RNA–Protein interactions for RNA: YGL093W

SPC105, Transcript of Subunit of a kinetochore-microtubule binding complex, yeastyeast

Gene SPC105, Length 2,754 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC105YGL093W TY1A-JR2P47099 440 aa3.03□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W YGL118CP53132 145 aa3.03□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W TY1A-DR1Q03856 440 aa3.03□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W TY1A-GR2Q12485 440 aa3.03□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W YPR053CQ6Q5F3 151 aa3.03□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W HUA1P40325 198 aa3.03□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W HAL1Q01766 294 aa3.03□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W ATP16Q12165 160 aa3.03□□□□□ -1.92
SPC105YGL093W TY1A-LR4P0C2I8 440 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W TY1A-DR6P0CX70 440 aa3.02□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W TY1A-ER1P0CX71 440 aa3.02□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W TY1A-LR2P0CX72 440 aa3.02□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W TY1A-PLP0CX73 440 aa3.02□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W TY1A-JR1P0CX74 440 aa3.02□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W TY1A-LR3P0CX75 440 aa3.02□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W TY1A-ML2P0CX76 440 aa3.02□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W TY1A-GR1Q12085 440 aa3.02□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W TY1A-PR3Q6Q5H1 440 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W TY1A-OLQ92392 440 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W PFY1P07274 126 aa3.02□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W NRG2P38082 220 aa3.02□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W YBR013CP38215 129 aa3.02□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W NSE4P43124 402 aa3.02□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W PMP3P87284 55 aa3.02□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W MGR2Q02889 113 aa3.02□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W RDS3Q06835 107 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W ERG27Q12452 347 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W HTL1Q9URQ5 78 aa3.02□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W YCR023CP25351 611 aa3.01□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W SDS23P53172 527 aa3.01□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W MED7Q08278 222 aa3.01□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W FSF1Q12029 327 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W YOL085CQ99345 113 aa3.01□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W UBC5P15732 148 aa3.01□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W KTI12P34253 313 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W KRE9P39005 276 aa3.01□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W YNL217WP40152 326 aa3.01□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W TOS6P48560 102 aa3.01□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W CRC1Q12289 327 aa3.01□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W RPL23AP0CX41 137 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W RPL23BP0CX42 137 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W YKR070WP36151 352 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W YAR029WP39549 74 aa3□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W CGR1P53188 120 aa3□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W CYT2Q00873 224 aa3□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W POR1P04840 283 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W YCR001WP25347 104 aa3□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data3□□□□□ -1.93not detected
SPC105YGL093W PAM17P36147 197 aa3□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W SEC72P39742 193 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W CDC40P40968 455 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W YMR122W-AQ3E842 84 aa3□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W COA6Q3E846 104 aa3□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W ERG28P40030 148 aa3□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W YER076CP40049 302 aa3□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W YCR024C-BQ3E7Z8 88 aa3□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W TRP1P00912 224 aa2.99□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W DCV1P43595 202 aa2.99□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W NUP42P49686 430 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W FCF1Q05498 189 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W DXO1Q06349 442 aa2.99□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W DGA1Q08650 418 aa2.99□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W SAL1D6W196 494 aa2.99□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W YGR017WP53210 297 aa2.99□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W SEC4P07560 215 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W CUE4Q04201 117 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W WIP1Q2V2P8 89 aa2.98□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W URM1P40554 99 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W ERV14P53173 138 aa2.98□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W ATP23P53722 227 aa2.98□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W YDR042CQ03205 200 aa2.97□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W YOR008C-AQ3E7B9 74 aa2.97□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W YKR032WP36127 104 aa2.97□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W RPR2P40571 144 aa2.97□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W GLO1P50107 326 aa2.97□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W CNL1Q06333 122 aa2.97□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W VTS1Q08831 523 aaKnown RBP RIP-Chip data2.97□□□□□ -1.93not detected
SPC105YGL093W YLR050CQ12155 161 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
SPC105YGL093W RTC6O14464 93 aa2.96□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W RPL33AP05744 107 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W RPL27BP0C2H7 136 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W ARC15P40518 154 aaRIP-Chip data2.96□□□□□ -1.94not detected
SPC105YGL093W RPL33BP41056 107 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W PKR1Q03880 122 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W SDH8P38345 138 aa2.96□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W AQY1P0CD91 305 aa2.95□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W YJL028WP47062 111 aa2.95□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W YJR146WP47174 117 aa2.95□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W ARL3Q02804 198 aa2.95□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W MRPL33P20084 86 aa2.95□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W PCL2P25693 308 aa2.95□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W YIL014C-AQ02598 104 aa2.95□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W DPP1Q05521 289 aa2.95□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W GSP1P32835 219 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W GSP2P32836 220 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W PAU16P35994 123 aa2.95□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W PET8P38921 284 aa2.95□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W TIM11P81449 96 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W YNL200CP40165 246 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
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