RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)J

tW(CCA)J, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)J, Length 72 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)JtW(CCA)J UBC5P15732 148 aa1.77□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J QRI5P32344 111 aa1.77□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J ZRT1P32804 376 aa1.77□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J MRPS9P38120 278 aa1.77□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J SRP14P38985 146 aa1.77□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J YAL064WP39711 94 aa1.77□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J YER085CP40058 173 aa1.77□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J DCV1P43595 202 aa1.77□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J TY1A-JR2P47099 440 aa1.77□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J TIM21P53220 239 aa1.77□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J ERI1P62651 68 aaKnown RBP1.77□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J BET5Q03630 159 aa1.77□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J TY1A-DR1Q03856 440 aa1.77□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J GIM5Q04493 163 aa1.77□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP1.77□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J ORM2Q06144 216 aa1.77□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J TY1A-GR2Q12485 440 aa1.77□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J WIP1Q2V2P8 89 aa1.77□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J YMR122W-AQ3E842 84 aa1.77□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL42AP0CX27 106 aaKnown RBP1.76□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL42BP0CX28 106 aaKnown RBP1.76□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J DDR48P18899 430 aaKnown RBP1.76□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J SEC59P20048 519 aa1.76□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J SRP21P32342 167 aa1.76□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J AIM29P36154 155 aa1.76□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J YIL024CP40543 189 aa1.76□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J BNS1P50084 137 aa1.76□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J SDS23P53172 527 aa1.76□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J SNA2P56508 79 aa1.76□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J GPI19Q04082 140 aa1.76□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J GTO3Q04806 366 aa1.76□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J DFM1Q12743 341 aaKnown RBP1.76□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J YNR034W-AQ3E841 98 aa1.76□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL16AP26784 199 aaKnown RBP1.75□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J NTF2P33331 125 aaKnown RBP1.75□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J YBL081WP38180 368 aaKnown RBP1.75□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J YBR013CP38215 129 aa1.75□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J VMA7P39111 118 aa1.75□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J SEC72P39742 193 aaKnown RBP1.75□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J PHS1P40857 217 aa1.75□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J MOG1P47123 218 aa1.75□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J GLO1P50107 326 aa1.75□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J ATG33Q06485 197 aa1.75□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J YDR029WQ12111 104 aa1.75□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J ATP14Q12349 124 aa1.75□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J VMA9Q3E7B6 73 aa1.75□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J YLR307C-AQ3E825 87 aa1.75□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J YPR014CQ6B0W2 109 aa1.75□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J YPL229WQ99395 206 aa1.75□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J Q0142Q9ZZW4 58 aa1.75□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J YPR010C-AA5Z2X5 72 aa1.74□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J ADH2P00331 348 aaKnown RBP1.74□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL23AP0CX41 137 aaKnown RBP1.74□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL23BP0CX42 137 aaKnown RBP1.74□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J LAC1P28496 418 aa1.74□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J SRB6P32570 121 aa1.74□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J YKR032WP36127 104 aa1.74□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J SMP1P38128 452 aa1.74□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J PAU7P39545 55 aa1.74□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J ERG28P40030 148 aa1.74□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J PAU5P43575 122 aa1.74□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J YGR149WP48236 432 aa1.74□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J MMS2P53152 137 aa1.74□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J EOS1P53938 366 aa1.74□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J LCL1Q02786 101 aa1.74□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J ARC18Q05933 178 aaKnown RBP1.74□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J POM33Q12164 279 aa1.74□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J YCL021W-AQ96VH3 125 aa1.74□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J ADH3P07246 375 aaKnown RBP1.73□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J TY1A-LR4P0C2I8 440 aaKnown RBP1.73□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J TY1A-DR6P0CX70 440 aa1.73□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J TY1A-ER1P0CX71 440 aa1.73□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J TY1A-LR2P0CX72 440 aa1.73□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J TY1A-PLP0CX73 440 aa1.73□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J TY1A-JR1P0CX74 440 aa1.73□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J TY1A-LR3P0CX75 440 aa1.73□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J TY1A-ML2P0CX76 440 aa1.73□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J HMRA1P0CY11 126 aa1.73□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J LDS1P31379 325 aa1.73□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J YKR070WP36151 352 aaKnown RBP1.73□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J PET8P38921 284 aa1.73□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J OST3P48439 350 aa1.73□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J UBC12P52491 188 aa1.73□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J FSF1Q12029 327 aaKnown RBP1.73□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J TY1A-GR1Q12085 440 aa1.73□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J TPT1Q12272 230 aaKnown RBP1.73□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J TY1A-PR3Q6Q5H1 440 aaKnown RBP1.73□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J TY1A-OLQ92392 440 aaKnown RBP1.73□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J PRE1P22141 198 aaKnown RBP1.72□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J MRP49P32388 137 aa1.72□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J YKL070WP36087 169 aa1.72□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J HSP10P38910 106 aa1.72□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J PEX22P39718 180 aa1.72□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J YEL008WP40001 126 aa1.72□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J RPC10P40422 70 aa1.72□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J CIN5P40917 295 aa1.72□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J APS2Q00381 147 aa1.72□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J YDR010CQ12426 110 aa1.72□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J YOR008C-AQ3E7B9 74 aa1.72□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J ENV10Q99382 181 aa1.72□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 70 ms