RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HDA3	YPR179C	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	0.3	□□□□□ -2.36
HDA3	YPR179C	HYM1	P32464	399 aa		0.29	□□□□□ -2.36
HDA3	YPR179C	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	0.29	□□□□□ -2.36
HDA3	YPR179C	POR2	P40478	281 aa		0.29	□□□□□ -2.36
HDA3	YPR179C	YDR278C	Q05612	105 aa		0.29	□□□□□ -2.36
HDA3	YPR179C	DNF2	Q12675	1612 aa		0.29	□□□□□ -2.36
HDA3	YPR179C	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	0.28	□□□□□ -2.36
HDA3	YPR179C	SRX1	P36077	127 aa		0.28	□□□□□ -2.36
HDA3	YPR179C	SFT1	P43682	97 aa		0.28	□□□□□ -2.36
HDA3	YPR179C	YJR128W	P47162	119 aa		0.28	□□□□□ -2.36
HDA3	YPR179C	ERV14	P53173	138 aa		0.28	□□□□□ -2.36
HDA3	YPR179C	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		0.28	□□□□□ -2.36
HDA3	YPR179C	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
HDA3	YPR179C	SEC59	P20048	519 aa		0.28	□□□□□ -2.36
HDA3	YPR179C	YGL204C	P53089	101 aa		0.28	□□□□□ -2.36
HDA3	YPR179C	HPA2	Q06592	156 aa		0.28	□□□□□ -2.36
HDA3	YPR179C	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		0.28	□□□□□ -2.36
HDA3	YPR179C	TRM732	Q03496	1420 aa		0.28	□□□□□ -2.37
HDA3	YPR179C	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
HDA3	YPR179C	GAT4	P40569	121 aa		0.27	□□□□□ -2.37
HDA3	YPR179C	TIM8	P57744	87 aa		0.27	□□□□□ -2.37
HDA3	YPR179C	CNL1	Q06333	122 aa		0.27	□□□□□ -2.37
HDA3	YPR179C	PDR15	Q04182	1529 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
HDA3	YPR179C	ULS1	Q08562	1619 aa		0.27	□□□□□ -2.37
HDA3	YPR179C	LTE1	P07866	1435 aa		0.27	□□□□□ -2.37
HDA3	YPR179C	DOP1	Q03921	1698 aa		0.27	□□□□□ -2.37
HDA3	YPR179C	ENV10	Q99382	181 aa		0.26	□□□□□ -2.37
HDA3	YPR179C	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
HDA3	YPR179C	XRN1	P22147	1528 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
HDA3	YPR179C	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
HDA3	YPR179C	ICS3	P47034	131 aa		0.26	□□□□□ -2.37
HDA3	YPR179C	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
HDA3	YPR179C	YJL197C-A	P0C5P0	93 aa		0.25	□□□□□ -2.37
HDA3	YPR179C	YKL044W	P36092	106 aa		0.25	□□□□□ -2.37
HDA3	YPR179C	YGR042W	P53227	271 aa		0.25	□□□□□ -2.37
HDA3	YPR179C	LCL1	Q02786	101 aa		0.25	□□□□□ -2.37
HDA3	YPR179C	OCA6	Q12454	224 aa		0.25	□□□□□ -2.37
HDA3	YPR179C	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		0.25	□□□□□ -2.37
HDA3	YPR179C	THO2	P53552	1597 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
HDA3	YPR179C	YRF1-6	P53819	1859 aa		0.25	□□□□□ -2.37
HDA3	YPR179C	SSK2	P53599	1579 aa		0.25	□□□□□ -2.37
HDA3	YPR179C	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
HDA3	YPR179C	YFR035C	P43608	114 aa		0.25	□□□□□ -2.37
HDA3	YPR179C	YIL014C-A	Q02598	104 aa		0.25	□□□□□ -2.37
HDA3	YPR179C	GPI19	Q04082	140 aa		0.25	□□□□□ -2.37
HDA3	YPR179C	YOR376W-A	Q3E805	51 aa		0.25	□□□□□ -2.37
HDA3	YPR179C	PDR10	P51533	1564 aa		0.24	□□□□□ -2.37
HDA3	YPR179C	AUA1	P32450	94 aa		0.24	□□□□□ -2.37
