RNA–Protein interactions for RNA: YHR160C

PEX18, Transcript of Peroxin, yeast

Gene PEX18, Length 852 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PEX18	YHR160C	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	1.83	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	YLR042C	Q07990	161 aa		1.83	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	1.83	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	1.82	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	HMRA1	P0CY11	126 aa		1.82	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	1.82	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	MRPL28	P36527	147 aa		1.82	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	YBR013C	P38215	129 aa		1.82	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	HSP10	P38910	106 aa		1.82	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	PAU15	P40585	124 aa		1.82	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	MGA1	P53050	456 aa		1.82	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	1.82	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	APS2	Q00381	147 aa		1.82	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	UPS3	Q04006	179 aa		1.82	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	GPI19	Q04082	140 aa		1.82	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	DGA1	Q08650	418 aa		1.82	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		1.82	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		1.82	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	YHR140W	P38842	239 aa		1.81	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	PAU7	P39545	55 aa		1.81	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	NSE4	P43124	402 aa		1.81	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	PAU5	P43575	122 aa		1.81	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	HHO1	P53551	258 aa		1.81	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	CSM4	Q08955	156 aa		1.81	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		1.81	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	1.8	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	1.8	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	1.8	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	UBC5	P15732	148 aa		1.8	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	1.8	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	YLL066W-B	Q8TGJ7	56 aa		1.8	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	IRC22	P40006	225 aa		1.79	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	YER076C	P40049	302 aa		1.79	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	YJL028W	P47062	111 aa		1.79	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	YGL034C	P53186	121 aa		1.79	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	TVP18	Q04767	167 aa		1.79	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	YOR268C	Q08734	132 aa		1.79	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	ISD11	Q6Q560	94 aa		1.79	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	RPL33A	P05744	107 aa	Known RBP	1.78	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	PAU19	P0CE85	124 aa		1.78	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	PAU21	P0CE86	164 aa		1.78	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	PAU22	P0CE87	164 aa		1.78	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	1.78	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	PAU3	P25610	124 aa		1.78	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	TEM1	P38987	245 aa		1.78	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	1.78	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	1.78	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	DCV1	P43595	202 aa		1.78	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	SPC1	P46965	94 aa		1.78	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	PMP3	P87284	55 aa		1.78	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	MGR2	Q02889	113 aa		1.78	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	1.78	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	YMR122W-A	Q3E842	84 aa		1.78	□□□□□ -2.12
PEX18	YHR160C	MRP49	P32388	137 aa		1.77	□□□□□ -2.13
PEX18	YHR160C	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	1.77	□□□□□ -2.13	not detected
PEX18	YHR160C	GTT1	P40582	234 aa		1.77	□□□□□ -2.13
PEX18	YHR160C	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	1.77	□□□□□ -2.13
PEX18	YHR160C	CYT2	Q00873	224 aa		1.77	□□□□□ -2.13
PEX18	YHR160C	YIL014C-A	Q02598	104 aa		1.77	□□□□□ -2.13
PEX18	YHR160C	RRT15	Q3E811	62 aa		1.77	□□□□□ -2.13
PEX18	YHR160C	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		1.77	□□□□□ -2.13
PEX18	YHR160C	RTC6	O14464	93 aa		1.76	□□□□□ -2.13
PEX18	YHR160C	PFY1	P07274	126 aa		1.76	□□□□□ -2.13
PEX18	YHR160C	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	1.76	□□□□□ -2.13
PEX18	YHR160C	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	1.76	□□□□□ -2.13
PEX18	YHR160C	YBR209W	P38311	105 aa		1.76	□□□□□ -2.13
PEX18	YHR160C	YBR219C	P38317	127 aa		1.76	□□□□□ -2.13
PEX18	YHR160C	SVP26	P38869	228 aa		1.76	□□□□□ -2.13
PEX18	YHR160C	YER134C	P40081	178 aa		1.76	□□□□□ -2.13
PEX18	YHR160C	GAT4	P40569	121 aa		1.76	□□□□□ -2.13
PEX18	YHR160C	YJR146W	P47174	117 aa		1.76	□□□□□ -2.13
PEX18	YHR160C	TOS6	P48560	102 aa		1.76	□□□□□ -2.13
PEX18	YHR160C	YMR320W	Q04897	101 aa		1.76	□□□□□ -2.13
PEX18	YHR160C	ZEO1	Q08245	113 aa		1.76	□□□□□ -2.13
PEX18	YHR160C	WIP1	Q2V2P8	89 aa		1.76	□□□□□ -2.13
PEX18	YHR160C	HMRA2	P0CY13	119 aa		1.75	□□□□□ -2.13
PEX18	YHR160C	ANB1	P19211	157 aa		1.75	□□□□□ -2.13
PEX18	YHR160C	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	1.75	□□□□□ -2.13
PEX18	YHR160C	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	1.75	□□□□□ -2.13
PEX18	YHR160C	YEL008W	P40001	126 aa		1.75	□□□□□ -2.13
PEX18	YHR160C	YER085C	P40058	173 aa		1.75	□□□□□ -2.13
PEX18	YHR160C	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	1.75	□□□□□ -2.13
PEX18	YHR160C	LCL2	Q08045	131 aa		1.75	□□□□□ -2.13
PEX18	YHR160C	COA3	Q3E7B2	85 aa		1.75	□□□□□ -2.13
PEX18	YHR160C	YPR010C-A	A5Z2X5	72 aa		1.74	□□□□□ -2.13
PEX18	YHR160C	YAL064W	P39711	94 aa		1.74	□□□□□ -2.13
PEX18	YHR160C	YDR042C	Q03205	200 aa		1.74	□□□□□ -2.13
PEX18	YHR160C	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		1.74	□□□□□ -2.13
PEX18	YHR160C	YPL229W	Q99395	206 aa		1.74	□□□□□ -2.13
PEX18	YHR160C	YAR023C	D6VPM8	179 aa		1.73	□□□□□ -2.13
PEX18	YHR160C	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	1.73	□□□□□ -2.13
PEX18	YHR160C	ERG28	P40030	148 aa		1.73	□□□□□ -2.13
PEX18	YHR160C	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	1.73	□□□□□ -2.13
PEX18	YHR160C	ARL3	Q02804	198 aa		1.73	□□□□□ -2.13
PEX18	YHR160C	YML108W	Q03759	105 aa		1.73	□□□□□ -2.13
PEX18	YHR160C	SEN15	Q04675	128 aa		1.73	□□□□□ -2.13
PEX18	YHR160C	YLR194C	Q05777	254 aa		1.73	□□□□□ -2.13
PEX18	YHR160C	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		1.73	□□□□□ -2.13
PEX18	YHR160C	YDR034C-A	P0C289	58 aa		1.72	□□□□□ -2.13
PEX18	YHR160C	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		1.72	□□□□□ -2.13

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