RNA–Protein interactions for RNA: YGR129W

SYF2, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF2, Length 648 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF2	YGR129W	NAT3	Q06504	195 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SYF2	YGR129W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SYF2	YGR129W	SHG1	P38337	142 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SYF2	YGR129W	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
SYF2	YGR129W	YEL008W	P40001	126 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SYF2	YGR129W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
SYF2	YGR129W	YAL065C	O13511	128 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SYF2	YGR129W	TRP1	P00912	224 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SYF2	YGR129W	YKR032W	P36127	104 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SYF2	YGR129W	PAU7	P39545	55 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SYF2	YGR129W	PAU5	P43575	122 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SYF2	YGR129W	YJR146W	P47174	117 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SYF2	YGR129W	YOR268C	Q08734	132 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SYF2	YGR129W	YAR029W	P39549	74 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SYF2	YGR129W	JAC1	P53193	184 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SYF2	YGR129W	DAD3	P69850	94 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SYF2	YGR129W	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SYF2	YGR129W	YMR295C	Q03559	197 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SYF2	YGR129W	YDL241W	Q07738	123 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SYF2	YGR129W	DCN1	Q12395	269 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SYF2	YGR129W	Q0032	Q9ZZX7	96 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SYF2	YGR129W	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SYF2	YGR129W	STF1	P01098	86 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SYF2	YGR129W	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SYF2	YGR129W	AQY2	P0CD90	149 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SYF2	YGR129W	PAU19	P0CE85	124 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SYF2	YGR129W	PAU21	P0CE86	164 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SYF2	YGR129W	PAU22	P0CE87	164 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SYF2	YGR129W	PAU3	P25610	124 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SYF2	YGR129W	PAU15	P40585	124 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SYF2	YGR129W	YFL019C	P43576	117 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SYF2	YGR129W	DAN1	P47178	298 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SYF2	YGR129W	HMRA1	P0CY11	126 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SYF2	YGR129W	YGL193C	P53097	103 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SYF2	YGR129W	APS1	P35181	156 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SYF2	YGR129W	PLP1	Q04004	230 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SYF2	YGR129W	YLR112W	Q12130	139 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SYF2	YGR129W	POM33	Q12164	279 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SYF2	YGR129W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SYF2	YGR129W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SYF2	YGR129W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SYF2	YGR129W	KSH1	Q8TGJ3	72 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SYF2	YGR129W	LAC1	P28496	418 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SYF2	YGR129W	PET8	P38921	284 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SYF2	YGR129W	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SYF2	YGR129W	PHS1	P40857	217 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SYF2	YGR129W	IGD1	P43598	195 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SYF2	YGR129W	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SYF2	YGR129W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
SYF2	YGR129W	PFY1	P07274	126 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SYF2	YGR129W	OXA1	P39952	402 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SYF2	YGR129W	KNH1	P50112	268 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SYF2	YGR129W	YDR042C	Q03205	200 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SYF2	YGR129W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
SYF2	YGR129W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
SYF2	YGR129W	SCM4	P32564	187 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SYF2	YGR129W	PAU16	P35994	123 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SYF2	YGR129W	PAM17	P36147	197 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SYF2	YGR129W	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
SYF2	YGR129W	DAD2	P36162	133 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SYF2	YGR129W	RPL37B	P51402	88 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
SYF2	YGR129W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SYF2	YGR129W	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
SYF2	YGR129W	MGR2	Q02889	113 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SYF2	YGR129W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
SYF2	YGR129W	YBL039W-B	P0C268	59 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SYF2	YGR129W	YGL010W	P25338	174 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SYF2	YGR129W	MVB12	P42939	101 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SYF2	YGR129W	TOS6	P48560	102 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SYF2	YGR129W	BNS1	P50084	137 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SYF2	YGR129W	ABF2	Q02486	183 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SYF2	YGR129W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
SYF2	YGR129W	COX14	P39103	70 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SYF2	YGR129W	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
SYF2	YGR129W	SNN1	P48232	102 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SYF2	YGR129W	SPG1	P50088	95 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SYF2	YGR129W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SYF2	YGR129W	KRE1	P17260	313 aa		3.27	□□□□□ -1.89
SYF2	YGR129W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		3.27	□□□□□ -1.89
SYF2	YGR129W	YER039C-A	P0CD97	72 aa		3.26	□□□□□ -1.89
SYF2	YGR129W	TOA2	P32774	122 aa		3.26	□□□□□ -1.89
SYF2	YGR129W	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	3.25	□□□□□ -1.89
SYF2	YGR129W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	3.25	□□□□□ -1.89
SYF2	YGR129W	CNB1	P25296	175 aa		3.25	□□□□□ -1.89
SYF2	YGR129W	HSP10	P38910	106 aa		3.25	□□□□□ -1.89
SYF2	YGR129W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		3.25	□□□□□ -1.89
SYF2	YGR129W	YGR121W-A	Q3E816	71 aa		3.25	□□□□□ -1.89
SYF2	YGR129W	APS2	Q00381	147 aa		3.24	□□□□□ -1.89
SYF2	YGR129W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		3.24	□□□□□ -1.89
SYF2	YGR129W	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	3.23	□□□□□ -1.89
SYF2	YGR129W	HMRA2	P0CY13	119 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SYF2	YGR129W	ATP15	P21306	62 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SYF2	YGR129W	LDS1	P31379	325 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SYF2	YGR129W	PPT2	Q12036	173 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SYF2	YGR129W	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SYF2	YGR129W	VMA9	Q3E7B6	73 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SYF2	YGR129W	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SYF2	YGR129W	DDR2	P89113	61 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SYF2	YGR129W	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SYF2	YGR129W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9

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