HDA3	YPR179C	SAE3	P89114	91 aa		0.24	□□□□□ -2.37
HDA3	YPR179C	HIR3	P47171	1648 aa		0.24	□□□□□ -2.37
HDA3	YPR179C	MMS1	Q06211	1407 aa		0.24	□□□□□ -2.37
HDA3	YPR179C	ARL3	Q02804	198 aa		0.23	□□□□□ -2.37
HDA3	YPR179C	YGL041C-B	Q3E750	60 aa		0.23	□□□□□ -2.37
HDA3	YPR179C	HAP1	P0CE41	1502 aa		0.23	□□□□□ -2.37
HDA3	YPR179C	YCF1	P39109	1515 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
HDA3	YPR179C	SSN2	P38931	1420 aa		0.23	□□□□□ -2.37
HDA3	YPR179C	CAT8	P39113	1433 aa		0.23	□□□□□ -2.37
HDA3	YPR179C	BUD4	P47136	1447 aa		0.23	□□□□□ -2.37
HDA3	YPR179C	SNF11	P38956	169 aa		0.23	□□□□□ -2.37
HDA3	YPR179C	RPS29B	P41058	56 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
HDA3	YPR179C	SPP41	P38904	1435 aa		0.23	□□□□□ -2.37
HDA3	YPR179C	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
HDA3	YPR179C	POL1	P13382	1468 aa		0.22	□□□□□ -2.37
HDA3	YPR179C	YRF1-2	P40105	1681 aa		0.22	□□□□□ -2.37
HDA3	YPR179C	DYN2	Q02647	92 aa		0.22	□□□□□ -2.37
HDA3	YPR179C	NKP2	Q06162	153 aa		0.22	□□□□□ -2.37
HDA3	YPR179C	RIM15	P43565	1770 aa		0.22	□□□□□ -2.37
HDA3	YPR179C	CDC25	P04821	1589 aa		0.21	□□□□□ -2.38
HDA3	YPR179C	IML1	P47170	1584 aa		0.21	□□□□□ -2.38
HDA3	YPR179C	CYB5	P40312	120 aa		0.21	□□□□□ -2.38
HDA3	YPR179C	PAU12	P53343	120 aa		0.21	□□□□□ -2.38
HDA3	YPR179C	SPC2	Q04969	178 aa		0.21	□□□□□ -2.38
HDA3	YPR179C	YLR285C-A	Q3E771	56 aa		0.21	□□□□□ -2.38
HDA3	YPR179C	SLO1	Q3E784	85 aa		0.21	□□□□□ -2.38
HDA3	YPR179C	DNF3	Q12674	1656 aa		0.21	□□□□□ -2.38
HDA3	YPR179C	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
HDA3	YPR179C	OST5	Q92316	86 aa		0.21	□□□□□ -2.38
HDA3	YPR179C	NUP192	P47054	1683 aa		0.21	□□□□□ -2.38
HDA3	YPR179C	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
HDA3	YPR179C	BUD3	P25558	1636 aa		0.2	□□□□□ -2.38
HDA3	YPR179C	SMC4	Q12267	1418 aa		0.2	□□□□□ -2.38
HDA3	YPR179C	GCN2	P15442	1659 aa		0.2	□□□□□ -2.38
HDA3	YPR179C	MYO1	P08964	1928 aa		0.2	□□□□□ -2.38
HDA3	YPR179C	MRP49	P32388	137 aa		0.2	□□□□□ -2.38
HDA3	YPR179C	COX23	P38824	151 aa		0.2	□□□□□ -2.38
HDA3	YPR179C	YHR130C	P38834	111 aa		0.2	□□□□□ -2.38
HDA3	YPR179C	YEA6	P39953	335 aa		0.2	□□□□□ -2.38
HDA3	YPR179C	YPL261C	Q08976	102 aa		0.2	□□□□□ -2.38
HDA3	YPR179C	YDR010C	Q12426	110 aa		0.2	□□□□□ -2.38
HDA3	YPR179C	ECM5	Q03214	1411 aa		0.2	□□□□□ -2.38
HDA3	YPR179C	RPO31	P04051	1460 aa		0.2	□□□□□ -2.38
HDA3	YPR179C	YPK9	Q12697	1472 aa		0.2	□□□□□ -2.38
HDA3	YPR179C	USO1	P25386	1790 aa		0.19	□□□□□ -2.38
HDA3	YPR179C	SNQ2	P32568	1501 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
HDA3	YPR179C	ACP1	P32463	125 aa		0.19	□□□□□ -2.38
HDA3	YPR179C	MRPS12	P53732	153 aa		0.19	□□□□□ -2.38
HDA3	YPR179C	RAD50	P12753	1312 aa		0.19	□□□□□ -2.38
HDA3	YPR179C	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
HDA3	YPR179C	TY1B-DR4	Q07793	1604 aa		0.19	□□□□□ -2.38
HDA3	YPR179C	POP7	P38291	140 aa		0.19	□□□□□ -2.38

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