951 2222 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
YMR253CYMR253C YKR045CP36138 183 aa5.77□□□□□ -1.49
YMR253CYMR253C PIR5P46999 287 aa5.77□□□□□ -1.49
YMR253CYMR253C SEC16P48415 2195 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
YMR253CYMR253C RPS14AP06367 137 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
YMR253CYMR253C UBC4P15731 148 aa5.76□□□□□ -1.49
YMR253CYMR253C BET1P22804 142 aa5.76□□□□□ -1.49
YMR253CYMR253C RPS14BP39516 138 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
YMR253CYMR253C HAL1Q01766 294 aa5.76□□□□□ -1.49
YMR253CYMR253C YOR032W-AQ8TGS1 66 aa5.76□□□□□ -1.49
YMR253CYMR253C YHR022CP38763 256 aa5.75□□□□□ -1.49
YMR253CYMR253C YJR146WP47174 117 aa5.75□□□□□ -1.49
YMR253CYMR253C YMR320WQ04897 101 aa5.75□□□□□ -1.49
YMR253CYMR253C GLT1Q12680 2145 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
YMR253CYMR253C ACC1Q00955 2233 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
YMR253CYMR253C YDR246W-AQ3E763 66 aa5.74□□□□□ -1.49
YMR253CYMR253C YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data5.73□□□□□ -1.49not detected
YMR253CYMR253C NRM1P53718 249 aa5.73□□□□□ -1.49
YMR253CYMR253C PPT2Q12036 173 aa5.73□□□□□ -1.49
YMR253CYMR253C YDL009CQ12210 107 aa5.73□□□□□ -1.49
YMR253CYMR253C YNL277W-AQ3E7Z0 62 aa5.73□□□□□ -1.49
YMR253CYMR253C FAS1P07149 2051 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
YMR253CYMR253C QCR8P08525 94 aa5.72□□□□□ -1.49
YMR253CYMR253C SHU1P38751 150 aa5.72□□□□□ -1.49
YMR253CYMR253C SFT1P43682 97 aa5.72□□□□□ -1.49
YMR253CYMR253C RSM19P53733 91 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
YMR253CYMR253C YNL046WP53956 172 aa5.72□□□□□ -1.49
YMR253CYMR253C YML122CQ03207 126 aa5.72□□□□□ -1.49
YMR253CYMR253C YOL160WQ08321 113 aa5.72□□□□□ -1.49
YMR253CYMR253C RPL16AP26784 199 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
YMR253CYMR253C YNL194CP40169 301 aa5.71□□□□□ -1.5
YMR253CYMR253C SIP18P50263 79 aa5.71□□□□□ -1.5
YMR253CYMR253C YOR029WQ12243 111 aa5.71□□□□□ -1.5
YMR253CYMR253C YMR105W-AQ8TGS8 64 aa5.71□□□□□ -1.5
YMR253CYMR253C BRR2P32639 2163 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
YMR253CYMR253C YBR209WP38311 105 aa5.7□□□□□ -1.5
YMR253CYMR253C YLR281CQ05863 155 aa5.7□□□□□ -1.5
YMR253CYMR253C YLR285C-AQ3E771 56 aa5.7□□□□□ -1.5
YMR253CYMR253C YGR219WP53307 113 aa5.69□□□□□ -1.5
YMR253CYMR253C RGM1Q00453 211 aa5.69□□□□□ -1.5
YMR253CYMR253C MIG3P39943 394 aa5.68□□□□□ -1.5
YMR253CYMR253C ARC15P40518 154 aaRIP-Chip data5.68□□□□□ -1.5not detected
YMR253CYMR253C IRC21Q04772 201 aa5.68□□□□□ -1.5
YMR253CYMR253C RPL15AP05748 204 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
YMR253CYMR253C YLR156WP0CE96 114 aa5.67□□□□□ -1.5
YMR253CYMR253C YLR159WP0CE97 114 aa5.67□□□□□ -1.5
YMR253CYMR253C YLR161WP0CE98 114 aa5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 41.6 ms