RNA–Protein interactions for RNA: YDR247W

VHS1, Transcript of Cytoplasmic serine/threonine protein kinase, yeast

Gene VHS1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VHS1	YDR247W	YNL198C	P40166	100 aa		4.31	□□□□□ -1.72
VHS1	YDR247W	YFR045W	P43617	309 aa		4.31	□□□□□ -1.72
VHS1	YDR247W	YDR209C	Q03480	137 aa		4.31	□□□□□ -1.72
VHS1	YDR247W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	4.31	□□□□□ -1.72
VHS1	YDR247W	ATG39	Q06159	398 aa		4.31	□□□□□ -1.72
VHS1	YDR247W	CSF1	Q12150	2958 aa		4.3	□□□□□ -1.72
VHS1	YDR247W	SFT2	P38166	215 aa		4.3	□□□□□ -1.72
VHS1	YDR247W	YIL012W	P40551	113 aa		4.3	□□□□□ -1.72
VHS1	YDR247W	YPI1	P43587	155 aa		4.3	□□□□□ -1.72
VHS1	YDR247W	SIP18	P50263	79 aa		4.3	□□□□□ -1.72
VHS1	YDR247W	YGR018C	P53211	109 aa		4.3	□□□□□ -1.72
VHS1	YDR247W	NRM1	P53718	249 aa		4.3	□□□□□ -1.72
VHS1	YDR247W	YML079W	Q03629	201 aa		4.3	□□□□□ -1.72
VHS1	YDR247W	YBL071C	P38185	102 aa		4.29	□□□□□ -1.72
VHS1	YDR247W	YHL044W	P38727	235 aa		4.29	□□□□□ -1.72
VHS1	YDR247W	PIR5	P46999	287 aa		4.29	□□□□□ -1.72
VHS1	YDR247W	YJL118W	P47022	219 aa		4.29	□□□□□ -1.72
VHS1	YDR247W	SLO1	Q3E784	85 aa		4.29	□□□□□ -1.72
VHS1	YDR247W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		4.29	□□□□□ -1.72
VHS1	YDR247W	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
VHS1	YDR247W	DAD4	P69851	72 aa		4.28	□□□□□ -1.72
VHS1	YDR247W	YIL102C-A	Q2V2P5	75 aa		4.28	□□□□□ -1.72
VHS1	YDR247W	LST8	P41318	303 aa		4.27	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		4.27	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	SDH7	Q04401	133 aa		4.27	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	GTO3	Q04806	366 aa		4.27	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	YOR029W	Q12243	111 aa		4.27	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	YCR023C	P25351	611 aa		4.27	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	APS1	P35181	156 aa		4.27	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	PET8	P38921	284 aa		4.27	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	YMR141C	P40211	102 aa		4.27	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	HST4	P53688	370 aa		4.27	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	YPL080C	Q02826	108 aa		4.27	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	DAD1	Q12248	94 aa		4.27	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		4.27	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	RPL39	P04650	51 aa		4.26	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	CPT1	P17898	393 aa		4.26	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	DAL82	P21705	255 aa		4.26	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	YKL044W	P36092	106 aa		4.26	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	OXA1	P39952	402 aa		4.26	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	YDR042C	Q03205	200 aa		4.26	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	SCW10	Q04951	389 aa		4.26	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	HFA1	P32874	2273 aa		4.25	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	YHR213W	P0CI67	198 aa		4.25	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	YKR045C	P36138	183 aa		4.25	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	ECM14	P38836	430 aa		4.25	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	RPS23B	P0CX30	145 aa		4.24	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	YKR032W	P36127	104 aa		4.24	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	SUR7	P54003	302 aa		4.24	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	YLR296W	Q05898	108 aa		4.24	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	DGA1	Q08650	418 aa		4.24	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	IRA2	P19158	3079 aa		4.23	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	RRT1	P38192	103 aa		4.23	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	YPL073C	P40323	161 aa		4.23	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	ELC1	Q03071	99 aa		4.23	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	MIX17	Q03667	156 aa		4.23	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	GPI19	Q04082	140 aa		4.23	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	YMR103C	Q04436	120 aa		4.23	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	YBR220C	P38318	560 aa		4.22	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	SNF11	P38956	169 aa		4.22	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	MIG3	P39943	394 aa		4.22	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	IMP2	P46972	177 aa		4.22	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		4.22	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		4.22	□□□□□ -1.73
VHS1	YDR247W	CTR2	P38865	189 aa		4.21	□□□□□ -1.74
VHS1	YDR247W	GLE2	P40066	365 aa		4.21	□□□□□ -1.74
VHS1	YDR247W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
VHS1	YDR247W	GPI18	P38211	433 aa		4.2	□□□□□ -1.74
VHS1	YDR247W	YHR140W	P38842	239 aa		4.2	□□□□□ -1.74
VHS1	YDR247W	YER076C	P40049	302 aa		4.2	□□□□□ -1.74
VHS1	YDR247W	YFL051C	P43552	160 aa		4.2	□□□□□ -1.74
VHS1	YDR247W	MGR2	Q02889	113 aa		4.2	□□□□□ -1.74
VHS1	YDR247W	PFY1	P07274	126 aa		4.19	□□□□□ -1.74
VHS1	YDR247W	YKR041W	P36134	250 aa		4.19	□□□□□ -1.74
VHS1	YDR247W	PEX22	P39718	180 aa		4.19	□□□□□ -1.74
VHS1	YDR247W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
VHS1	YDR247W	YER181C	P40097	107 aa		4.19	□□□□□ -1.74
VHS1	YDR247W	SED1	Q01589	338 aa		4.19	□□□□□ -1.74
VHS1	YDR247W	IRC23	Q08416	157 aa		4.19	□□□□□ -1.74
VHS1	YDR247W	MSA1	Q08471	629 aa		4.19	□□□□□ -1.74
VHS1	YDR247W	PRM3	Q08931	133 aa		4.19	□□□□□ -1.74
VHS1	YDR247W	TIM22	Q12328	207 aa		4.19	□□□□□ -1.74
VHS1	YDR247W	SPS100	P13130	326 aa		4.18	□□□□□ -1.74
VHS1	YDR247W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
VHS1	YDR247W	DIA1	P54005	336 aa		4.18	□□□□□ -1.74
VHS1	YDR247W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
VHS1	YDR247W	YPL261C	Q08976	102 aa		4.18	□□□□□ -1.74
VHS1	YDR247W	HMRA2	P0CY13	119 aa		4.17	□□□□□ -1.74

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