RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	FCAR	P24071	287 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	RAP1GAP	P47736	663 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	IFNAR2	P48551	515 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	MORC3	Q14149	939 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	PDGFRL	Q15198	375 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	TXNDC8	Q6A555	127 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	FBXO32	Q969P5	355 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	IL21	Q9HBE4	155 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	KRT82	Q9NSB4	513 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	LAMTOR5	O43504	91 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	HCRT	O43612	131 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	NPR3	P17342	541 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	ASPA	P45381	313 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	PPP3CA	Q08209	521 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	CAMK4	Q16566	473 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	IER5L	Q5T953	404 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM35A	Q86V20	835 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	CPA6	Q8N4T0	437 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	MLKL	Q8NB16	471 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM81B	Q96LP2	452 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	12.02	□□□□□ -0.49	6e-7	■■■■■ 62.1
TTLL3-231	ENST00000496246	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	12.02	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246		H0Y858	1186 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	P4HA2	O15460	535 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	ADORA2B	P29275	332 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	NHLH1	Q02575	133 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	INCA1	Q0VD86	236 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	TAF10	Q12962	218 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	MTF1	Q14872	753 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	ANGPT1	Q15389	498 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	ATP2A3	Q93084	1043 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	NT5C1B	Q96P26	610 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	FOXQ1	Q9C009	403 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	HESX1	Q9UBX0	185 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	CLDN5	O00501	218 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	NFATC1	O95644	943 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	TPM2	P07951	284 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	RALA	P11233	206 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	FMO5	P49326	533 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	PSEN1	P49768	467 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	STX17	P56962	302 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	MAP3K7CL	P57077	242 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	12	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	RUNX3	Q13761	415 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF394	Q53GI3	561 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	HECTD3	Q5T447	861 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	PRSS33	Q8NF86	280 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
TTLL3-231	ENST00000496246	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		12	□□□□□ -0.49

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