RNA–Protein interactions for RNA: YGR108W

CLB1, Transcript of B-type cyclin involved in cell cycle progression, yeast

Gene CLB1, Length 1,416 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CLB1	YGR108W	YJL213W	P40896	331 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CLB1	YGR108W	YFR057W	P43625	151 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CLB1	YGR108W	YNL092W	P53934	400 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CLB1	YGR108W	YDR209C	Q03480	137 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CLB1	YGR108W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CLB1	YGR108W	YOR304C-A	O14468	76 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLB1	YGR108W	RPL39	P04650	51 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLB1	YGR108W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLB1	YGR108W	NHP2	P32495	156 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CLB1	YGR108W	CMC1	P36064	111 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLB1	YGR108W	ATP23	P53722	227 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLB1	YGR108W	YNR077C	P53758	84 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLB1	YGR108W	GPI19	Q04082	140 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLB1	YGR108W	YPL261C	Q08976	102 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLB1	YGR108W	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CLB1	YGR108W	GPI18	P38211	433 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CLB1	YGR108W	YER076C	P40049	302 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CLB1	YGR108W	GLE2	P40066	365 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CLB1	YGR108W	EOS1	P53938	366 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CLB1	YGR108W	YPL080C	Q02826	108 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CLB1	YGR108W	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CLB1	YGR108W	YPL229W	Q99395	206 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CLB1	YGR108W	COX10	P21592	462 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLB1	YGR108W	DAL80	P26343	269 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLB1	YGR108W	UTH1	P36135	365 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLB1	YGR108W	YHR140W	P38842	239 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLB1	YGR108W	OXA1	P39952	402 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLB1	YGR108W	MGR2	Q02889	113 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLB1	YGR108W	GAT3	Q07928	141 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLB1	YGR108W	DAP1	Q12091	152 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLB1	YGR108W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CLB1	YGR108W	HFA1	P32874	2273 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLB1	YGR108W	HMRA2	P0CY13	119 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLB1	YGR108W	IMP2	P46972	177 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLB1	YGR108W	NRM1	P53718	249 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLB1	YGR108W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CLB1	YGR108W	HPA2	Q06592	156 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLB1	YGR108W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CLB1	YGR108W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLB1	YGR108W	PFY1	P07274	126 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLB1	YGR108W	PHO85	P17157	305 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLB1	YGR108W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CLB1	YGR108W	YKL070W	P36087	169 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLB1	YGR108W	RRT1	P38192	103 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLB1	YGR108W	COX17	Q12287	69 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLB1	YGR108W	AGA1	P32323	725 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLB1	YGR108W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CLB1	YGR108W	YHR130C	P38834	111 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLB1	YGR108W	CTR2	P38865	189 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLB1	YGR108W	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
CLB1	YGR108W	UBC7	Q02159	165 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLB1	YGR108W	IRC23	Q08416	157 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLB1	YGR108W	TIM22	Q12328	207 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLB1	YGR108W	JID1	Q12350	301 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLB1	YGR108W	COA3	Q3E7B2	85 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLB1	YGR108W	RPA12	P32529	125 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CLB1	YGR108W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CLB1	YGR108W	VHS2	P40463	436 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLB1	YGR108W	YIP1	P53039	248 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLB1	YGR108W	YNL234W	P53857	426 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLB1	YGR108W	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CLB1	YGR108W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CLB1	YGR108W	TOA2	P32774	122 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLB1	YGR108W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CLB1	YGR108W	YMR181C	Q03231	154 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLB1	YGR108W	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CLB1	YGR108W	RPS23B	P0CX30	145 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLB1	YGR108W	YER085C	P40058	173 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLB1	YGR108W	YFL051C	P43552	160 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLB1	YGR108W	TOS6	P48560	102 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLB1	YGR108W	AIM34	Q03673	198 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLB1	YGR108W	YOL160W	Q08321	113 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLB1	YGR108W	FCY1	Q12178	158 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLB1	YGR108W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLB1	YGR108W	IGO2	Q9P305	131 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLB1	YGR108W	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CLB1	YGR108W	MID2	P36027	376 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLB1	YGR108W	GLO1	P50107	326 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLB1	YGR108W	AIM11	P87275	137 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLB1	YGR108W	PRM7	Q12459	698 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLB1	YGR108W	DSE2	P38844	325 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLB1	YGR108W	SPI1	P40092	148 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLB1	YGR108W	YNL217W	P40152	326 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLB1	YGR108W	LCB3	P47013	409 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLB1	YGR108W	YGR025W	P53216	100 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLB1	YGR108W	YDL009C	Q12210	107 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLB1	YGR108W	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLB1	YGR108W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLB1	YGR108W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CLB1	YGR108W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CLB1	YGR108W	KRE1	P17260	313 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLB1	YGR108W	MOH1	P38191	138 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLB1	YGR108W	FIP1	P45976	327 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLB1	YGR108W	YIP3	P53633	176 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLB1	YGR108W	SED1	Q01589	338 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLB1	YGR108W	YLR194C	Q05777	254 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLB1	YGR108W	RRG8	Q06109	277 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLB1	YGR108W	UGX2	P32772	223 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLB1	YGR108W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CLB1	YGR108W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68

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