RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARCQ7LC44 396 aa22.98■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FUKQ8N0W3 1084 aa22.98■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MREGQ8N565 214 aa22.98■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa22.98■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CEP350Q5VT06 3117 aa22.97■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DAPK3O43293 454 aa22.97■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 POMCP01189 267 aa22.97■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SELPP16109 830 aa22.97■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TKTP29401 623 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRNP1Q6NT89 227 aa22.97■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DSTYKQ6XUX3 929 aa22.97■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa22.97■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRRC8DQ7L1W4 858 aa22.97■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa22.97■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM126BQ8IXS8 530 aa22.97■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PAAF1Q9BRP4 392 aa22.97■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FTHL17Q9BXU8 183 aa22.97■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DCLK3Q9C098 648 aa22.97■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EFR3BQ9Y2G0 817 aa22.97■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PIK3R2O00459 728 aa22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IL1R2P27930 398 aa22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FLT3P36888 993 aa22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLCB3Q01970 1234 aa22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCNG2Q16589 344 aa22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TFDP3Q5H9I0 405 aa22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MFSD7Q6UXD7 560 aa22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC105Q8IYK2 499 aa22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RXFP2Q8WXD0 754 aa22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LINC01599Q8WXQ3 324 aa22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DUSP16Q9BY84 665 aa22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PTPN22Q9Y2R2 807 aa22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATP2C2O75185 946 aa22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TJP3O95049 919 aa22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM153BP0C7A2 387 aa22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PDGFRAP16234 1089 aa22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GBP1P32455 592 aa22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDKN2BP42772 138 aa22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GPS2Q13227 327 aa22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LLGL1Q15334 1064 aa22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TAZQ16635 292 aa22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM153CQ494X1 144 aa22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TIGD5Q53EQ6 642 aa22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC26A9Q7LBE3 791 aa22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SCUBE3Q8IX30 993 aa22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C1orf54Q8WWF1 131 aa22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RAPGEF5Q92565 580 aa22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HEMGNQ9BXL5 484 aa22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KLHL11Q9NVR0 708 aa22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM153AQ9UHL3 310 aa22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa22.95■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PI4K2BG5E9Z4 385 aa22.95■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ECEL1O95672 775 aa22.95■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CYP11A1P05108 521 aa22.95■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ODC1P11926 461 aa22.95■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MIPP30301 263 aa22.95■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC8A3P57103 927 aa22.95■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BFSP2Q13515 415 aa22.95■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ODF2Q5BJF6 829 aa22.95■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KIAA0319Q5VV43 1072 aa22.95■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CD300LGQ6UXG3 332 aa22.95■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PAQR9Q6ZVX9 377 aa22.95■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NCAPGQ9BPX3 1015 aa22.95■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SYT15Q9BQS2 421 aa22.95■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CHST7Q9NS84 486 aa22.95■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDH9Q9ULB4 789 aa22.95■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 USP18Q9UMW8 372 aa22.95■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRRD1A4D1F6 860 aa22.94■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 M0QZQ0 153 aa22.94■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 B3GAT3O94766 335 aa22.94■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NPR3P17342 541 aa22.94■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa22.94■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa22.94■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GLB1LQ6UWU2 654 aa22.94■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GRK7Q8WTQ7 553 aa22.94■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CRTAC1Q9NQ79 661 aa22.94■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DSEQ9UL01 958 aa22.94■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OGDHLQ9ULD0 1010 aa22.94■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa22.94■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COL6A1P12109 1028 aa22.94■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PCSK1P29120 753 aa22.94■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC14Q49A88 953 aa22.94■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCTD13Q8WZ19 329 aa22.94■■□□□ 1.26
GADD45GIP1-201ENST00000316939 B3GNT5Q9BYG0 378 aa22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms