RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	NLRP12	P59046	1061 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	STARD6	P59095	220 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	DLG4	P78352	724 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	CYP4F8	P98187	520 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	ADSSL1	Q8N142	457 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	C8orf48	Q96LL4	319 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	NACA2	Q9H009	215 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	ATP2C2	O75185	946 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC192	P0DO97	292 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	VIPR2	P41587	438 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	NR1H3	Q13133	447 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	PAK1	Q13153	545 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	ISM2	Q6H9L7	571 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	VIT	Q6UXI7	678 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	GAREM2	Q75VX8	874 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	MON1A	Q86VX9	555 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	NUP93	Q8N1F7	819 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	SPATA20	Q8TB22	786 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	NELFB	Q8WX92	580 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	MYRFL	Q96LU7	910 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	LRRC3	Q9BY71	257 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	TDP1	Q9NUW8	608 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	COMMD8	Q9NX08	183 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	RAB20	Q9NX57	234 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	KRBA1	A5PL33	1030 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM170B	A6NMN3	283 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246		F8VP50	259 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	MOSPD3	O75425	235 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM200B	P0CF97	657 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	HDC	P19113	662 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	YWHAQ	P27348	245 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	GPR15	P49685	360 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	NDST1	P52848	882 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	CDH8	P55286	799 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	LRRC32	Q14392	662 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	ACOT1	Q86TX2	421 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	12.04	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	TTC16	Q8NEE8	873 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	PJA1	Q8NG27	643 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM3C	Q92520	227 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	PKMYT1	Q99640	499 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	IER2	Q9BTL4	223 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	NOTCH4	Q99466	2003 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	BIN1	O00499	593 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	AP1G2	O75843	785 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	VNN1	O95497	513 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	F11	P03951	625 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	CD58	P19256	250 aa		12.03	□□□□□ -0.48

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