RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370002.7

PITX3-201, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX3, Length 1,391 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-201ENST00000370002 RUNX3Q13761 415 aa21.61■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 C1orf220Q5T0J3 134 aa21.61■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 FAM186BQ8IYM0 893 aa21.61■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 ZBTB44Q8NCP5 570 aa21.61■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 GCNT4Q9P109 453 aa21.61■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 CCL26Q9Y258 94 aa21.61■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 TCHHQ07283 1943 aa21.61■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 STX10O60499 249 aa21.61■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 GPIHBP1Q8IV16 184 aa21.61■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 SPEM1Q8N4L4 309 aa21.61■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 PDZD8Q8NEN9 1154 aa21.61■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 ZFYVE19Q96K21 471 aa21.61■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 SLITRK1Q96PX8 696 aa21.61■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 B3GNT5Q9BYG0 378 aa21.61■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 DNAI2Q9GZS0 605 aa21.61■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 DPEP3Q9H4B8 488 aa21.61■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 SMYD3Q9H7B4 428 aa21.61■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 CYP3A43Q9HB55 503 aa21.61■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 ZSCAN32Q9NX65 697 aa21.61■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa21.61■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa21.61■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 CETN3O15182 167 aa21.6■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 CKMP06732 381 aa21.6■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 HDCP19113 662 aa21.6■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 CDH8P55286 799 aa21.6■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 NUP93Q8N1F7 819 aa21.6■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 TTC39CQ8N584 583 aa21.6■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 CCDC150Q8NCX0 1101 aa21.6■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 OSCP1Q8WVF1 389 aa21.6■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 GBP4Q96PP9 640 aa21.6■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 TMEM8AQ9HCN3 771 aa21.6■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 IL37Q9NZH6 218 aa21.6■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 DMDP11532 3685 aa21.59■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 F5P12259 2224 aa21.59■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 ZNF840PA6NDX5 716 aa21.59■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 KINO60870 393 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 HLA-DRAP01903 254 aa21.59■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 PPP1R2P41236 205 aa21.59■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 PIK3CAP42336 1068 aa21.59■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 PNOCQ13519 176 aa21.59■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 CCINQ13939 588 aa21.59■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 MTF1Q14872 753 aa21.59■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 ZNF77Q15935 545 aa21.59■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 KRT39Q6A163 491 aa21.59■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 STKLD1Q8NE28 680 aa21.59■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 ATRIPQ8WXE1 791 aa21.59■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 SMARCD1Q96GM5 515 aa21.59■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa21.59■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 TRPC7Q9HCX4 862 aa21.59■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PITX3-201ENST00000370002 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
PITX3-201ENST00000370002 OLFM2O95897 454 aa21.58■■□□□ 1.04
PITX3-201ENST00000370002 ASPAP45381 313 aa21.58■■□□□ 1.04
PITX3-201ENST00000370002 USP46P62068 366 aa21.58■■□□□ 1.04
PITX3-201ENST00000370002 SLC7A9P82251 487 aa21.58■■□□□ 1.04
PITX3-201ENST00000370002 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
PITX3-201ENST00000370002 TNK2Q07912 1038 aa21.58■■□□□ 1.04
PITX3-201ENST00000370002 INCA1Q0VD86 236 aa21.58■■□□□ 1.04
PITX3-201ENST00000370002 USP4Q13107 963 aa21.58■■□□□ 1.04
PITX3-201ENST00000370002 SNX30Q5VWJ9 437 aa21.58■■□□□ 1.04
PITX3-201ENST00000370002 CYP2S1Q96SQ9 504 aa21.58■■□□□ 1.04
PITX3-201ENST00000370002 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa21.58■■□□□ 1.04
PITX3-201ENST00000370002 HPS4Q9NQG7 708 aa21.58■■□□□ 1.04
PITX3-201ENST00000370002 R4GN57 208 aa21.58■■□□□ 1.04
PITX3-201ENST00000370002 COL4A2P08572 1712 aa21.58■■□□□ 1.04
PITX3-201ENST00000370002 FAM92AA1XBS5 289 aa21.57■■□□□ 1.04
PITX3-201ENST00000370002 C2orf78A6NCI8 922 aa21.57■■□□□ 1.04
PITX3-201ENST00000370002 LILRB5O75023 590 aa21.57■■□□□ 1.04
PITX3-201ENST00000370002 CLSTN1O94985 981 aa21.57■■□□□ 1.04
PITX3-201ENST00000370002 EPB41P11171 864 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PITX3-201ENST00000370002 YWHAQP27348 245 aa21.57■■□□□ 1.04
PITX3-201ENST00000370002 CXCL12P48061 93 aa21.57■■□□□ 1.04
PITX3-201ENST00000370002 LRRC63Q05C16 580 aa21.57■■□□□ 1.04
PITX3-201ENST00000370002 PPP3CAQ08209 521 aa21.57■■□□□ 1.04
PITX3-201ENST00000370002 NR1H3Q13133 447 aa21.57■■□□□ 1.04
PITX3-201ENST00000370002 TXNDC11Q6PKC3 985 aa21.57■■□□□ 1.04
PITX3-201ENST00000370002 FAM35AQ86V20 835 aa21.57■■□□□ 1.04
PITX3-201ENST00000370002 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PITX3-201ENST00000370002 CPA6Q8N4T0 437 aa21.57■■□□□ 1.04
PITX3-201ENST00000370002 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PITX3-201ENST00000370002 ATP2A3Q93084 1043 aa21.57■■□□□ 1.04
PITX3-201ENST00000370002 SMARCE1Q969G3 411 aa21.57■■□□□ 1.04
PITX3-201ENST00000370002 SLC22A12Q96S37 553 aa21.57■■□□□ 1.04
PITX3-201ENST00000370002 TSG101Q99816 390 aa21.57■■□□□ 1.04
PITX3-201ENST00000370002 SDCBP2Q9H190 292 aa21.57■■□□□ 1.04
PITX3-201ENST00000370002 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa21.57■■□□□ 1.04
PITX3-201ENST00000370002 VPS13AQ96RL7 3174 aa21.56■■□□□ 1.04
PITX3-201ENST00000370002 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
PITX3-201ENST00000370002 TDGF1P13385 188 aa21.56■■□□□ 1.04
PITX3-201ENST00000370002 HOXA6P31267 233 aa21.56■■□□□ 1.04
PITX3-201ENST00000370002 PRCPP42785 496 aa21.56■■□□□ 1.04
PITX3-201ENST00000370002 SOX9P48436 509 aa21.56■■□□□ 1.04
PITX3-201ENST00000370002 GCLMP48507 274 aa21.56■■□□□ 1.04
PITX3-201ENST00000370002 TUBP50607 506 aa21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms